【摘要】：抑郁癥是腦腫瘤的常見并發(fā)癥,且在臨床診斷中抑郁癥狀已成為膠質(zhì)瘤的首發(fā)臨床表現(xiàn)。腦腫瘤與抑郁癥是否有關聯(lián),腦腫瘤能否引發(fā)抑郁癥,或者抑郁可導致腫瘤的發(fā)生,這些都是人們關注的主要問題。然而至今對此仍知之甚少。本文通過對抑郁癥與膠質(zhì)瘤發(fā)病分子機制關聯(lián)分析的研究,以尋找該問題的答案。本文采用整合數(shù)據(jù)的方式,系統(tǒng)分析了HG-U133A和HG-U133Plus2兩個平臺的47個不同數(shù)據(jù)集,包括367個抑郁癥樣本,1726個膠質(zhì)母細胞瘤樣本。然后利用R語言limma包中的線性回歸和經(jīng)典貝葉斯方法得到463個MDD的差異表達基因,823個GBM的差異表達基因。并且發(fā)現(xiàn)MDD和GBM存在27個共同的差異表達基因,其中,LOX,NPY1R,SHANK3,VEGFA基因已被研究發(fā)現(xiàn)同時與MDD和GBM有關聯(lián)。在獲得差異表達基因后,用Targetscan工具對其進行本地化miRNA預測;同時,通過STRING在線平臺獲得其蛋白互作網(wǎng)絡,并用MCODE算法聚類得到其顯著核心基因模塊。通過Cytoscape對MDD和GBM的蛋白互作網(wǎng)絡分析得到4個重疊關鍵基因,分別是:CXCR4,VEGFA,MGP,GNB5;且CXCR4,GNB5基因也存在于顯著核心基因模塊。同時通過差異表達基因、顯著核心基因模塊、預測到的miRNA三個方面進行功能注釋和富集分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn)MDD與GBM存在23條KEGG生物調(diào)控共同通路,經(jīng)醫(yī)學本體信息檢索平臺COREMINE進行文本挖掘,確定其中的13條生物通路作為兩種疾病的共同調(diào)控通路。最后,利用Apriori算法對抑郁癥和膠質(zhì)瘤的差異表達基因及GO生物途徑進行關聯(lián)分析,并進一步構(gòu)建抑郁癥和膠質(zhì)瘤的發(fā)病分子機制網(wǎng)絡。結(jié)果發(fā)現(xiàn),PLA2G5、LOC644794、VEGFA、MYO10,DAB2IP,FGFR2這6個基因在MDD發(fā)病分子機制網(wǎng)絡顯著存在;PRKCZ,CDC42,EGFR,PAK1,CAMK2A,CAMK2B,VEGFA,GABRG2,GABRA5,MAL2,HCN1,CPEB3,TAC1,這13個基因在GBM發(fā)病分子機制網(wǎng)絡顯著存在;同時發(fā)現(xiàn)VEGFA基因與MDD和GBM的發(fā)病分子機制有顯著關聯(lián)。研究表明重度抑郁癥和膠質(zhì)母細胞瘤的發(fā)病分子機制存在緊密關聯(lián),功能富集分析所發(fā)現(xiàn)的共同調(diào)控通路將有助于抑郁癥和膠質(zhì)瘤的發(fā)病機理研究。本研究可為抑郁癥和膠質(zhì)瘤的生物標志物研究奠定基礎,為疾病精準診斷及治療提供新思路,也為正確闡釋抑郁癥和膠質(zhì)瘤之間的關聯(lián)研究提供新方法。
【圖文】：

數(shù)據(jù)質(zhì)量可視化圖

圖 2.2 合并數(shù)據(jù)的箱線圖。A 為合并原始數(shù)據(jù)的箱線圖；B 為合并原始數(shù)據(jù)經(jīng) RMA 預處理后的箱線圖。Fig 2.2 A box-plot graph for merging data.
【學位授予單位】：重慶郵電大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2018
【分類號】：R749.41;R739.41

【參考文獻】

相關期刊論文 前2條

1 楊明華;諸紅秀;;誤診為抑郁癥的腦膠質(zhì)瘤1例[J];臨床精神醫(yī)學雜志;2015年03期

2 李苒;高杉;李琳;張敏;王怡;于春泉;;抑郁癥發(fā)病機制的研究進展[J];天津中醫(yī)藥;2013年02期

相關博士學位論文 前2條

1 阿里木江·克里木;基于代謝組學平臺的膠質(zhì)瘤患者血漿代謝標志物研究[D];新疆醫(yī)科大學;2016年

2 胡國章;利用生物信息學方法篩選膠質(zhì)瘤的差異表達基因及其相關機制[D];吉林大學;2015年

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本文編號：2646080