目的：運(yùn)用MouseRef-8v2.0Expression BeadChip （Illumina）芯片,對(duì)pCAGGS-HA-K141NHSPB8轉(zhuǎn)基因小鼠、CAGGS-HA-wtHSPB8轉(zhuǎn)基因小鼠和正常C57BL小鼠的坐骨神經(jīng)組織在不同時(shí)期（3月齡,6月齡和18月齡）的基因表達(dá)進(jìn)行對(duì)比分析,通過生物信息學(xué)分析篩選差異表達(dá)基因,并對(duì)其中差異較大的基因,采用熒光定量RT-PCR進(jìn)行mRNA水平的表達(dá)驗(yàn)證,以期明確K141NHSPB8突變?cè)贑MT2L病程不同時(shí)期（發(fā)病前、發(fā)病時(shí)和發(fā)病后期）受調(diào)控基因表達(dá)譜的變化和可能的內(nèi)在分子通路,探討K141NHSPB8突變?cè)贑MT2L的可能發(fā)病機(jī)制。方法：1. pCAGGS-HA-wtHSPB8和pCAGGS-HA-K141N HSPB8的轉(zhuǎn)基因小鼠已經(jīng)在前期工作中構(gòu)建和鑒定成功。以月齡為3個(gè)月（發(fā)病前）、6個(gè)月（發(fā)病時(shí)）、18個(gè)月（病程后期）的pCAGGS-HA-K141NHSPB8轉(zhuǎn)基因小鼠為研究對(duì)象,以月齡匹配的pCAGGS-HA-wtHSPB8轉(zhuǎn)基因小鼠、C57BL小鼠為對(duì)比。2.運(yùn)用全基因組表達(dá)芯片技術(shù)篩選差異表達(dá)的基因：提取3月齡、6月齡... 

【文章來(lái)源】：中南大學(xué)湖南省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】：60 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
縮略詞簡(jiǎn)表
1 前言
2 材料與方法
    2.1 主要儀器及試劑
        2.1.1 基因芯片主要儀器及試劑
        2.1.2 熒光定量RT-PCR主要儀器及試劑
    2.2 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物來(lái)源及分組
        2.2.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物來(lái)源
        2.2.2 動(dòng)物實(shí)驗(yàn)分組
    2.3 實(shí)驗(yàn)步驟
        2.3.1 小鼠坐骨神經(jīng)組織標(biāo)本采集
        2.3.2 小鼠坐骨神經(jīng)組織RNA提取
    2.4 基因芯片分析流程
        2.4.1 RNA純化
        2.4.2 RNA質(zhì)量檢測(cè)
        2.4.3 RNA擴(kuò)增
        2.4.4 Total RNA的去磷酸化、標(biāo)記和雜交
        2.4.5 芯片清洗及掃描
    2.5 實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR實(shí)驗(yàn)流程
        2.5.1 小鼠坐骨神1經(jīng)組織RNA提取(同2.3.2)
        2.5.2 反轉(zhuǎn)錄
        2.5.3 syber green實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)myh4,fbp2,pck1,pgam2,ppp1r3c,rbp4,neb,mfn2,hspb1,nefl,rab7的表達(dá)
        2.5.4 引物設(shè)計(jì)
        2.5.5 熒光定量PCR檢測(cè)
    2.6 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理
        2.6.1 基因芯片的數(shù)據(jù)提取及分析
        2.6.2 qRT-PCR數(shù)據(jù)提取及分析
3 結(jié)果
    3.1 RNA提取結(jié)果(如下表3-1)
    3.2 篩選差異基因
        3.2.1 差異基因蛋白相關(guān)聚類
        3.2.2 差異基因功能相關(guān)聚類
    3.3 qRT-PCR實(shí)驗(yàn)結(jié)果
        3.3.1 擴(kuò)增曲線和溶解曲線如下
    3.4 real time RT-PCR實(shí)驗(yàn)結(jié)果
4 討論
    4.1 CMT2與CMT2L轉(zhuǎn)基因小鼠
    4.2 基因芯片技術(shù)與實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)對(duì)本研究的意義
    4.3 差異基因的結(jié)構(gòu)及功能分析
    4.4 差異基因陽(yáng)性結(jié)果分析
    4.5 CMT2L與CMT2相關(guān)致病基因的關(guān)系
5 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
綜述
    參考文獻(xiàn)
致謝
攻讀學(xué)位期間主要研究成果


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]基于脈象Hilbert-Huang變換和樣本熵的動(dòng)脈硬化癥檢測(cè)研究[J]. 楊成,王學(xué)民,孫濤,郁洪強(qiáng),李想,周鵬.  生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)雜志. 2012(06)
[2]軸突型腓骨肌萎縮癥2L型致病基因HSPB8突變導(dǎo)致細(xì)胞內(nèi)聚集物形成的機(jī)理研究[J]. 張如旭,唐北沙,資曉宏,夏昆,潘乾,張付峰,李書劍,趙國(guó)華,郭科.  中華醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)雜志. 2006(06)
[3]中國(guó)人腓骨肌萎縮癥小熱休克蛋白27基因突變分析[J]. 劉小民,唐北沙,趙國(guó)華,夏昆,張付峰,潘乾,蔡芳,胡正茂,張成,陳彪,沈璐,張如旭,江泓.  中華醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)雜志. 2005(05)



本文編號(hào)：3504259