應用CS-SELEX技術篩選特異性結(jié)合丙型肝炎病毒非結(jié)構(gòu)蛋白NS4B適配子的研究
本文關鍵詞:應用CS-SELEX技術篩選特異性結(jié)合丙型肝炎病毒非結(jié)構(gòu)蛋白NS4B適配子的研究
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【摘要】:目的應用CS-SELEX(cell surface-system evolution of ligands by exponential enrichment)技術篩選與丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)非結(jié)構(gòu)蛋白4B(non protein 4B,NS4B)特異性結(jié)合的ssDNA適配子,建立檢測HCV NS4B的酶聯(lián)寡聚核苷酸吸附試驗(enzyme-linked oligonucleotide assay,ELONA)方法。方法構(gòu)建pDisplay-NS4B質(zhì)粒,并轉(zhuǎn)染至HepG2細胞中,在G418存在情況下連續(xù)篩選1個月,得到單克隆細胞群,經(jīng)過Western blot以及流式細胞術驗證,獲得穩(wěn)定表達NS4B的HepG2細胞。設計并合成隨機序列ssDNA文庫,以穩(wěn)定表達NS4B的細胞為正向篩選靶細胞,以HepG2細胞為反篩細胞進行CS-SELEX技術篩選。每輪篩選獲得的具有結(jié)合NS4B能力的ssDNA適配子,通過PCR擴增得到富集,隨后通過不對稱PCR獲得下一輪篩選的ssDNA文庫。經(jīng)過16輪篩選,將親和力最高的篩選產(chǎn)物克隆并測序,用ELONA方法檢測適配子的親和力。結(jié)果成功構(gòu)建表面展示表達重組質(zhì)粒pDisplay-NS4B。分別將該質(zhì)粒轉(zhuǎn)入HepG2細胞,通過G418篩選獲得穩(wěn)定表達HCV-NS4B的細胞系NS4B-HepG2。對CS-SELEX篩選的各輪適配子庫進行親和力測定,其中第14輪庫適配子與NS4B的親合力最高。分別對第14輪庫中的單個適配子進行親和力測定,以適配子ZN1和ZN5與NS4B的親合力最高。ZN1和ZN5不僅能結(jié)合展示在細胞表面的NS4B蛋白,還能結(jié)合丙型肝炎病毒感染細胞(HCV cell culture,HCVcc)中的HCV-NS4B蛋白。結(jié)論適配子ZN1和ZN5對NS4B有高親和力,這對研究HCV-NS4B致癌機制、HCV診斷以及治療方面有潛在的應用價值。
【作者單位】: 武漢大學基礎醫(yī)學院免疫學系病毒學國家重點實驗室湖北省過敏及免疫相關疾病重點實驗室;
【基金】:國家重大傳染病專項(No.2012ZX10003002-015) 國家自然科學基金項目(No.31221061,31270176,81471910和31370197) 國家杰出青年基金項目(No.81025008)
【分類號】:R373.21
【正文快照】: ***據(jù)世界衛(wèi)生組織(WHO)統(tǒng)計,全球約有3%,即1.7億~2.0億人感染丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)[1]。我國是HCV高感染率國家之一。HCV感染后,機體免疫系統(tǒng)往往不能將其清除,約80%的HCV感染者常發(fā)展成為慢性肝炎,其中有10%~***30%的患者發(fā)展為肝硬化、1%~5%發(fā)展為晚期肝癌(
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,本文編號:1289782
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