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腫瘤壞死因子-α啟動子區(qū)單核苷酸多態(tài)性與新疆維吾爾族白癜風相關(guān)研究

發(fā)布時間:2020-11-13 21:45
   目的:檢測新疆維吾爾族白癜風中腫瘤壞死因子(TNF)-α基因啟動子區(qū)rs1799724(-857)位點C/T、rs1800630(-860)位點C/A和rs1799964(-1031)位點T/C多態(tài)性,并探討TNF-α基因啟動子區(qū)rs1799724、rs1800630和rs1799964位點多態(tài)性與新疆維吾爾族白癜風發(fā)病的相關(guān)性。方法:研究對象均為新疆維吾爾族,分為白癜風組和健康對照組共兩組,其316例白癜風組(男140例,女176例)和健康對照組(男199例,女131例)。分別采取外周抗凝血提取全血基因組DNA和基因測序法方法,檢測TNF-α基因啟動子區(qū)rs1799724、rs1800630和rs1799964位點多態(tài)性,通過測序法讀取個體樣本基因型,應(yīng)用SPSS17.0統(tǒng)計軟件進行分析,比較白癜風組與健康對照組之間、白癜風組臨床表型之間的基因型和等位基因頻率分布的情況,組間比較采用卡方檢驗。結(jié)果:1.新疆維吾爾族白癜風組和健康對照組中TNF-α基因啟動子區(qū)rs1799964位點多態(tài)性存在TT(61.07%,60.61%)、TC(35.12%,33.33%)、CC(3.80%,6.60%)三種基因型和T(78.64%,77.27%)、C(21.36%,22.72%)兩種等位基因;TNF-α基因啟動子區(qū)rs1800630位點多態(tài)性存在CC(68.67%,72.12%)、CA(30.38%,26.06%)、AA(0.95%,1.81%)三種基因型和C(83.86%,85.15%)、A(16.14%,14.85%)兩種等位基因;TNF-α基因啟動子區(qū)rs1799724位點多態(tài)性存在CC(72.15%,70.0%)、CT(25.63%,26.97%)、TT(1.10%,3.03%)三種基因型和C(84.97%,83.48%)、T(15.03%,16.52%)兩種等位基因。2.TNF-α基因啟動子區(qū)rs1799964、rs1800630、和rs1799724位點多態(tài)性的基因型和等位基因頻率分布在新疆維吾爾族白癜風組和健康對照組兩組間比較,差異無統(tǒng)計學意義(P均0.05)。3.TNF-α基因啟動子區(qū)rs1799964和rs1800630位點多態(tài)性的基因型和等位基因頻率在新疆維吾爾族白癜風組臨床表型組間比較,均無顯著差異(P均0.05);而rs1799724位點CT+TT基因型在局限型組明顯高于其它種類型(散發(fā)型、泛發(fā)型、肢端型)組(χ2=22.889,P0.05),等位基因T在局限型組明顯高于其它種類型(散發(fā)型、泛發(fā)型、肢端型)組(χ2=22.651,P0.05);rs1799724位點CT+TT基因型在進展期、有家族史組顯著高于穩(wěn)定期、無家族史組(χ2=36.114,P0.05,OR=5.035,95%CI:2.899~8.743;χ2=15.527,P0.05,OR=5.644,95%CI:2.189~14.651),等位基因T在進展期、有家族史組顯著高于穩(wěn)定期、無家族史組(χ2=35.109,P0.05,OR=3.691,95%CI:2.353~5.790;χ2=2.390,P0.05,OR=12.995,95%CI:1.822~9.999)。結(jié)論:⑴新疆維吾爾族人群中存在TNF-α基因啟動子區(qū)rs1799724、rs1800630、rs1799964位點多態(tài)性,且兩組間比較均無差異性。⑵TNF-α基因啟動子區(qū)rs1799724等位基因T可能是新疆維吾爾族人群進展期、局限型、有家族史白癜風患者的遺傳易感基因。⑶TNF-α基因啟動子區(qū)rs1800630、rs1799964位點多態(tài)性與新疆維吾爾族白癜風患者發(fā)病無相關(guān)性。
【學位單位】:石河子大學
【學位級別】:碩士
【學位年份】:2018
【中圖分類】:R758.41
【部分圖文】:

序列,引物,點位,片段


圖 1-1 DNA 擴增產(chǎn)物 488bp 片段 (Y 顯示三位點位置,引物位置標黃)Fig. 1-1DNAamplification product 488bp fragment (Y shows the position of the three sites, theprimer position is yellow)表 1 TNF-α rs1799964、rs1800630、rs1799724 基因引物序列Tab. 1 TNF-α rs1799964, rs1800630, rs1799724 gene primer sequences

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對照組 DNA-PCR 擴增產(chǎn)物電泳圖 488bp

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圖 1-3: 白癜風組 DNA-PCR 擴增產(chǎn)物電泳圖 488bpgure 1-3: the vitiligo group DNA-PCR amplification product electro964、 rs1800630、 rs1799724 位點產(chǎn)物多態(tài)性分
【參考文獻】

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本文編號:2882689

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