基于生物信息學分析癲癇腦內星形膠質細胞炎性激活機制
發(fā)布時間:2021-08-20 17:35
目的挖掘癲癇腦內星形膠質細胞異常炎性激活的關鍵信號分子,為進一步闡明神經免疫促癇機理提供生物信息學基礎。方法 NCBI GEO數據庫獲取癲癇動物模型(GSE73878)和星形膠質細胞炎性激活細胞模型(GSE73022)基因芯片結果,GEO2R在線篩選共有差異表達基因(DEGs),DAVID數據庫進行GO功能模塊和KEGG通路富集分析,STRING數據庫和Cytoscape軟件構建DEGs蛋白質互作網絡,多算法篩選Hub基因,最后利用GEPIA數據庫在易發(fā)癲癇的低級別膠質瘤患者中驗證。結果兩芯片交集共獲得72個DEGs,主要富集在調控免疫反應、細胞因子活力等過程,病毒感染類似信號、Toll樣受體信號等通路;59個基因可構成大的蛋白互作網絡,其中24個基因組成核心模塊,多算法篩選結合GEIPA數據庫發(fā)現Gbp3、Ifit3、Irf7、Stat1是Hub基因。結論癲癇腦內星形膠質細胞異常炎性激活與Gbp3、Ifit3、Irf7、Stat1等基因關系密切,其可能是調控癲癇腦內神經免疫促癇過程的新靶點。
【文章來源】:現代預防醫(yī)學. 2020,47(23)北大核心
【文章頁數】:5 頁
【部分圖文】:
共有DEGs篩選
GO和KEGG富集分析
PPI network分析
【參考文獻】:
期刊論文
[1]血清基質金屬蛋白酶-9、腫瘤壞死因子-α、γ干擾素水平與癲癇患兒腦電圖的相關性分析[J]. 聶荔,李巷,談慶華,王浩. 中國醫(yī)學前沿雜志(電子版). 2020(03)
[2]惡性肺結節(jié)差異表達基因的生物信息學分析[J]. 滿君,張曉梅,宋龍飛. 現代預防醫(yī)學. 2020(03)
[3]微信平臺在癲癇術后患者延續(xù)護理中的應用[J]. 馬海萍,涂惠,顧蕊欣,胡小燕,盧明巍,艾瓊瓊,張超. 現代預防醫(yī)學. 2018(05)
[4]癲癇患者血清白細胞介素-1β及腫瘤壞死因子-α表達及其與腦電圖的關系[J]. 鄭艷,陳嵐,余倩. 中國老年學雜志. 2017(05)
[5]外源性神經節(jié)苷脂聯合靈芝三萜化合物對癲癇腦損傷神經保護作用[J]. 趙爽,蔣利和,王居平,盧露碧,朱名毅,蒙山,高潔,張勝昌. 現代預防醫(yī)學. 2017(04)
博士論文
[1]星形膠質細胞在免疫刺激誘發(fā)的幼年小鼠癲癇發(fā)作易感中的作用及機制[D]. 秦花萍.浙江大學 2016
本文編號:3353929
【文章來源】:現代預防醫(yī)學. 2020,47(23)北大核心
【文章頁數】:5 頁
【部分圖文】:
共有DEGs篩選
GO和KEGG富集分析
PPI network分析
【參考文獻】:
期刊論文
[1]血清基質金屬蛋白酶-9、腫瘤壞死因子-α、γ干擾素水平與癲癇患兒腦電圖的相關性分析[J]. 聶荔,李巷,談慶華,王浩. 中國醫(yī)學前沿雜志(電子版). 2020(03)
[2]惡性肺結節(jié)差異表達基因的生物信息學分析[J]. 滿君,張曉梅,宋龍飛. 現代預防醫(yī)學. 2020(03)
[3]微信平臺在癲癇術后患者延續(xù)護理中的應用[J]. 馬海萍,涂惠,顧蕊欣,胡小燕,盧明巍,艾瓊瓊,張超. 現代預防醫(yī)學. 2018(05)
[4]癲癇患者血清白細胞介素-1β及腫瘤壞死因子-α表達及其與腦電圖的關系[J]. 鄭艷,陳嵐,余倩. 中國老年學雜志. 2017(05)
[5]外源性神經節(jié)苷脂聯合靈芝三萜化合物對癲癇腦損傷神經保護作用[J]. 趙爽,蔣利和,王居平,盧露碧,朱名毅,蒙山,高潔,張勝昌. 現代預防醫(yī)學. 2017(04)
博士論文
[1]星形膠質細胞在免疫刺激誘發(fā)的幼年小鼠癲癇發(fā)作易感中的作用及機制[D]. 秦花萍.浙江大學 2016
本文編號:3353929
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