CETP基因多態(tài)性及其單體型與新疆維吾爾族、哈薩克族人群血脂異常的相關(guān)研究
發(fā)布時間:2017-09-19 07:24
本文關(guān)鍵詞:CETP基因多態(tài)性及其單體型與新疆維吾爾族、哈薩克族人群血脂異常的相關(guān)研究
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【摘要】:目的1.探討CETP基因10個位點多態(tài)性在維吾爾族、哈薩克族血脂異常與對照組中的分布以及與血脂異常、血脂脂質(zhì)間的關(guān)系;2.揭示CETP基因10個位點多態(tài)性是否存在連鎖不平衡現(xiàn)象及其單體型與維吾爾族、哈薩克族血脂異常的關(guān)系。方法:1.在現(xiàn)況調(diào)查建立的數(shù)據(jù)庫基礎(chǔ)上(哈薩克族3049人,維吾爾族5692人),隨機抽取維吾爾族、哈薩克族血脂異常者367例、345例作為血脂異常組,并從同一地區(qū)、民族人群中分別隨機抽取血脂正常個體374例、355例作為對照組;2.應用SNa Pshot SNP分型技術(shù)分別檢測所有研究對象的CETP基因10個位點多態(tài)性;3.利用SPSS 20.0統(tǒng)計軟件包對實驗數(shù)據(jù)進行統(tǒng)計學處理,主要采用χ2檢驗、t檢驗、logistic逐步回歸分析等,計算比值比(OR)及其95%可信區(qū)間。連鎖不平衡和單體型分析采用SHEsis在線軟件進行處理。結(jié)果:1.維吾爾族人群CETP基因10個SNP位點中,rs12149545、rs3764261、rs1800775、rs711752和rs708272位點基因型和等位基因頻率在血脂異常組和對照組中差異均有統(tǒng)計學意義(P均0.05);其中血脂異常組rs12149545的A等位基因、rs3764261的T等位基因、rs711752的A等位基因和rs708272的T等位基因頻率均低于對照組(P均0.05);血脂異常組rs1800775的C等位基因頻率高于對照組(χ2=7.475,P=0.006);rs289714、rs5882和rs1801706位點基因型和等位基因頻率在血脂異常組和對照組中均無差異(P均0.05);2.維吾爾族血脂異常組rs12149545的AA基因型者HDL-C水平高于GG基因型者;rs3764261的TT基因型者HDL-C水平高于GG基因型者;rs1800775的CC基因型者HDL-C水平低于AA基因型者;rs711752的AA基因型者HDL-C水平高于AG、GG基因型者;rs708272的TT基因型者HDL-C水平高于CT、CC基因型者;rs289714的CC、CT基因型者HDL-C水平低于TT基因型者;以上差異均有統(tǒng)計學意義(P均0.05)。對照組rs12149545的AG基因型者LDL-C水平明顯低于GG基因型者;rs3764261的GT基因型者LDL-C水平明顯低于GG基因型者;rs711752的AG、AA基因型者TG水平明顯低于GG基因型者,AG基因型者LDL-C水平低于GG基因型者,AA基因型者HDL-C水平高于GG基因型者;rs708272的CT基因型者TG水平低于CC基因型者,TT、CT基因型者LDL-C水平CC基因型者,TT基因型者HDL-C水平高于CC基因型者;以上差異均有統(tǒng)計學意義(P均0.05);3.維吾爾族人群,rs12149545與rs3764261,rs711752與rs708272間存在完全連鎖不平衡關(guān)系(D'=1);rs12149545與rs1800775、rs711752、rs708272、rs289714位點,rs3764261與rs1800775、rs711752、rs708272位點,rs1800775與rs711752、rs708272位點,rs1801706與rs289714、rs5882位點兩兩之間均具有強連鎖不平衡關(guān)系(D'0.8或r2≥0.33);rs3764261與rs289714,rs1800775與rs5882、rs1801706,rs1801706與rs711752、rs708272位點兩兩之間均具弱連鎖不平衡關(guān)系(0.5D'0.8);4.CETP的8個位點在維吾爾族人群中所構(gòu)建的單體型有9種,其中Hap 2-GGCGCCAG、Hap3-ATAATTAG、Hap 4-ATAATTGG、Hap 7-GGAGCTAG和Hap 8-GGAATTAG單體型頻率在血脂異常與正常對照組間的差異有統(tǒng)計學意義(P均0.05);5.哈薩克族人群CETP基因10個SNP位點基因型在血脂異常組和對照組中差異均無統(tǒng)計學意義(P均0.05);血脂異常組除了rs1800775的C等位基因頻率高于對照組,其余位點的次要等位基因頻率均低于對照組,但所有位點等位基因頻率在兩組間均無差異(P均0.05);6.哈薩克族血脂異常組rs1800775的CC基因型者TG水平明顯低于AA基因型者;rs711752的AA基因型者TG、TC、LDL-C水平均高于GG、AG基因型者;rs708272的TT基因型者TG、TC、LDL-C水平均高于CT、CC基因型者;rs5882的GG基因型者HDL-C水平低于AA基因型者;且以上差異均有統(tǒng)計學意義(P均0.05)。對照組rs12149545的AG基因型者HDL-C水平高于GG基因型者;rs3764261的GT基因型者HDL-C水平高于GG基因型者;rs711752的AA基因型者LDL-C水平低于GG基因型者;rs708272的TT基因型者LDL-C水平低于CC基因型者;以上差異均有統(tǒng)計學意義(P均0.05);7.哈薩克族人群,rs12149545與rs3764261,rs711752與rs708272,rs5882與rs1801706間存在完全連鎖不平衡關(guān)系(D'=1);rs12149545與rs1800775、rs711752、rs708272位點,rs3764261與rs1800775、rs711752、rs708272位點,rs289714與rs1801706位點兩兩間具有強連鎖不平衡關(guān)系(D'0.8或r2≥0.33);rs1800775與rs711752、rs708272、rs5882位點兩兩之間均具有弱連鎖不平衡關(guān)系(0.5D'0.8);8.CETP的8個位點在哈薩克族人群中所構(gòu)建的單體型有10種,其中Hap 6-GGAGCTAG和Hap 9-GGCGCTGG單體型頻率在血脂異常與正常對照組間的差異有統(tǒng)計學意義(P均0.05);結(jié)論:1.CETP基因10個SNP位點中,rs12149545、rs3764261、rs1800775、rs711752、rs708272等5個位點基因型多態(tài)性與新疆維吾爾族血脂異常的發(fā)病風險相關(guān);A等位基因(rs12149545)、T等位基因(rs3764261)、A等位基因(rs711752)和T等位基因(rs708272)可能是維吾爾族血脂異常的保護因素;C等位基因(rs1800775)可能是維吾爾族血脂異常的危險因素;2.維吾爾族人群中,CETP基因rs12149545和rs3764261基因型多態(tài)性與LDL-C、HDL-C水平相關(guān),rs711752和rs708272基因型多態(tài)性與TG、LDL-C、HDL-C水平相關(guān),rs1800775和rs289714基因型多態(tài)性與HDL-C水平相關(guān);3.維吾爾族CETP基因rs12149545與rs3764261,rs711752與rs708272兩兩間具有完全連鎖不平衡;4.Hap 3-ATAATTAG、Hap 4-ATAATTGG和Hap 7-GGAGCTAG單體型可能是維吾爾族血脂異常的保護因素,Hap 2-GGCGCCAG和Hap 8-GGAATTAG單體型可能是維吾爾族血脂異常的危險因素;5.CETP基因10個SNP位點基因型多態(tài)性與哈薩克族血脂異常的發(fā)病風險均無關(guān);6.哈薩克族人群中,CETP基因rs12149545和rs3764261基因型多態(tài)性與HDL-C水平相關(guān),rs711752和rs708272基因型多態(tài)性與TG、LDL-C、HDL-C水平相關(guān),rs1800775基因型多態(tài)性與TG水平相關(guān),rs5882基因型多態(tài)性與HDL-C水平相關(guān);7.哈薩克族CETP基因rs12149545與rs3764261,rs711752與rs708272兩兩間具有完全連鎖不平衡;8.Hap 6-GGAGCTAG和Hap 9-GGCGCTGG單體型可能是哈薩克族血脂異常的危險因素。
【關(guān)鍵詞】:CETP基因 維吾爾族、哈薩克族 血脂異常 基因多態(tài)性 單體型
【學位授予單位】:石河子大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2016
【分類號】:R589.2
【目錄】:
- 摘要5-8
- Abstract8-13
- 英文縮略詞13-14
- 前言14-18
- 材料與方法18-30
- 1. 材料18-20
- 2. 方法20-27
- 3. 質(zhì)量控制27-28
- 4. 統(tǒng)計學分析28-29
- 5. 技術(shù)路線29-30
- 結(jié)果30-55
- 1. 研究對象一般情況30-32
- 1.1 維吾爾族研究對象基本情況描述30-31
- 1.2 哈薩克族研究對象基本情況描述31-32
- 2. 實驗室檢測結(jié)果32-37
- 2.1 DNA提取結(jié)果32-33
- 2.2 CETP基因單核苷酸多態(tài)性檢測結(jié)果33-36
- 2.3 兩民族CETP基因10個SNP位點基因型分布36-37
- 3. Hardy-Weinberg遺傳平衡檢驗37-40
- 4. 兩民族CETP基因多態(tài)性分別在血脂異常組和正常對照組的分布比較40-43
- 4.1 維吾爾族CETP基因8個SNP位點在兩組間的分布比較40-42
- 4.2 哈薩克族CETP基因8個SNP位點在兩組間的分布比較42-43
- 5. CETP基因rs12149545、rs3764261、rs1800775、rs711752、rs708272和rs289714多態(tài)性與維吾爾族血脂異常的風險分析43-46
- 5.1 CETP基因rs12149545多態(tài)性與維吾爾族血脂異常的風險分析43-44
- 5.2 CETP基因rs3764261多態(tài)性與維吾爾族血脂異常的風險分析44
- 5.3 CETP基因rs1800775多態(tài)性與維吾爾族血脂異常的風險分析44-45
- 5.4 CETP基因rs711752多態(tài)性與維吾爾族血脂異常的風險分析45
- 5.5 CETP基因rs708272多態(tài)性與維吾爾族血脂異常的風險分析45-46
- 6. CETP基因的8個位點基因型與血脂水平比較46-49
- 6.1 維吾爾族CETP基因的8個位點基因型與血脂水平比較46-48
- 6.2 哈薩克族CETP基因的8個位點基因型與血脂水平比較48-49
- 7. CETP基因8個SNP位點連鎖不平衡及單體型分析49-55
- 7.1 維吾爾族CETP基因8個SNP位點連鎖不平衡分析50-51
- 7.2 哈薩克族CETP基因8個SNP位點連鎖不平衡分析51-53
- 7.3 維吾爾族CETP基因單體型與血脂異常易感性的關(guān)系53-54
- 7.4 哈薩克族CETP基因單體型與血脂異常易感性的關(guān)系54-55
- 討論55-65
- 1. CETP基因結(jié)構(gòu)與功能56
- 2. CETP基因多態(tài)性與血脂異常的關(guān)系56-62
- 2.1 rs12149545位點多態(tài)性與血脂異常的關(guān)系56-57
- 2.2 rs3764261位點多態(tài)性與血脂異常的關(guān)系57-58
- 2.3 rs1800775位點多態(tài)性與血脂異常的關(guān)系58-59
- 2.4 rs711752位點多態(tài)性與血脂異常的關(guān)系59-60
- 2.5 rs708272位點多態(tài)性與血脂異常的關(guān)系60-61
- 2.6 rs289714、rs5882和rs1801706位點多態(tài)性與血脂異常的關(guān)系61-62
- 3. CETP基因8個SNP位點連鎖不平衡及單體型分析62-63
- 3.1 維吾爾族CETP基因位點連鎖不平衡及單體型分析62-63
- 3.2 哈薩克族CETP基因位點連鎖不平衡及單體型分析63
- 4. 結(jié)語63-65
- 結(jié)論65-66
- 參考文獻66-70
- 文獻綜述70-77
- 參考文獻74-77
- 致謝77-78
- 作者簡介78-79
- 導師評閱表79
【參考文獻】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前1條
1 趙文華,張堅,由悅,滿青青,李紅,王春榮,翟屹,李瑩,金水高,楊曉光;中國18歲及以上人群血脂異常流行特點研究[J];中華預防醫(yī)學雜志;2005年05期
,本文編號:880312
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