不同地區(qū)孢子絲菌臨床分離株基因分型及藥物敏感性研究
發(fā)布時(shí)間:2017-04-27 00:06
本文關(guān)鍵詞:不同地區(qū)孢子絲菌臨床分離株基因分型及藥物敏感性研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:目的: 對(duì)我國(guó)不同地區(qū)孢子絲菌的臨床分離株進(jìn)行基因分型和系統(tǒng)進(jìn)化分析;研究雙相型真菌球形孢子絲菌分別在菌絲相(30℃、35℃)和酵母相(35℃)兩種形態(tài)下對(duì)8種抗真菌藥物的敏感性,了解不同地區(qū)球形孢子絲菌的藥物敏感性是否有差異。 方法: 1、分別選取吉林省、廣東省、四川省、北京市、江蘇省地區(qū)球形孢子絲菌株共5株,分別采用CTAB法、異硫氰酸胍沸騰法、堿裂解法、試劑盒法提取DNA,檢測(cè)其核酸濃度及純度值,并利用PCR擴(kuò)增,比較產(chǎn)物條帶亮度,確定孢子絲菌DNA最佳提取方法。 2、對(duì)43株臨床分離株的鈣調(diào)蛋白基因(CAL)進(jìn)行核酸測(cè)序,并將其序列在Genbank數(shù)據(jù)庫(kù)上比對(duì),利用MEGA5.0軟件,采用鄰接法(neighbor-joining,NJ)進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化分析。 3、采用美國(guó)臨床和實(shí)驗(yàn)室標(biāo)準(zhǔn)化研究所(CLSI)制定的微量液基稀釋法M-38A和M27-A2,并稍作修改后,對(duì)43株經(jīng)鑒定為球形孢子絲菌菌株的兩種形態(tài)(菌絲相及酵母相)在不同溫度(30℃、35℃)進(jìn)行體外藥物敏感試驗(yàn),測(cè)定的抗真菌藥物為:氟康唑、伊曲康唑、特比萘芬、酮康唑、益康唑、伏立康唑、咪康唑、兩性霉素B。計(jì)算其最小抑菌濃度(MIC),MIC50、MIC90、GM,利用統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件比較其差異性。 結(jié)果: 1、比較CTAB法、異硫氰酸胍沸騰法、堿裂解法、試劑盒法四種方法所提取的球形孢子絲菌的DNA,結(jié)果顯示堿裂解法提取的DNA純度最好。 2、使用CL1,CL2A引物對(duì)43株臨床孢子絲菌基因組DNA擴(kuò)增后可獲得約770bp左右大小的CAL基因片段,經(jīng)序列測(cè)定和比對(duì)后,確定43株臨床分離孢子絲菌均為球形孢子絲菌。系統(tǒng)進(jìn)化樹結(jié)果顯示,各地區(qū)球形孢子絲菌與文獻(xiàn)已確證的球形孢子絲菌(AM399002、AM39004、AM399005、AM399015、KC190217、KC121565、KC190218、KC190219、AM399015、GU456632)位于同一group中,且分為兩個(gè)cluster,推測(cè)球形孢子絲菌可能存在兩個(gè)亞組。 3、體外雙相不同溫度藥物敏感性試驗(yàn)結(jié)果: (1)TBF抗真菌活性最好,MIC值0.03-0.25μg/ml,GM值為0.04μg/ml,其次為MCZ、ECZ和KCZ的抗真菌活性較好,MIC值分別為0.03-1.0μg/ml、0.03-1.0μg/ml、0.03-4.0μg/ml,但是不同溫度及不同時(shí)相MIC值稍有波動(dòng); (2)統(tǒng)計(jì)學(xué)結(jié)果顯示,,不同地區(qū)藥敏結(jié)果差別均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.01)。菌絲相不同溫度(30℃、35℃)及酵母相35℃MIC值差別有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05),菌絲相的MIC值較酵母相的高,其中MIC值菌絲相35℃介于菌絲相30℃和酵母相之間。 結(jié)論: 1、堿裂解法是一種適于球形孢子絲菌DNA提取的簡(jiǎn)便方法。 2、中國(guó)各個(gè)省市地區(qū)均以球形孢子絲菌為主要致病菌種,多數(shù)來(lái)源于環(huán)境,球形孢子絲菌的基因型別無(wú)明顯地區(qū)差異。 3、不同地區(qū)球形孢子絲菌對(duì)TBF最為敏感,其次為MCZ、ECZ、KCZ和ICZ,而對(duì)FCZ、VCZ及AMB都顯示出了耐藥性,地區(qū)差異并不明顯。球形孢子絲菌體外藥敏試驗(yàn)受溫度和時(shí)相影響,除TBF外,菌絲相MIC值普遍較酵母相高,其中菌絲相30℃MIC值最高,依次為菌絲相35℃、酵母相35℃。
【關(guān)鍵詞】:球型孢子絲菌 鈣調(diào)蛋白基因 藥物敏感性試驗(yàn)
【學(xué)位授予單位】:吉林大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:R440;R756
【目錄】:
- 前言4-5
- 中文摘要5-7
- Abstract7-14
- 第1章 緒論14-15
- 第2章 綜述15-21
- 2.1 申克孢子絲菌復(fù)合體的基因分型15-19
- 2.1.1 基因分型與地理分布的關(guān)系17
- 2.1.2 基因分型和臨床型別的關(guān)系17-18
- 2.1.3 基因分型和藥物敏感性關(guān)系18-19
- 2.2 展望19-21
- 第3章 球形孢子絲菌基因組 DNA 提取方法優(yōu)化21-30
- 3.1 材料與方法21-24
- 3.1.1 實(shí)驗(yàn)材料21-22
- 3.1.2 實(shí)驗(yàn)方法22-24
- 3.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果24-28
- 3.2.1 DNA 濃度及純度24-27
- 3.2.2 PCR 擴(kuò)增27
- 3.2.3 瓊脂凝膠電泳27-28
- 3.3 小結(jié)28
- 3.4 討論28-30
- 第4章 不同地區(qū)孢子絲菌的基因分型和系統(tǒng)進(jìn)化分析30-38
- 4.1 材料與方法30-31
- 4.1.1 實(shí)驗(yàn)材料30
- 4.1.2 實(shí)驗(yàn)方法30-31
- 4.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果31
- 4.3 討論31-38
- 第5章 不同地區(qū)球形孢子絲菌藥物敏感性試驗(yàn)38-48
- 5.1 材料與方法38-42
- 5.1.1 實(shí)驗(yàn)材料38-39
- 5.1.2 實(shí)驗(yàn)方法39-42
- 5.2 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法42-43
- 5.3 結(jié)果43-47
- 5.3.1 43株球形孢子絲菌菌絲相及酵母相藥敏結(jié)果43
- 5.3.2 43株球形孢子絲菌不同地區(qū)藥敏結(jié)果MIC值比較43
- 5.3.3 43株球形孢子絲菌雙相、不同溫度藥敏結(jié)果MIC值比較43-47
- 5.4 討論47-48
- 第6章 結(jié)論48-49
- 參考文獻(xiàn)49-55
- 作者簡(jiǎn)介及在學(xué)期間所取得的科研成果55-56
- 致謝56
【參考文獻(xiàn)】
中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條
1 白永宏;陳國(guó)梁;閆冬;張向前;;幾種食用菌子實(shí)體總DNA提取方法的比較研究[J];安徽農(nóng)業(yè)科學(xué);2011年19期
2 夏建新;王延龍;王平凡;張鳳華;張民夫;金學(xué)洙;;皮膚播散性孢子絲菌病1例[J];臨床皮膚科雜志;2006年11期
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4 譚靜文;劉偉;萬(wàn)U
本文編號(hào):329496
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