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多囊卵巢綜合征基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控關(guān)聯(lián)的生物信息分析

發(fā)布時間:2023-05-07 23:30
  目的分析多囊卵巢綜合征(PCOS)基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控關(guān)聯(lián)的生物信息。方法從整合基因表達匯編平臺中共下載PCOS患者33例及健康對照30例的皮下脂肪組織樣本轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù),比較兩組基因表達數(shù)據(jù),保留P<0.0005的1636個顯著差異基因,進行GO數(shù)據(jù)庫的功能富集分析和KEGG數(shù)據(jù)庫的生物信號通路富集分析。結(jié)果 1636個顯著差異基因富集在GO功能條目下,如在生物學(xué)過程集合中的嗜同性細胞黏附、肌絲滑動、肌肉收縮等,在細胞組分集合中的細胞質(zhì)、肌原纖維節(jié)、核質(zhì)等,在分子功能集合中的蛋白質(zhì)結(jié)合、多聚腺嘌呤RNA結(jié)合及鈣離子結(jié)合等(P<0.001)。1636個顯著差異基因富集KEGG生物信號通路,如TNF信號通路、催產(chǎn)素信號通路、Ras信號通路、環(huán)磷酸腺苷信號通路、胰島素信號通路及雌激素信號通路等(P<0.05)。結(jié)論PCOS表達基因的遺傳學(xué)變化可能通過影響卵巢發(fā)育生物學(xué)過程及卵巢發(fā)育相關(guān)的信號通路的活性,從而促進PCOS的發(fā)生。

【文章頁數(shù)】:5 頁

【文章目錄】:
資料與方法
    一、一般資料
    二、方法
        1.轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)預(yù)處理
        2.差異基因篩選
        3.功能富集分析和生物信號通路分析
    三、統(tǒng)計學(xué)處理
結(jié) 果
    一、GO功能富集
    二、KEGG生物信號通路富集
討 論



本文編號:3811541

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