輸入性甲型H1N1流感病毒M、NP、PB1基因進(jìn)化特征
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【摘要】:目的分析口岸輸入性甲型H1N1流感病毒的M、NP和PB1基因進(jìn)化特征,及時(shí)發(fā)現(xiàn)變異株。方法對(duì)廣東口岸2009-2011年檢測(cè)的甲型H1N1流感陽性病例進(jìn)行M、NP和PB1基因的RT-PCR擴(kuò)增和核苷酸序列測(cè)定。以2009年甲型H1N1流感代表株A/California/04/2009/H1N1的M、NP和PB1基因作為參考序列,分析輸入性病例的系統(tǒng)進(jìn)化樹、核苷酸及氨基酸序列同源性和變異位點(diǎn)。結(jié)果 M基因系統(tǒng)進(jìn)化樹分為4個(gè)分支,2009年病毒與2010年病毒主要分布在第Ⅰ分支,2011年檢出的多數(shù)病毒聚集于第Ⅳ分支。同源性結(jié)果顯示M基因高度保守,僅有5個(gè)核苷酸位點(diǎn)發(fā)生顯著變異,對(duì)應(yīng)的蛋白序列僅在氨基酸V80I位點(diǎn)出現(xiàn)突變。所有病毒NP蛋白均出現(xiàn)V100I突變,同時(shí)零星出現(xiàn)K452R突變。PB1蛋白氨基酸序列在G154D、I397M和I435T等位點(diǎn)發(fā)生較明顯突變。結(jié)論 2009-2011年輸入性甲型H1N1流感病毒M、NP、PB1基因已發(fā)生一定程度的變異,對(duì)口岸和國內(nèi)流感防控提供了重要的理論依據(jù)。
【作者單位】: 廣東出入境檢驗(yàn)檢疫局檢驗(yàn)檢疫技術(shù)中心衛(wèi)生檢疫實(shí)驗(yàn)室;廣州市黃埔區(qū)食品藥品監(jiān)督管理局食品安全協(xié)調(diào)科;
【關(guān)鍵詞】: 流感病毒A型 HN亞型 M基因 NP基因
【基金】:廣東局科技計(jì)劃項(xiàng)目(2011GDK08) 呼吸疾病國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室開放課題
【分類號(hào)】:R373.13
【正文快照】: (Chin J Dis Control Prev 2015,19(5):488-491)2009年4月爆發(fā)的甲型H1N1流感是21世紀(jì)人類經(jīng)歷的第1次新型流感大流行[1]。據(jù)WHO統(tǒng)計(jì),截止2010年8月,該次流感大流行基本結(jié)束,疫情蔓延至全球214個(gè)國家和地區(qū),其中死亡病例為18 398例[2]。新型甲型H1N1流感病毒是1種4源重組的甲
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