本文關(guān)鍵詞：環(huán)狀RNA在系統(tǒng)性紅斑狼瘡患者中差異表達(dá)的研究

  更多相關(guān)文章： 環(huán)狀RNA circRNA芯片 系統(tǒng)性紅斑狼瘡

【摘要】：目的:應(yīng)用circRNA芯片技術(shù)分析系統(tǒng)性紅斑狼瘡患者外周血單個(gè)核細(xì)胞中環(huán)狀RNA的差異表達(dá),為進(jìn)一步探索差異性表達(dá)的環(huán)狀RNA作為SLE診斷生物標(biāo)志物及其調(diào)控機(jī)制研究奠定基礎(chǔ)。方法:10例SLE患者(SLE組)、10例類(lèi)風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎患者(RA組)及10例正常健康對(duì)照者(NC組)為實(shí)驗(yàn)對(duì)象,分別收集實(shí)驗(yàn)參與者的外周靜脈血并分離出外周血單個(gè)核細(xì)胞,提取總RNA,利用circRNA芯片技術(shù),篩查系統(tǒng)性紅斑狼瘡單個(gè)核細(xì)胞中差異性表達(dá)的環(huán)狀RNA,運(yùn)用生物信息學(xué)方法得到與環(huán)狀RNA相關(guān)的miRNA,最后運(yùn)用實(shí)時(shí)定量PCR對(duì)部分環(huán)狀RNA進(jìn)行驗(yàn)證。結(jié)果:與健康對(duì)照組相比,顯著差異性表達(dá)的環(huán)狀RNA有745種,其中182種表達(dá)上調(diào),563種表達(dá)下調(diào);與RA組相比,顯著差異性表達(dá)的環(huán)狀RNA有671種,其中225種表達(dá)上調(diào),446種表達(dá)下調(diào)。應(yīng)用實(shí)時(shí)定量PCR驗(yàn)證6種表達(dá)上調(diào)環(huán)狀RNA:hsa_circ_0007337、hsa_circ_0047891、hsa_circ_0001349、hsa_circ_0046555、hsa_circ_0046215、hsa_circ_0056536表達(dá)呈上調(diào)趨勢(shì);5種表達(dá)下調(diào)circRNA:hsa_circ_0070113、hsa_circ_0005480、hsa_circ_0001854、hsa_circ_0044468、hsa_circ_0006608表達(dá)呈下調(diào)趨勢(shì),和芯片結(jié)果一致。生物信息學(xué)提示環(huán)狀RNA可以通過(guò)與miRNA發(fā)生相互作用從而調(diào)控系統(tǒng)性紅斑狼瘡的發(fā)生和發(fā)展。結(jié)論:SLE患者單個(gè)核細(xì)胞環(huán)狀RNA的表達(dá)具有疾病特異性,顯著差異的和特異性表達(dá)的環(huán)狀RNA可作為系統(tǒng)性紅斑狼瘡潛在的診斷標(biāo)志物。此外,差異性表達(dá)的環(huán)狀RNA的生物信息學(xué)有助于系統(tǒng)性紅斑狼瘡發(fā)病機(jī)制研究,可作為機(jī)制研究的參考和補(bǔ)充。
【關(guān)鍵詞】：環(huán)狀RNA circRNA芯片 系統(tǒng)性紅斑狼瘡
【學(xué)位授予單位】：暨南大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類(lèi)號(hào)】：R593.241
【目錄】：

• 摘要3-4
• ABSTRACT4-7
• 1.前言7-15
• 1.1 circRNA研究現(xiàn)狀8-12
• 1.2 circRNA與自身免疫性疾病12-13
• 1.3 circRNA基因芯片、RT-PCR技術(shù)對(duì)SLE circRNA的綜合研究13-15
• 2.實(shí)驗(yàn)材料和方法15-25
• 2.1 臨床資料15
• 2.2 實(shí)驗(yàn)所需試劑和耗材15-16
• 2.3 實(shí)驗(yàn)所需儀器16-17
• 2.4 人外周血單個(gè)核細(xì)胞分離17-18
• 2.5 Total RNA的提取18
• 2.6 RNA質(zhì)量檢測(cè)18-20
• 2.7 標(biāo)記反應(yīng)20-21
• 2.8 標(biāo)記/擴(kuò)增的RNA的純化和標(biāo)記cRNA的質(zhì)量控制21-22
• 2.9 雜交22-23
• 2.10 芯片洗滌23-24
• 2.11 圖像掃描及數(shù)據(jù)分析24
• 2.12 實(shí)時(shí)定量PCR驗(yàn)證差異性表達(dá)circRNA24-25
• 3.結(jié)果25-47
• 3.1 Total RNA抽提與質(zhì)檢結(jié)果25-26
• 3.2 circRNA芯片檢測(cè)結(jié)果26-40
• 3.3 miRNA預(yù)測(cè)40-45
• 3.4 RT-PCR驗(yàn)證差異性circRNA45-47
• 4.討論47-50
• 5.本實(shí)驗(yàn)的不足和未來(lái)研究的方向50-52
• 6.結(jié)論52-53
• 參考文獻(xiàn)53-61
• 縮略詞表61-63
• 附錄63-65
• 致謝65

【相似文獻(xiàn)】

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