本文選題：吉蘭巴雷綜合征　切入點：lncRNAs　出處：《天津醫(yī)科大學》2017年碩士論文　論文類型：學位論文

【摘要】：研究背景:長鏈非編碼RNAs(Long Noncoding RNAs,lncRNAs)作為一種新近出現(xiàn)的對多種生物學過程及疾病的發(fā)病機制具有調節(jié)作用的生物小分子物質已被眾多學者所認識,其近年來在腫瘤性疾病、自身免疫性疾病及神經(jīng)系統(tǒng)疾病中的研究進展迅速,但目前l(fā)ncRNAs在吉蘭-巴雷綜合征(Guillain-BarréSyndrome,GBS)發(fā)病機制中的作用仍不十分明確。研究目的:通過lncRNAs芯片分析GBS患者與健康對照組的差異lncRNAs和mRNAs的表達,并進一步分析GBS患者CD14+的外周血單核細胞中mRNAs及l(fā)ncRNAs的差異性表達,通過生物信息學分析lncRNAs的共表達基因、生物功能聚類及可能參與的信號通路,并構建基因共表達網(wǎng)絡圖分析lncRNAs在基因調控中的作用,為探索lncRNAs在GBS的發(fā)病機制中的作用奠定研究基礎。研究方法:研究1選取15名GBS患者及15名性別年齡相匹配的健康對照者行l(wèi)ncRNAs及mRNAs芯片表達譜分析其差異表達,行qRT-PCR驗證代表性顯著差異表達lncRNAs的芯片分析結果的可靠性,利用RMR軟件根據(jù)lncRNAs特征與靶點基因間的相關性及冗余度對lncRNAs及mRNAs的特征重要性進行排序,并通過GO分析及KEGG信號通路分析差異表達的lncRNAs的生物學功能,構建共表達基因網(wǎng)絡揭示lncRNAs與相關目的基因的潛在調控作用。研究2選取10名GBS患者及10名相匹配的健康對照者,提取CD14+外周血單核細胞的lncRNAs用于芯片表達譜分析,利用PCR的方法驗證芯片分析結果的可靠性,并通過GO分析及KEGG信號通路分析差異表達的lncRNAs的生物學功能,構建共表達基因網(wǎng)絡揭示lncRNAs與相關目的基因的潛在調控作用。研究結果:研究1對芯片表達譜數(shù)據(jù)分析篩選得到的差異表達lncRNAs和mRNAs行mRMR分析,根據(jù)其對GBS患者及健康對照者不同分類的最大相關及最小冗余特征,顯示了排序最靠前的310個mRNAs及114個lncRNAs。差異lncRNAs的GO分析結果表明GBS患者中l(wèi)ncRNAs高度富集于細胞成分、生理過程、信號通路等生物學功能,如細胞質、細胞大分子復合物的裝配、細胞周期、連接酶活性及蛋白代謝過程等,而KEGG分析結果則表明lncRNAs可能與7條生物信息通路最為相關,主要集中在蛋白酶體、剪接體、檸檬酸循環(huán)(三羧酸循環(huán))、NOD樣受體信號通路、原發(fā)性免疫缺陷、細胞吞噬及T細胞受體信號通路。LncRNAs-mRNAs共表達網(wǎng)絡分析顯示,303個mRNAs及113個lncRNAs包含在共表達關系網(wǎng)絡中,其中1個mRNA可能與1-53個lncRNAs存在調控關系,而1個lncRNAs則可能與1-140個mRNAs起到互相調控作用,其中92個lncRNAs與6個mRNAs相互調控參與了“蛋白酶體”信號通路。研究2 LncRNAs及mRNAs的芯片表達譜分析結果表明GBS患者及健康對照者的CD14+外周血單核細胞中存在差異性表達,其中包括304個異常表達的lncRNAs(141個表達水平顯著上調,165個顯著下調)及288個異常表達的mRNAs(171個顯著上調,119個顯著下調),其中差異表達最為顯著的lncRNAs為ENST00000524361.1(上調)及ENST00000412647.2(下調),而差異表達最顯著的mRNAs為DEFA3(上調)及CCL2(下調)。這些差異基因的PCR分析結果與芯片分析結果相一致。GO功能分析表明,差異表達lncRNAs在細胞激活、白細胞遷移、細胞遷移調控、細胞運動、單生物細胞粘附、胞吐及細胞趨化等功能上較為富集。而KEGG信號通路分析顯示系統(tǒng)性紅斑狼瘡、造血細胞系、縫隙連接、細胞因子-細胞因子受體相互作用、NOD樣受體信號通路、白細胞經(jīng)內皮遷移以及趨化因子信號通路與差異表達lncRNAs最為相關。lncRNAs-mRNAs共表達網(wǎng)絡分析表明1個mRNA可與數(shù)十個lncRNAs起相互調控作用,而1個lncRNA亦可與數(shù)十個mRNAs相互調控,其中4個mRNAs(EGF、GP1BA、JAM3及ITGB3)與102個差異表達lncRNAs相互調控相關性最大。結論:在吉蘭-巴雷綜合征的患者及正常人群中的外周血單個核細胞及CD14+單核細胞中mRNAs及l(fā)ncRNAs均存在差異表達,差異表達的lncRNAs在GBS患者中可能參與多條信號通路,而差異表達lncRNAs與一些靶向基因間的調控作用可能在GBS的發(fā)病機制中起到至關重要的作用,進一步針對GBS與lncRNAs基因改變的關系研究可能成為新型發(fā)病機制及治療靶點研究的方向
[Abstract]:......
【學位授予單位】：天津醫(yī)科大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2017
【分類號】：R744.5

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本文編號：1559888