第一部分基于數(shù)字基因表達譜技術(shù)篩選胰島β細胞內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激中差異表達基因目的:高血糖和高血脂等代謝紊亂可引起胰島β細胞內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激,進而激活內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激下游通路,誘導(dǎo)細胞凋亡和或出現(xiàn)細胞功能紊亂。本研究旨在探索INS-1-3細胞在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)模型中是否存在共同的差異表達基因及信號通路。方法:以正常培養(yǎng)基培養(yǎng)的INS-1-3做對照組,將毒胡蘿卜素（thapsigargin,TG,0.1μmol/L,培養(yǎng)16個小時）、衣霉素（tunicamycin,TM,2.5μg/ml,培養(yǎng)16個小時）,高糖（high glucose,HG,16.7mmol/L,培養(yǎng)12小時）+高脂（palmitic acid,PA,0.3mmol/L,培養(yǎng)12小時）建立內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激模型,并分別命名為TG組、TM組及HG+PA組。待造模成功,收取細胞提取RNA。利用數(shù)字基因表達譜技術(shù)分別篩選三組內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激模型與對照組相比差異表達的基因。對篩選出的基因進一步進行功能注釋及Gene Oncology（GO）富集分析、Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes（KEGG）pathway富集分析及蛋白互作網(wǎng)... 

【文章來源】：河北醫(yī)科大學(xué)河北省

【文章頁數(shù)】：122 頁

【學(xué)位級別】：博士

【部分圖文】：

信息分析流程圖

31圖 2 GRP78 及 CHOP mRNA 表達水平Fig.2 A quantitative analysis of GRP78 and CHOP mRNA levels.RS was induced by exposure cells to thapsigargin (TG, 0.1μmol/L),nicamycin (TM, 2.5μg/mL) or palmitic acid (PA, 0.3mmol/L) +high glucoseHG, 16.7 mmol/L). *,#P＜0.05 compared to control.

測序質(zhì)量評估Fig.3Qualityassessmentofreads

【參考文獻】：
期刊論文
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本文編號：3410048