背景:糖尿病足（Diabetic foot,DF）是指糖尿病（Diabetic mellitus,DM）患者由于合并神經(jīng)病變及各種不同程度末梢血管病變而導致下肢感染、潰瘍形成和（或）深部組織的破壞,其具有較高的患病率、致殘率和死亡率,然而目前DF的發(fā)病機制仍不明確。隨著轉錄組測序（RNA Sequencing,RNA-Seq）技術的不斷發(fā)展,越來越多疾病的發(fā)病機制逐漸被發(fā)現(xiàn),測序技術也逐漸成為熱點。RNA-Seq技術可以全面快速的獲取某一物種特定器官或組織在某一狀態(tài)下的幾乎所有轉錄本,包括編碼RNA（messenger RNA,mRNA）和非編碼RNA（non-coding RNA,ncRNA）。ncRNA不編碼蛋白質,在RNA水平上即可發(fā)揮各種生物學功能的RNA,而競爭性內源RNA（competing endogenous RNA,ceRNA）作為一種假說揭示了RNA間相互作用的新機制。近年來,也有研究表明ceRNA調控機制揭示了疾病發(fā)病機制及治療的新方向。RNA-seq技術在多種疾病的分子病因學研究中取得了一系列的成果,但是在DF中相關研究尚缺乏。因此有望通過RNA-Seq技術分析... 

【文章來源】：南昌大學江西省 211工程院校

【文章頁數(shù)】：60 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
abstract
第1章 引言
    1.1 糖尿病足的概述
    1.2 轉錄組測序的概述
    1.3 ceRNA的概述
第2章 材料與方法
    2.1 編碼RNA建庫及測序流程
        2.1.1 研究材料
        2.1.2 建庫實驗步驟
        2.1.3 上機測序
        2.1.4 mRNA建庫及測序實驗流程
    2.2 非編碼RNA建庫及測序流程
        2.2.1 標本采集、總RNA的提取、質量檢測
        2.2.2 離子打斷
        2.2.3 cDNA的合成
        2.2.4 文庫質檢、文庫的稀釋與混合
        2.2.5 利用Hiseq平臺上機測序
    2.3 測序結果按照如下流程進行生物信息分析
第3章 結果
    3.1 編碼RNA測序結果
        3.1.1 研究對象的臨床特征
        3.1.2 質量評估
        3.1.3 基因差異表達分析
        3.1.4 差異表達基因GO功能分析
        3.1.5 差異表達基因KEGG功能分析
    3.2 非編碼RNA測序結果
        3.2.1 測序質量評估
        3.2.2 miRNA表達量
        3.2.3 lncRNA的篩選情況
        3.2.4 miRNA、lncRNA差異表達分析
        3.2.5 miRNA、lncRNA靶基因預測
        3.2.6 miRNA、lncRNA靶基因GO功能分析
        3.2.7 miRNA、lncRNA靶基因KEGG功能分析
        3.2.8 microRNA結合位點分析
    3.3 糖尿病足發(fā)病機制可能的ce RNA機制
        3.3.1 lncRNA差異表達分析
        3.3.2 miRNA差異表達分析
        3.3.3 mRNA差異表達分析
        3.3.4 對lnc RNA-mi RNA-m RNA做WGCNA共表達分析,尋找其網(wǎng)絡關系
    3.4 MMP9 抑制糖尿病足的發(fā)生發(fā)展
第4章 討論
第5章 結論
第6章 展望與不足
    6.1 創(chuàng)新性
    6.2 不足
致謝
參考文獻
攻讀學位期間的研究成果
綜述
    參考文獻



本文編號：3197299