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MAGOH在膠質(zhì)瘤組織中的表達及其臨床意義

發(fā)布時間:2021-07-16 17:44
  目的:探討在不同級別膠質(zhì)瘤臨床標本中mago-nashi同源基因(MAGOH)的表達量之間的關系及其與患者治療預后的相關性分析,期待本研究結果能為膠質(zhì)瘤患者的診療提供相關理論依據(jù)。方法:在CGGA mRNAseq FPKM數(shù)據(jù)庫和CGGAmRNA microarray數(shù)據(jù)庫中運用R語言進行數(shù)據(jù)挖掘MAGOH的相關生物學信息,并對不同級別膠質(zhì)瘤組織中MAGOH的表達數(shù)據(jù)進行分析。通過Real-time-PCR(qPCR)技術檢測包含48例病理診斷為不同級別膠質(zhì)瘤臨床標本和10例正常腦組織標本中MAGOH的表達水平,針對MAGOH在不同標本中的表達水平分析其表達差異性,并就此差異性對其與膠質(zhì)瘤的病理分級及其治療預后作出相關性分析。結果:在CGGA mRNAseq FPKM數(shù)據(jù)庫和CGGAmRNA microarray數(shù)據(jù)庫中:MAGOH的表達量隨膠質(zhì)瘤組織WHO分級的增高而上調(diào),即膠質(zhì)瘤組織的WHO分級與MAGOH的表達量呈正相關,且MAGOH的表達量越高,其治療預后越差。qPCR實驗也證實了MAGOH在不同級別臨床膠質(zhì)瘤標本中的表達存在差異性,即隨膠質(zhì)瘤組織病理分級的增高,MAGOH的表... 

【文章來源】:皖南醫(yī)學院安徽省

【文章頁數(shù)】:48 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

MAGOH在膠質(zhì)瘤組織中的表達及其臨床意義


MAGOH的表達水平與IDH1和TP53突變之間的關系

相關性分析,數(shù)據(jù)庫,膠質(zhì)


皖南醫(yī)學院碩士學位論文13獨立的生物標志物來預判膠質(zhì)瘤放化療療效【11~12】。因此,為了明確膠質(zhì)瘤患者MAGOH與MGMT表達水平之間的關系,通過利用CGGA數(shù)據(jù)庫中所提供的數(shù)據(jù),本研究對二者做了共表達分析。結果發(fā)現(xiàn)在CGGA數(shù)據(jù)庫中,MAGOH的表達量隨MGMT表達量的增高而出現(xiàn)逐漸增高趨勢,即MAGOH的表達水平與MGMT的表達表現(xiàn)出明顯的正相關關系(皮爾森相關系數(shù)=0.440,p<0.01)(圖2)。圖2CGGA數(shù)據(jù)庫中MAGOH與MGMT表達水平的相關性分析(此圖引自本人以第一作者身份發(fā)表在右江民族醫(yī)學院學報2019年第四期期刊:MAGOH在膠質(zhì)瘤組織中的表達及其臨床意義)3.在CGGAmRNAseqFPKM公共數(shù)據(jù)庫中,膠質(zhì)瘤患者MAGOH的表達水平與其WHO分級呈現(xiàn)出正相關。我們分別對CGGAmRNAseqFPKM數(shù)據(jù)庫和CGGAmRNAmicroarray庫中膠質(zhì)瘤患者MAGOH表達水平與其WHO分級之間的關系做了分析。結果顯示,MAGOH的表達水平在CGGAmRNAseqFPKM數(shù)據(jù)庫中的膠質(zhì)瘤患者中表現(xiàn)出明顯的差異性,且伴隨著膠質(zhì)瘤級別的增高,MAGOH表達量亦出現(xiàn)遞增趨勢,即膠質(zhì)瘤患者MAGOH的表達水平與其WHO分級呈正相關(圖3A),p<0.001,差異具有統(tǒng)計學意義。在CGGAmRNAmicroarray數(shù)據(jù)庫中不同級別膠質(zhì)瘤患者MAGOH的表達數(shù)據(jù)雖然呈現(xiàn)出差異性,但與腫瘤的WHO分級并未表現(xiàn)出明顯相關性。結果顯示MAGOH表達量在WHOIV級與WHOⅢ級膠質(zhì)瘤中皆高于WHOII級,但WHOIV級中MAGOH表達量較WHOⅢ級中MAGOH表達量略低(圖3B)。因此,為了進一步明確膠質(zhì)瘤的WHO分級與其MAGOH的表達水平之間的關系,探討膠質(zhì)瘤組織中MAGOH表達的臨床意義,我們設計了

膠質(zhì)


皖南醫(yī)學院碩士學位論文14qPCR實驗進行驗證。圖3MAGOH的表達水平與膠質(zhì)瘤WHO分級的關系注:(A):在CGGAmRNAseqFPKM數(shù)據(jù)中膠質(zhì)瘤患者MAGOH的表達水平與其WHO分級之間的關系;(B):在CGGAmRNAmicroarray數(shù)據(jù)中膠質(zhì)瘤患者MAGOH的表達水平與其WHO分級之間的關系。***表示p<0.001。(此圖引自本人以第一作者身份發(fā)表在右江民族醫(yī)學院學報2019年第四期期刊:MAGOH在膠質(zhì)瘤組織中的表達及其臨床意義)4.MAGOH在膠質(zhì)瘤樣本組織中的表達水平增高,與膠質(zhì)瘤組織WHO分級呈正相關。在CGGA中的兩個數(shù)據(jù)庫中,膠質(zhì)瘤組織中MAGOH的表達水平都表現(xiàn)出顯著上調(diào)趨勢。為了進一步探究膠質(zhì)瘤組織中MAGOH的表達量與WHO分級之間的關系,我們通過使用qRT-PCR技術檢測正常腦組織組與不同WHO分級臨床腦膠質(zhì)瘤標本中MAGOH的表達量。結果顯示MAGOH的表達量在正常腦組織組中最低;在3組臨床腦膠質(zhì)瘤樣本中,MAGOH的表達量隨腫瘤樣本W(wǎng)HO分級的增高而呈現(xiàn)出遞增趨勢,即在腦膠質(zhì)瘤組織中MAGOH的表達水平與腫瘤WHO分級呈現(xiàn)顯著正相關(圖4),p<0.001,差異具有統(tǒng)計學意義。這一結果與CGGAmRNAseqFPKM數(shù)據(jù)中MAGOH表達量與膠質(zhì)瘤WHO分級呈正相關結果相符。

【參考文獻】:
期刊論文
[1]MAGOH在膠質(zhì)瘤組織中的表達及其臨床意義[J]. 劉杰,張德龍,毛捷,夏大勇,徐善水.  右江民族醫(yī)學院學報. 2019(04)



本文編號:3287465

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