REL、TNIP1基因多態(tài)性及負(fù)性情緒與銀屑病相關(guān)性研究
【學(xué)位授予單位】:南方醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號(hào)】:R758.63
【圖文】:
邐第二部分REL、TNIP1基因多態(tài)性及負(fù)性情緒與銀屑病相關(guān)性研究邐逡逑片段的PCR(Long-Range邋Polymerase邋Chain邋Reaction,LR-PCR)擴(kuò)增出整個(gè)基因片逡逑段,然后把LR_PCR產(chǎn)物稀釋100倍后再作為DNA的模板,進(jìn)行外顯子的擴(kuò)增。逡逑1.2.7.2.2連接酶檢測(cè)反應(yīng)(ligase邋detection丨'eaction,LDR)原理和測(cè)序分型原理逡逑LDR的原理是使用高溫連接酶來(lái)識(shí)別基因多態(tài)性的位點(diǎn)。如果高溫連接酶逡逑檢測(cè)到DNA和互補(bǔ)的兩條寡聚核苷酸接頭對(duì)應(yīng)處存在著基因點(diǎn)突變類型的堿基逡逑錯(cuò)配,那么連接反應(yīng)就不能進(jìn)行^321.逡逑如圖1-2:右邊的探針和模板有一個(gè)堿基不能配對(duì),因此,連接反應(yīng)不能進(jìn)逡逑行,所以沒(méi)有連接產(chǎn)物;左邊的探針和模板DNA完全的互補(bǔ),所以能進(jìn)行連逡逑接反應(yīng)。通過(guò)溫度控制循環(huán),該特異性連接反應(yīng)可以反復(fù)的進(jìn)行,一直達(dá)到線逡逑性擴(kuò)增的效果。逡逑
逡逑如圖1-3:檢測(cè)結(jié)果說(shuō)明,左邊位點(diǎn)即突變位點(diǎn)一,是A/C雜合子;右邊逡逑位點(diǎn)即突變位點(diǎn)二,是T純合子。逡逑a-邐<】!物邋2逡逑邐邋—*邋邋邐P櫹楸荊模灣義稀昵柏危危矗沖義希懾澹媯椋歟酰歟歟椋穡歟澹澹潁錚翦義襄危垮文康捏遙繞渝五五五五義襄危咤魏恢壞鬩誨五?]辶x希停酰歟簦椋穡歟澹澹蹋模隋義希臀壞鬩誨澹迷雍獻(xiàn)櫻粒緬澹╁蝁>變位:點(diǎn)二(托合子T邋)逡逑?邋邐邐邐邋3f邐邐邐邐邋3r逡逑邐1邋邐禽邋-^5?光探計(jì)邐邐£邐1逡逑G邐A逡逑UES?邐LDPkSJm逡逑7邐!,逡逑T邋|逡逑 ̄!邐"1連接產(chǎn)物邐j4邐k逡逑丨丨■丨丨■丨—一—*邐」長(zhǎng)度不間邐太邐^—★逡逑t邋?n,序儀檢測(cè)逡逑ir逡逑.^邐邐逡逑圖1-3:測(cè)序分型原理逡逑Fig.邋1-3邋The邋principle邋of邋genotyping邋by邋sequencing逡逑1.2.7.2.3多重PCR擴(kuò)增逡逑A在PCR的薄壁管中,配制20W的多重PCR體系:10mMTris-HCl(pH7.4),逡逑2.OmM邋MgC12,50mM邋KC1,0.5|iM邋Primers邋,200mM邋dNTPs,1U邋polymerase。再力口逡逑入2以基因組DNA。PCR反應(yīng)體系見(jiàn)表1-7逡逑43逡逑
圖5:電泳與Genemapper分析逡逑Fig.邋1-5邋The邋electrophoresis邋and邋Genemapper邋analysis逡逑1.3統(tǒng)計(jì)學(xué)方法逡逑1.3.1整理數(shù)據(jù):將Genemapper軟件數(shù)掘分析結(jié)果得出的REL貓因多態(tài)位點(diǎn)逡逑rs702873和TNIPI基因多態(tài)位點(diǎn)rsl7728338的基因分型數(shù)據(jù),導(dǎo)入Microsoft邋Excel逡逑表中,讓研宄對(duì)象的臨床資料和基因型相對(duì)應(yīng),篩選出每個(gè)基因型及等位基因逡逑47逡逑
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