研究目的:賴氨酸2-羥基異丁酰化是一種新發(fā)現(xiàn)的蛋白質(zhì)翻譯后修飾。這種修飾是蛋白質(zhì)酰化作用的一種重要類型,已在多種生物中被發(fā)現(xiàn),并參與了一些重要的代謝過(guò)程。但其在疾病尤其是銀屑病中的變化及其作用尚未被認(rèn)知。本研究通過(guò)首次定量來(lái)自45對(duì)銀屑病患者的皮損和非皮損皮膚組織樣本的賴氨酸2-羥基異丁�；�,并進(jìn)行比較和生物信息學(xué)分析,以探索賴氨酸2-羥基異丁酰化修飾在銀屑病中的變化及意義。研究方法:采集45對(duì)尋常型銀屑病患者的皮損和非皮損皮膚組織樣本,共分為三個(gè)樣本池以進(jìn)行重復(fù)試驗(yàn)。處理皮膚組織提取蛋白質(zhì),進(jìn)行串聯(lián)質(zhì)譜標(biāo)簽標(biāo)記,高效液相色譜法分級(jí)分離,使用賴氨酸2-羥基異丁�；贵w進(jìn)行目標(biāo)的親和富集,隨后進(jìn)行LC-MS/MS定量分析。比較皮損組織和非皮損組織的賴氨酸2-羥基異丁�；揎椝降牟町�;將差異修飾位點(diǎn)同已發(fā)表的銀屑病基因組、轉(zhuǎn)錄組、蛋白組數(shù)據(jù)進(jìn)行串聯(lián)分析;將差異修飾位點(diǎn)通過(guò)基因本體論注釋、motif分析、結(jié)構(gòu)域分析及基因和基因組百科全書(shū)庫(kù)檢索,以進(jìn)行生物信息學(xué)層面的分析和比較。研究結(jié)果:在銀屑病患者皮損和非皮損皮膚組織中均發(fā)現(xiàn)了大量賴氨酸2-羥基異丁酰化修飾。同時(shí),皮損和非皮損皮膚組織之間...

【文章頁(yè)數(shù)】：56 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖1.（A）Pearson相關(guān)系數(shù)分析3個(gè)重復(fù)試驗(yàn)進(jìn)行的可重復(fù)性，sl/Nsl表示PP/PN

安徽醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文12我們共進(jìn)行了3次重復(fù)試驗(yàn)，并通過(guò)Pearson相關(guān)分析對(duì)結(jié)果進(jìn)行了分析，再現(xiàn)性分析結(jié)果表明數(shù)據(jù)是可靠的（圖1A）。我們將得到的數(shù)據(jù)通過(guò)基因本體論分析（GeneOntology，GO分析）進(jìn)行蛋白質(zhì)組注釋，并將蛋白質(zhì)分為三類：生物學(xué)過(guò)程、細(xì)胞成分和分子功....

圖2.質(zhì)譜數(shù)據(jù)的質(zhì)量檢驗(yàn)

安徽醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文16在PP和PN樣本之間的比較中，我們發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)S100A9（比率=0.14，p=0.000371）、S100A2（比率=0.372，p=0.0239）、SERPINB4（比率=0.392，p=0.046）、HSP90B1（比率=2.233，p=0.021....

圖3.（A）被修飾氨基酸的熱圖分析

安徽醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文20圖3.（A）被修飾氨基酸的熱圖分析。（B）所有鑒定位點(diǎn)的motif分析。（C）每個(gè)motif的肽百分比。Fig3.(A)Theheatmapanalysisofenrichedanddepletedaminoacids.(B)Motifanalysis....

圖4.（A）Khib修飾上調(diào)的蛋白質(zhì)的GO功能分析

安徽醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文21飾上調(diào)的白質(zhì)與細(xì)胞和細(xì)胞外環(huán)境之間的溝通有關(guān)，如細(xì)胞外水泡囊泡、細(xì)胞外細(xì)胞器、細(xì)胞外膜細(xì)胞器、細(xì)胞質(zhì)核周區(qū)域；在分子功能類別中，大多數(shù)被Khib修飾上調(diào)的蛋白質(zhì)主要涉及的功能有整聯(lián)蛋白結(jié)合、肌動(dòng)蛋白絲結(jié)合、低密度脂蛋白顆粒受體結(jié)合、脂蛋白顆粒受體結(jié)合、....

本文編號(hào)：3934191