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基于影像組學(xué)的腦膠質(zhì)瘤分級預(yù)測研究

發(fā)布時間:2020-08-14 13:20
【摘要】:腦膠質(zhì)瘤是最常見的中樞神經(jīng)系統(tǒng)惡性腫瘤,根據(jù)腫瘤良惡性程度,可以分為高級別腦膠質(zhì)瘤和低級別腦膠質(zhì)瘤。近年來,基因?qū)用娴难芯恳呀?jīng)被證實(shí)在腦膠質(zhì)瘤預(yù)測和預(yù)后上具有很大的價(jià)值。但是僅僅基于分子層面對腦膠質(zhì)瘤進(jìn)行分級研究是不完整的。因此對腦膠質(zhì)瘤在組織層面進(jìn)行準(zhǔn)確分級是進(jìn)行分子診斷的基礎(chǔ),在腦膠質(zhì)瘤患者臨床診斷治療上起著重要的作用。目前,臨床上使用手術(shù)或活檢的方法對腫瘤進(jìn)行化驗(yàn)分級。但是這種方法由于手術(shù)侵入性和腫瘤的異質(zhì)性使得它具有很大的局限性。作為一種無創(chuàng)性工具,磁共振成像(MR)在膠質(zhì)瘤診斷中起著重要作用。大部分關(guān)于腦膠質(zhì)瘤MR圖像的研究都是針對單模態(tài),或者是重點(diǎn)研究MR圖像的一階特征,如平均值和最大、小值等統(tǒng)計(jì)學(xué)特征,并不能完整的表示腫瘤的表型信息;谶@種現(xiàn)狀,本文使用2015年BRATS提供的腦膠質(zhì)瘤MR圖像樣本集,高通量的從多模態(tài)腦膠質(zhì)瘤MR圖像中提取影像組學(xué)特征,使用支持向量機(jī)-遞歸消除法對特征進(jìn)行選擇,獲得能夠表示腦膠質(zhì)瘤表象特征的最優(yōu)特征子集,然后使用XgBoost算法訓(xùn)練分類器,作為對比本文也使用ERT和SVM兩種方法進(jìn)行分類訓(xùn)練。本文從腦膠質(zhì)瘤四個模態(tài)MR圖像中,總共提取了 420個影像組學(xué)特征。這些特征數(shù)據(jù)量龐大,具有很多無關(guān)特征和噪聲,無法直接用于分類器訓(xùn)練研究。所以需要先進(jìn)行特征選擇,本文在特征選擇環(huán)節(jié)使用的是支持向量機(jī)-遞歸消除法,整個過程中使用5-折交叉驗(yàn)證方法,對樣本總集進(jìn)行五次特征選擇,獲得五個最優(yōu)特征子集,將這些特征子集中共同包含的特征作為特征選擇的結(jié)果。可以發(fā)現(xiàn)多數(shù)的紋理特征和T1c模態(tài)中的特征被選擇出來,說明紋理特征和T1c模態(tài)圖像在高、低級別腦膠質(zhì)瘤的分類中起到很重要的作用。這點(diǎn)研究發(fā)現(xiàn)和目前比較先進(jìn)的國內(nèi)外研究結(jié)論一致。本文最后使用XgBoost算法訓(xùn)練分類器,對樣本集使用5-折交叉驗(yàn)證來評價(jià)分類器性能,同時使用ERT和SVM兩種算法訓(xùn)練分類器作為對比,研究實(shí)驗(yàn)顯示,XgBoost分類器的精度、查準(zhǔn)率、查全率和F1分別為:91.25%、91.63%、91.25%和91.06%,均高于ERT和SVM兩個分類器。這點(diǎn)也說明本文中采用XgBoost算法在本次良惡性腫瘤分級預(yù)測研究上具有很大的優(yōu)越性。本文設(shè)計(jì)的分類訓(xùn)練器具有較高的精度,可以用于協(xié)助醫(yī)生診斷腦膠質(zhì)瘤的良惡性,是進(jìn)一步分子診斷的基礎(chǔ)。
【學(xué)位授予單位】:山東大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號】:R739.41
【圖文】:

歸一化,概率值,正則化,灰度值


0邐12邐3逡逑1邐02210邐41邐10200邐22邐2邐0邐0邐3邐(T)邐13邐3邐0邐0邐0邐1邐0(b)GLCM邐(c)圖2-1邋GLCM示例逡逑出現(xiàn)的頻率,本文將GLCM進(jìn)行歸一化。表示列數(shù),N表示灰度值范圍,?(/,_/)表概率值。逡逑GLCM正則化后的GLCM如下圖2-20.66邋0.083邋0.042邐0逡逑

特征提取,碩士學(xué)位論文,示例,環(huán)節(jié)


山東大學(xué)碩士學(xué)位論文逡逑似的,可以畫出如圖2-3邋(a)表示的圖像,在方向分別為:(丨,1)邋,邐(0,1)和逡逑(-1,1)的邋GLRLM,分別如圖邋2-3邋(c),邋(d)和(e)所示。逡逑Run邋Length邋j邐Run邋Length邋j逡逑

示例,線性可分


照需求對排序特征集合進(jìn)行從前往后的特征選擇,生成最出這個迭代過程是一個后向特征消除的例子。但是在實(shí)際機(jī)特征并進(jìn)行新的分類器訓(xùn)練,可能無法滿足科研中的計(jì)算個特征可能是更有效的方法,但這樣做極大程度上會導(dǎo)致法下產(chǎn)生的是特征子集的排序,而不是特征的排序。產(chǎn)生:Ac逡逑量機(jī)(SVM)逡逑本思想就是根據(jù)樣本集D在樣本空間中找到一個超平面,行分類。SVM算法是一種比較常用的樣本分類方法本集是線性可分?jǐn)?shù)據(jù)。所以本節(jié)重點(diǎn)介紹線性可分支持向量的線性SVM分類示例圖。逡逑y

【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前3條

1 胡盼盼;王佳舟;胡偉剛;章真;;影像組學(xué)在精準(zhǔn)放療中的應(yīng)用[J];中華放射腫瘤學(xué)雜志;2017年01期

2 熊赤;牛朝詩;;多模態(tài)磁共振成像在腦膠質(zhì)瘤鑒別診斷的應(yīng)用[J];立體定向和功能性神經(jīng)外科雜志;2013年01期

3 高程程;惠曉威;;基于灰度共生矩陣的紋理特征提取[J];計(jì)算機(jī)系統(tǒng)應(yīng)用;2010年06期

相關(guān)碩士學(xué)位論文 前1條

1 尹祖鈺;基于主成分分析和遞歸特征消除的支持向量機(jī)分類方法研究[D];哈爾濱工業(yè)大學(xué);2016年



本文編號:2793086

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