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RAB39B基因突變導致X連鎖遺傳帕金森綜合征分子遺傳學及機制研究

發(fā)布時間:2020-05-21 12:12
【摘要】:背景帕金森病(Parkinson’s Disease)是一種常見的中老年慢性神經退行性疾病。青少年型帕金森綜合征(Juvenile Parkinsonism,JP)是一種非常罕見的遺傳性PD。患者大多于青少年時期發(fā)病,一般早于21歲,主要臨床表現(xiàn)為進展較為緩慢的震顫、肌肉強直、運動遲緩和姿勢不穩(wěn)等帕金森綜合征癥狀,多巴胺替代治療效果良好。目前已發(fā)現(xiàn)20余種單基因突變與JP相關。Pakin、Pink1和DJ-1基因突變可導致具有單純帕金森綜合征癥狀的JP,而攜帶PLA2G6、ATP13A2和DNAJC6基因突變的患者除了具有帕金森綜合征癥狀外,還可伴隨言語障礙、錐體束征和構音障礙等不典型癥狀。RAB39B基因位于X染色體上,編碼一種囊泡轉運相關蛋白,該基因突變可導致伴有認知功能障礙的早發(fā)型PD。目前,在中國漢族人群中尚無RAB39B基因突變導致JP的報道。目的我們在前期工作中收集到1個JP家系,通過全外顯子組測序(Whole exome sequencing,WES)技術,明確該家系的致病基因,了解RAB39B基因突變在中國散發(fā)性PD人群中的流行特點,并初步探究其在PD發(fā)病機制中的作用。方法1.本研究納入1個JP家系和505名在鄭州大學第一附屬醫(yī)院就診的散發(fā)性PD患者。所有患者均完善相關檢查,并由兩名神經內科?漆t(yī)師進行詳細的體格檢查和診斷。同時,納入510名性別、年齡與病例組匹配的健康對照。所有研究對象均知情同意,登記臨床資料、抽血及定期隨訪。2.對該家系的2名男性患者進行WES,對測序結果進行后期分析驗證,明確其致病基因。3.利用Sanger測序,在家系內所有成員進行RAB39B基因突變位點的驗證;在本地區(qū)散發(fā)性PD和正常人群中進行RAB39B基因突變的篩查。4.構建含有本研究發(fā)現(xiàn)的致病突變位點的真核表達載體,利用脂質體轉染、Real-time PCR、Western-blot及免疫熒光等技術來明確突變型RAB39B的表達水平及RAB39B對自噬功能和α-突觸核蛋白(α-Synuclein,α-Syn)的影響。結果1.該家系兩名男性患者表現(xiàn)為青少年時期出現(xiàn)的肢體震顫、行動遲緩及肌強直等癥狀,伴隨不同程度的認知功能障礙;颊叩念^顱磁共振成像(Magneticresonance imaging,MRI)、計算機斷層掃描(Computed tomography,CT)結果顯示雙側基底節(jié)對稱性的鈣化。先證者之父及家系中女性成員均表現(xiàn)正常,符合X染色體連鎖的遺傳規(guī)律。2.根據(jù)WES結果,共篩選出31個兩名患者共同攜帶的可疑致病變異,其中RAB39B(c.536dupA)突變最有可能為致病突變。3.經過Sanger測序驗證,該家系中患者Ⅱ-2和Ⅲ-1為RAB39B基因c.536dupA半合子突變。先證者母親Ⅱ-3為RAB39B基因c.536dupA雜合突變。家系中其他正常成員Ⅱ-1、Ⅱ-4及Ⅱ-5不攜帶該突變。RAB39B基因c.536dupA突變與臨床表型共分離。在本地區(qū)散發(fā)性PD和正常人群中未發(fā)現(xiàn)RAB39B基因新的致病突變。4.成功構建含有RAB39B基因(c.536dupA)突變型載體pcDNA3.1-HA-RAB39B-536。在N2a細胞模型中,突變型RAB39B的轉錄水平約為野生型RAB39B的2倍,而突變型RAB39B的蛋白水平明顯低于野生型,加入MG132后突變型RAB39B蛋白水平有所升高。5.RAB39B基因(c.536dupA)突變組的LC3BⅡ/Ⅰ值顯著低于野生組。6.RAB39B蛋白可能與α-Syn存在體內相互作用關系。過表達野生型和突變型的RAB39B不影響內源性α-Syn的蛋白水平,而過表達野生型的RAB39B會導致外源性的野生型和突變型(p.A53T)α-Syn蛋白水平升高。結論1.首次在中國漢族人群中發(fā)現(xiàn)RAB39B基因c.536dupA突變所導致的X染色體連鎖遺傳的JP。RAB39B基因突變不是PD常見的發(fā)病原因。2.首次發(fā)現(xiàn)RAB39B基因c.536dupA突變可導致患者出現(xiàn)雙側基底節(jié)區(qū)明顯的鈣化,擴展了RAB39B基因突變所導致的PD的臨床表型。3.RAB39B基因c.536dupA突變型蛋白穩(wěn)定性下降,突變型蛋白可能通過泛素-蛋白酶體通路降解。4.RAB39B基因c.536dupA突變可能影響細胞的自噬水平。5.RAB39B蛋白可能與α-Syn存在體內相互作用關系,可能參與α-Syn的穩(wěn)態(tài)水平的維持。
【圖文】:

家系圖,帕金森綜合征,家系圖,神經內科


法,我們在鄭州大學第一附屬醫(yī)院神經內科收集了患者(先證者及先證者之舅)表現(xiàn)為青少年時帕金森綜合征癥狀,同時伴隨不同程度的認知庭成員表現(xiàn)均正常,符合 X 染色體連鎖的遺傳共振成像(Magnetic resonance imaging, MRI)及graphy, CT)等檢查,同時有兩名神經內科?漆t(yī)的 6 名成員均同意登記臨床資料、抽血及定期隨

實驗流程,外顯子,測序,文庫


圖 1.2 全外顯子組測序實驗流程[31]樣本檢測組 DNA 總量在 10μg 以上,濃度 50ng/μl 以上,A260/A280 的值在 1采用 Agilent Sureselect 方法制備測序文庫[32]NA 文庫準備:使用 Covaris S2 超聲儀將基因組 DNA 片段化→修復→在末端已修復的 DNA 片段 3’末端加上“A”堿基→將特定的測NA 片段末端→將加上測序接頭的 DNA 片段利用 PCR 進行擴增。均需用 Agencourt AMPure XP 磁珠純化樣本。測定 DNA 文庫濃度文庫雜交:將待雜交樣本與 SureSelect 靶向富集系統(tǒng)在液相A 的形式進行雜交。用 Dynal 磁珠捕獲雜交的 DNA 片段。將未結合的 DNA 片段除去,,A 酶消化。PCR 擴增捕獲的 DNA 片段并純化。檢測文庫質量后上機。
【學位授予單位】:鄭州大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2018
【分類號】:R742.5

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