目的從分子水平研究皮膚鱗狀細胞癌(CSCC)血清蛋白組學的變化,為該病的發(fā)生、發(fā)展機制研究及分子靶向藥物的研發(fā)提供理論依據(jù)。方法基于高分辨質(zhì)譜的全掃描數(shù)據(jù)非依賴采集(Data Independent Acquisition,DIA)定量蛋白質(zhì)組學技術,比較CSCC患者與正常人血清中蛋白種類和濃度的差異。而后根據(jù)這些差異蛋白進行生物信息分析:GO功能及富集分析、Pathway代謝通路富集和蛋白-蛋白相互作用網(wǎng)絡(PPI)分析。結果在待測血清樣品中共檢測到411個蛋白。通過對比6個CSCC和6個正常人血清樣品的蛋白圖譜特征,發(fā)現(xiàn)共有28個蛋白具有顯著性差異。GO富集分析結果表明biological process (BP)、cellular component (CC)和molecular function (MF)三個本體中分別有533個、62個和57個顯著性差異的條目(GO terms)。KEGG pathway分析提示這些差異蛋白顯著地富集在pantothenate and co A biosynthesis、MAPK signaling pathway、propanoate met...

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圖1基于差異蛋白的GO富集分析

為了進一步了解CSCC的發(fā)生和發(fā)展過程，基于差異表達蛋白我們進行了蛋白-蛋白相互作用網(wǎng)絡(PPI)分析。結果表明共有10條代謝通路和8個蛋白關聯(lián)同一個PPI中，具體包括癌癥相關的代謝途徑glycolysis/gluconeogenesis、MAPKsignalingpathw....

圖2基于差異蛋白的KEGGpathway富集分析

圖1基于差異蛋白的GO富集分析3討論

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