本文關(guān)鍵詞：漢族人群銀屑病和強直性脊柱炎易感位點的相關(guān)性研究

  更多相關(guān)文章： 銀屑病 強直性脊柱炎 全基因組關(guān)聯(lián)分析 單核苷酸多態(tài)性

【摘要】：研究背景： 銀屑病（psoriasis, OMIM㥮177900）是一種常見的慢性炎癥性皮膚病，以紅斑、鱗屑為主要臨床特征，具有明顯的復(fù)發(fā)特性。據(jù)流行病統(tǒng)計結(jié)果發(fā)現(xiàn)，該病可發(fā)生于各人種，但是不同種族發(fā)生率有明顯的差異。遺傳因素和免疫介導(dǎo)在本病發(fā)生過程中扮演了重要角色，而且多種免疫調(diào)節(jié)劑對此病療效顯著，因此銀屑病也被認(rèn)為是一種自身免疫性疾病。13個銀屑病易感位點已被OMIM收錄，為：PSORS1，PSORS2，PSORS3，PSORS4，PSORS5，PSORS6，PSORS7，PSORS8，PSORS9，PSORS10，PSORS11，，PSORS12和PSORS13，分別位于6p21.3、17q25、4q、1q21、3q21、19p13、1p、16q、4q31、18p11、5q31.1、20q13和6p21。一些發(fā)現(xiàn)也證明銀屑病和其他疾病如自身免疫系統(tǒng)疾病，如強直性脊柱炎（Ankylosingspondylitis, AS）、克羅恩腸病（Crohn’s Disease, CD）等，有著共同的易感基因。HLA-DR7在英國與幼年型AS有關(guān)，而其同時也與Ⅰ型銀屑病相關(guān)�；騃L23R和ERAP1也已被證明同時與銀屑病和AS相關(guān)，而且臨床上10%的AS患者同時患有銀屑病。病因上，二者也有一致性。AS是一種慢性進行性炎癥性以脊柱關(guān)節(jié)受累為主的免疫性疾病，大量研究顯示AS是一種遺傳病。遺傳因素在其發(fā)病過程中起主導(dǎo)作用,相關(guān)基因除HLA-B27外,尚有HLA區(qū)域內(nèi)及HLA區(qū)域外的其他基因參與，已發(fā)現(xiàn)的基因和位點IL23R、ERAP1、rs4672495（2p15）、rs4333130（4q21）、rs2242944(21q22)、rs4552569（5q14.3）和非同義核苷酸多態(tài)性（non-synonymoussingle nucleotide polymorphism, nsSNP) rs4077515（9q34.3）和位于KIF21B的rs2297909（1q32）。國際單體圖型計劃（Human Haplotype Map, HapMap）的完成和廉價高效的高通量基因分型技術(shù)的出現(xiàn)，為全基因組水平搜尋復(fù)雜疾病易感基因的方法即全基因組關(guān)聯(lián)研究（Genome-wide association study, GWAS）提供了支撐，全基因組關(guān)聯(lián)研究（GWAS）在常見復(fù)雜疾病的遺傳學(xué)研究中有更高的效力。為了更好地揭示銀屑病和AS之間的關(guān)系，也為了更好地揭示銀屑病的遺傳學(xué)依據(jù)，本研究以歐美人群AS患者全基因組關(guān)聯(lián)分析（GWAS）數(shù)據(jù)為基礎(chǔ)，在中國漢族銀屑病患者中（2208病例和2208對照）進行驗證。 目的：研究歐美人群強直性脊柱炎易感位點在中國漢族人群銀屑病中的作用，搜尋兩種疾病之間的遺傳共性和異質(zhì)性。 方法：從歐美人群強直性脊柱炎患者的全基因組關(guān)聯(lián)分析（GWAS）發(fā)現(xiàn)的易感位點中選擇8個SNP位點，利用Sequenom Massarray驗證平臺在中國漢族人群2208例銀屑病病例和2208例正常對照中進行驗證，用Plink1.07軟件進行統(tǒng)計分析。 結(jié)果：1.8個SNP位點等位基因的頻率分布在病例組與對照組間的差異無統(tǒng)計學(xué)意義（P0.05）。2.將病例按照臨床表型分組后進行分層比較，rs2297909等位基因頻率分布在對照組和銀屑病伴家族史病例組之間的差異有統(tǒng)計學(xué)意義（P=0.01），有無家族史組間的差異也有統(tǒng)計學(xué)意義（P=0.01）；在對照組和發(fā)病年齡40歲組間的差異有統(tǒng)計學(xué)意義（P=0.03），在發(fā)病年齡≤40歲和發(fā)病年齡40歲組間的差異也有統(tǒng)計學(xué)意義（P=0.0016）。3.rs6854711等位基因的頻率分布在對照組與發(fā)病年齡40歲間的差異有統(tǒng)計學(xué)意義（P=0.049）。4.其余6個位點等位基因的頻率分布在分層比較中的差異無統(tǒng)計學(xué)意義（P0.05）。 結(jié)論：本研究在中國漢族人群銀屑病病例和對照中對歐美人群報道的AS易感位點進行關(guān)聯(lián)分析。首次發(fā)現(xiàn)rs2297909（1q32）與銀屑病家族史和發(fā)病年齡均相關(guān)，rs6854711（4q21）與銀屑病發(fā)病年齡相關(guān)。在其余6個位點中未發(fā)現(xiàn)與中國漢族人群銀屑病相關(guān)，提示在這兩種疾病不同人群之間可能存在遺傳異質(zhì)性。
【關(guān)鍵詞】：銀屑病 強直性脊柱炎 全基因組關(guān)聯(lián)分析 單核苷酸多態(tài)性
【學(xué)位授予單位】：安徽醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2013
【分類號】：R758.63;R593.23
【目錄】：

• 目錄4-6
• 英文縮略詞表6-7
• 中文摘要7-9
• Abstract9-11
• 1．引言11-17
• 2．材料和方法17-39
• 2.1 研究對象17-18
• 2.2 研究方法18-19
• 2.3 實驗試劑19-20
• 2.3.1 DNA 提取試劑19
• 2.3.2 電泳用試劑19
• 2.3.3 標(biāo)準(zhǔn)化 DNA 用試劑19-20
• 2.3.4 基因分型用試劑20
• 2.4 實驗儀器20-22
• 2.4.1 DNA 提取器材20-21
• 2.4.2 電泳的儀器21
• 2.4.3 DNA 標(biāo)準(zhǔn)化儀器21-22
• 2.5 分析軟件和電子數(shù)據(jù)庫查詢信息22-23
• 2.6 實驗方法和步驟23-39
• 2.6.1 全血標(biāo)本采集23-24
• 2.6.2 基因組 DNA 提取及注意事項24-25
• 2.6.3 基因組 DNA 電泳25-26
• 2.6.4 DNA 濃度標(biāo)準(zhǔn)化26-27
• 2.6.5 Sequenom MassArray 系統(tǒng)基因分型27-39
• 2.6.5.1 SNP 點的選擇27
• 2.6.5.2 引物設(shè)計及合成27-30
• 2.6.5.3 Sequenom 實驗日程安排30-37
• 2.6.5.4 Plink1.03 軟件進行統(tǒng)計分析37-39
• 3．結(jié)果39-44
• 4．討論44-46
• 5．結(jié)論46-47
• 6．參考文獻47-50
• 附錄50-52
• 致謝52-54
• 課題綜述54-60
• 參考文獻57-60

【共引文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前8條

1 常樹霞;陳永鋒;;Th17細胞與銀屑病[J];皮膚性病診療學(xué)雜志;2010年01期

2 吳歆;徐滬濟;吳寧;;IL-23R的研究現(xiàn)狀[J];中國熱帶醫(yī)學(xué);2008年01期

3 李洪武;;地蒽酚蠟棒短程接觸療法聯(lián)合窄譜中波紫外線治療尋常型斑塊狀銀屑病[J];實用皮膚病學(xué)雜志;2010年04期

4 李敏;唐先發(fā);朱誠W

本文編號：943712