【摘要】：目的：探索帕金森病（Parkinson’s disease，PD）易感基因SNCA在維、漢兩民族間的表達(dá)差異，以及Rep1位點(diǎn)片段多態(tài)性差異和內(nèi)含子1區(qū)甲基化水平與不同民族間PD的發(fā)生關(guān)聯(lián)。方法：用Illumina表達(dá)譜芯片篩查6例PD患者（維∶漢=1∶1）與5體檢健康者（維∶漢=3∶2）的外周血淋巴細(xì)胞（Peripheral bloodmononuclear cells，PBMCs），并用實(shí)時(shí)熒光定量PCR（real time fluorescent quantitativePCR，qRT-PCR）法檢測SNCA mRNA的表達(dá)水平；直接測序法檢測SNCA啟動子區(qū)Repl多態(tài)性；密度梯度離心分離40例EOPD（early-onset Parkinson’s disease）患者（維族19例，漢族21例）和40例年齡≤50歲正常人（維族19例，漢族21例）的PBMCs，飛行時(shí)間質(zhì)譜分析質(zhì)譜技術(shù)（matrix-assisted laser desorption/ionization time of flight，MALDI-TOF）檢測SNCA基因內(nèi)含子1區(qū)的甲基化水平。結(jié)果：（1）PD組與對照組比較，漢族PD組與漢族對照組比較均未發(fā)現(xiàn)SNCA基因表達(dá)差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（P＞0.05）；維族PD組與維族對照組比較，本研究共發(fā)現(xiàn)274個差異表達(dá)的基因。其中，177個（63.4％）基因?yàn)樯险{(diào)基因，有97個（36.6％）差異表達(dá)基因?yàn)橄抡{(diào)基因，其中與家族性PD和散發(fā)性PD發(fā)生均有關(guān)的易感基因SNCA在維族PD與維族對照組的比較中差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（表達(dá)倍數(shù)值Fold change，F(xiàn)C=5.96，P=0.02，，）。通過應(yīng)用KEGG（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes）數(shù)據(jù)庫相關(guān)軟件平臺進(jìn)行功能模塊分析，發(fā)現(xiàn)多個具有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異的KEGGpathway，包括：膽堿能突觸（富集指數(shù)Fold enrichment，F(xiàn)E=5.569，P=0.005）、小細(xì)胞肺癌（FE=5.307，P=0.018）、癌癥的轉(zhuǎn)錄失調(diào)（FE=3.807，P=0.018）、GABA能突觸（FE=5.185，P=0.019）、D-谷氨酰胺和D-谷氨酸代謝（FE=50.125，P=0.020）、晝夜節(jié)律（FE=4.904，P=0.022）、趨化因子信號傳導(dǎo)通路（FE=3.342，P=0.028）、谷氨酸突觸（FE=4.064，P=0.035）、多巴胺突觸（FE=3.638，P=0.046）、精氨酸和脯氨酸代謝（FE=5.569，P=0.049），其中SNCA基因參與的膽堿能突觸（FE=5.569，P=0.005）、多巴胺突觸（FE=3.638，P=0.046）共富集通路，可能與PD發(fā)病機(jī)制有關(guān)。（2）本研究共發(fā)現(xiàn)Rep1位點(diǎn)0，1，2三種等位基因，0/0、1/1、2/2、0/1、0/2、1/2六種基因型；等位基因2頻率在PD組中高于對照組分別為9.7%和6.4%，差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（2=7.81，P=0.02；）；EOPD（Early-onset Parkinson’s Disease）組與年齡≤50歲對照組比較：等位基因2在兩組間的頻率分別為22.5%和7.3%。兩組比較差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（2=16.89，P=0.00）；EOPD組與LOPD（Late-onsetParkinson’s Disease）組比較：在EOPD組中等位基因2的發(fā)生頻率明顯高于LOPD組，分別為22.5%、6.1%，差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（2=35.52，P=0.00）；不同民族間PD組與對照組、不同性別間PD組與對照組、晚發(fā)性PD組與年齡＞50歲的對照組、PD組間維、漢比較、PD組間男、女比較，差異均沒有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（P＞0.05）。（3）EOPD組與年齡≤50歲對照組比較、漢族EOPD組與漢族對照組比較、維族EOPD組與維族對照組比較、男性EOPD組與男性對照組比較、女性PD組與女性對照組比較以及男性EOPD組與女性EOPD組比較均未發(fā)現(xiàn)SNCA基因內(nèi)含子1區(qū)的平均甲基化水平存在統(tǒng)計(jì)學(xué)差異（P＞0.05）；維族EOPD組SNCA基因內(nèi)含子1區(qū)平均甲基化水平高于漢族EOPD組，差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（P=0.020，OR=0.81）；不攜帶2型等位基因的EOPD組其甲基化水平低于相應(yīng)的對照組（6.4%vs6.6%，P＞0.05），攜帶2型等位基因的EOPD組其甲基化水平也低于相應(yīng)的對照組，差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（6.1%vs7.1%，P＞0.05）；攜帶2型等位基因的EOPD患者其甲基化水平低于不攜帶2型等位基因的EOPD個體，差異沒有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（6.1%和6.4%，P＞0.05）。結(jié)論：（1）易感基因SNCA與新疆地區(qū)維族PD的發(fā)生有關(guān)；（2）SNCA基因啟動子區(qū)Rep1片段多態(tài)等位基因2與EOPD的易患性有關(guān)，而與民族、性別無關(guān)。（3）SNCA基因基因內(nèi)含子1區(qū)的甲基化水平可能與維、漢兩民族的EOPD的發(fā)病無關(guān)。（4）攜帶2型等位基因且內(nèi)含子1區(qū)低甲基化的個體更易患PD，且發(fā)病年齡趨于早發(fā)型。
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】：新疆醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】：博士
【學(xué)位授予年份】：2014
【分類號】：R742.5

【相似文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 周穎杰;王明貴;;質(zhì)粒介導(dǎo)氨基糖苷類抗生素新耐藥機(jī)制:16S rRNA甲基化酶[J];中國感染與化療雜志;2010年02期

2 吳琳;張治國;張健;劉新平;李福洋;;靶向性甲基化酶真核表達(dá)載體pcDNA3.1-myc-3a的構(gòu)建[J];現(xiàn)代生物醫(yī)學(xué)進(jìn)展;2010年03期

3 孫振榮;;體外N-甲基-N′-硝基-N-亞硝基胍對DNA甲基化酶的抑制作用[J];國外醫(yī)學(xué)(分子生物學(xué)分冊);1980年06期

4 何忠效，危巍，白堅(jiān)石，吳志奎;抗衰老藥物對大鼠肝DNA甲基化酶活力的影響[J];中國中西醫(yī)結(jié)合雜志;1994年06期

5 白堅(jiān)石，何忠效，顧郁;鼠肝DNA甲基化酶的純化及物理化學(xué)性質(zhì)的研究[J];生物化學(xué)雜志;1996年06期

6 白堅(jiān)石,何忠效;哺乳動物DNA甲基化酶[J];生理科學(xué)進(jìn)展;1997年01期

7 薛繼艷,何忠效;BamHI DNA甲基化酶的提純及物理化學(xué)性質(zhì)[J];生物化學(xué)雜志;1990年06期

8 李龍飛;鄭世營;;甲基化與肺癌關(guān)系的研究[J];醫(yī)學(xué)綜述;2008年11期

9 林寧;孫海平;糜祖煌;;多重耐藥大腸埃希菌16SrRNA甲基化酶、氨基糖苷類修飾酶基因研究[J];中國抗生素雜志;2008年09期

10 陳雅婷;張進(jìn);杜穎穎;王慧君;馬端;;利用甲基化CpG結(jié)合域富集甲基化DNA[J];中國產(chǎn)前診斷雜志(電子版);2008年01期

相關(guān)會議論文 前10條

1 姚軍;李威;秦智偉;王曉武;武劍;;植物DNA甲基化及檢測方法[A];中國園藝學(xué)會十字花科蔬菜分會第六屆學(xué)術(shù)研討會暨新品種展示會論文集[C];2008年

2 汪宏良;鄒義春;柯俊;鮑群麗;羅卓躍;;多藥耐藥銅綠假單胞菌16S rRNA甲基化酶、氨基糖苷類修飾酶基因研究[A];湖北省暨武漢市微生物學(xué)會分析微生物專業(yè)委員會第十屆第五次學(xué)術(shù)會議論文匯編[C];2008年

3 連佳;黃圓圓;崔秀宏;高飛;安曉榮;侯健;;組蛋白去甲基化酶在小鼠卵巢組織中的表達(dá)[A];全國動物生理生化第十一次學(xué)術(shù)交流會論文摘要匯編[C];2010年

4 鄭一超;徐瑞敏;呂文蕾;黃薈杰;李金鳳;劉宏民;;組蛋白賴氨酸特異性去甲基化酶1的生物學(xué)意義及原核表達(dá)[A];2011年中國藥學(xué)大會暨第11屆中國藥師周論文集[C];2011年

5 韓志富;劉培源;程偉;谷立川;李宏;陳涉;柴繼杰;;組蛋白去甲基化酶JHDM1的晶體結(jié)構(gòu)研究[A];中國晶體學(xué)會第四屆全國會員代表大會暨學(xué)術(shù)會議學(xué)術(shù)論文摘要集[C];2008年

6 孔祥謙;歐陽斯盛;梁中潔;葉飛;陳麗敏;羅成;蔣華良;;賴氨酸特異性去甲基化酶1催化反應(yīng)機(jī)制的理論研究[A];第十一屆全國計(jì)算（機(jī)）化學(xué)學(xué)術(shù)會議論文摘要集[C];2011年

7 陳琳;陳杖榴;劉健華;;16S rRNA甲基化酶介導(dǎo)的對氨基糖苷類高水平耐藥性的初步研究[A];中國畜牧獸醫(yī)學(xué)會獸醫(yī)藥理毒理學(xué)分會第九次學(xué)術(shù)討論會論文與摘要集[C];2006年

8 陳飛;方瑞;楊慧蓉;董爭紅;房健;朱婷婷;鞏微;石雨江;徐彥輝;;LSD2/KDM1b的結(jié)構(gòu)研究和功能研究——LSD2/KDM1b識別底物與酶活調(diào)節(jié)的新機(jī)制[A];中國晶體學(xué)會第五屆全國會員代表大會暨學(xué)術(shù)大會（大分子分會場）論文摘要集[C];2012年

9 鄧大君;;CpG甲基化與癌變原理研究[A];第三屆中國腫瘤學(xué)術(shù)大會教育論文集[C];2004年

10 楊財(cái)廣;;核酸去甲基化酶FTO的小分子抑制劑[A];中國化學(xué)會第29屆學(xué)術(shù)年會摘要集——第22分會：化學(xué)生物學(xué)[C];2014年

相關(guān)重要報(bào)紙文章 前1條

1 張國芳;藍(lán)斐：創(chuàng)新是信心和習(xí)慣[N];科技日報(bào);2013年

相關(guān)博士學(xué)位論文 前10條

1 楊敏;細(xì)胞色素C氧化酶Ⅱ亞基甲基化在慢性阻塞性肺疾病肺血管內(nèi)皮細(xì)胞凋亡中的作用[D];中南大學(xué);2009年

2 宋曉麗;無機(jī)砷甲基化及人砷甲基化酶催化機(jī)制[D];南京大學(xué);2010年

3 李響利;砷甲基化過程中S-腺苷甲硫氨酸和砷與人砷甲基化酶結(jié)合位點(diǎn)的研究[D];南京大學(xué);2014年

4 張永宏;三個地方品種雞肌肉組織基因組DNA甲基化分析[D];吉林大學(xué);2014年

5 劉平果;原發(fā)性肝細(xì)胞癌P～(16)甲基化及AFP mRNA表達(dá)的研究[D];中南大學(xué);2003年

6 武立鵬;組蛋白甲基化和DNA甲基化相互作用機(jī)制探討[D];北京大學(xué);2008年

7 侯曉瑋;鉤端螺旋體腺苷甲硫氨酸依賴型氧甲基化酶和人線粒體外膜蛋白mitoNEET的結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究[D];中國科學(xué)技術(shù)大學(xué);2008年

8 劉勇;肺癌染色體和DNA甲基化異常改變及其診斷價(jià)值的研究[D];第三軍醫(yī)大學(xué);2002年

9 龍亞東;FOXE-1甲基化與表達(dá)的關(guān)聯(lián)分析及其與結(jié)直腸癌的相關(guān)性研究[D];復(fù)旦大學(xué);2013年

10 馬愛妞;SurKex誘導(dǎo)survivin基因沉默的分子機(jī)理研究[D];上海交通大學(xué);2010年

相關(guān)碩士學(xué)位論文 前10條

1 蘇婧;基于金納米顆粒和發(fā)夾型核酸探針電化學(xué)檢測DNA甲基化酶[D];湖南大學(xué);2012年

2 席婷;部分雜交燦稻親本DNA甲基化多態(tài)性與遺傳穩(wěn)定性的初步研究[D];四川農(nóng)業(yè)大學(xué);2011年

3 唐小平;銅綠假單胞菌氨基糖苷類耐藥16S rRNA甲基化酶編碼基因分布研究[D];浙江大學(xué);2008年

4 呂凌波;胃癌組織p16 CpG島甲基化的定量分析研究[D];江西醫(yī)學(xué)院;2005年

5 毛銳濤;馬鈴薯甲基轉(zhuǎn)移酶和去甲基化酶預(yù)測及表達(dá)研究[D];內(nèi)蒙古大學(xué);2014年

6 陳飛;組蛋白去甲基化酶LSD2結(jié)構(gòu)與功能研究[D];復(fù)旦大學(xué);2012年

7 孫貝娜;一種高通量的全基因組甲基化CpG島富集方法的建立[D];上海交通大學(xué);2009年

8 方芳;從基因組序列預(yù)測CpG島甲基化的傾向性[D];清華大學(xué);2007年

9 程越;肝細(xì)胞癌臨床病理及預(yù)后相關(guān)的CpG島甲基化表型研究[D];第二軍醫(yī)大學(xué);2008年

10 徐峗;LINE-1甲基化與肝癌臨床病理和預(yù)后關(guān)系[D];第二軍醫(yī)大學(xué);2010年

本文編號：2337913