山東地區(qū)梅毒螺旋體基因分型研究
發(fā)布時(shí)間:2017-11-18 21:11
本文關(guān)鍵詞:山東地區(qū)梅毒螺旋體基因分型研究
【摘要】:背景:梅毒(syphilis)是梅毒螺旋體(Treponema Pallidum,TP)感染引起的性傳播疾病,可侵犯全身各器官(皮膚黏膜、心血管、神經(jīng)、骨骼等),臨床表現(xiàn)和轉(zhuǎn)歸差異很大,包括顯性梅毒、隱性梅毒、晚期梅毒、自然痊愈、血清固定、治療后復(fù)發(fā)等。20世紀(jì)90年代,TP Nichols菌株全基因組成功測(cè)序使得從基因分子生物學(xué)的角度研究梅毒成為可能,1998年P(guān)illay等根據(jù)TP arp基因60bp重復(fù)序列數(shù)目分析、tpr基因MseI酶切后限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性分析(RFLP)等,提出了TP[arp]/[tpr]兩基因分型方法。2010年,Marra CM等在此基礎(chǔ)上引入tp0548基因序列分析,提出了TP[arp]/[tpr]/[tp0548]三基因分型方法,進(jìn)一步提高了TP基因分型能力。多個(gè)國(guó)家和地區(qū)對(duì)TP進(jìn)行了基因分型的研究,亦有方法基因型與臨床表型的相關(guān)性研究。迄今為止,山東地區(qū)未有TP基因型的研究,因此本研究收集臨床TP DNA標(biāo)本進(jìn)行TP基因型的研究。目的:對(duì)山東地區(qū)TP臨床標(biāo)本的DNA予以分型,為梅毒病原體分子生物學(xué)研究提供依據(jù)。方法:1.收集疑似梅毒患者肛周及生殖器潰瘍標(biāo)本,提取TP DNA,經(jīng)實(shí)時(shí)熒光定量PCR證實(shí)為T(mén)P DNA;2.進(jìn)行arp、tpr、tp0548基因的擴(kuò)增,對(duì)PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行arp基因60bp重復(fù)序列數(shù)目分析、tpr基因Msel酶切后限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性分析(RFLP)、tp0548基因序列分析。結(jié)果:1.本研究收集的67份TP DNA標(biāo)本,48份確定了TP基因型。我們共發(fā)現(xiàn)arp基因6個(gè)亞型:5,10,12,14,15,18;tpr基因7個(gè)亞型b,d,e,i,j,k,p;tp0548基因亞型:f及c。山東地區(qū)TP菌株最常見(jiàn)的亞型是14d/f(39.6%,19/48),其次是14j/f(10.4%,5/48)、14b/f(8.3%,4/48)15d/f(6.3%,3/48)14k/f(4.2%,2/48)、15b/f(4.2%,2/48)和14i/f(4.2%,2/48);其他亞型各1例14p/f、15e/f、15i/f、15k/f、15p/f、18d/f、5d/f、14e/f、10d/f、12b/f。2.本研究發(fā)現(xiàn)了tp0548基因國(guó)內(nèi)外尚未報(bào)道的新的亞型(CAGGCGGCAGTGGCCGCACGCGCTGGAGGGTCCGGCGGTAATGACAACCACCCCGGCAAGGAACAGTT TCTCCAGTT),命名為“k”亞型,鑒別了TP一個(gè)新的亞型15j/k。結(jié)論:山東地區(qū)TP存在菌群多樣性,優(yōu)勢(shì)菌株基因型是14d/f。k亞型是tp0548基因新的亞型,15j/k是TP新的基因型。
【學(xué)位授予單位】:安徽醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2014
【分類(lèi)號(hào)】:R759.1
【參考文獻(xiàn)】
中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條
1 曾鐵兵,吳移謀,黃澍杰,吳志周;衡陽(yáng)和江門(mén)地區(qū)梅毒螺旋體基因分型的初步研究[J];中華皮膚科雜志;2004年12期
中國(guó)博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條
1 彭銳銳;早期梅毒的分子流行病學(xué)研究:我國(guó)多地區(qū)性病門(mén)診的橫斷面調(diào)查[D];北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院;2012年
,本文編號(hào):1201153
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