背景:自身免疫性疾病是臨床實踐中的嚴重挑戰(zhàn)之一。而這類人群較健康人群更易感染,但自身免疫浸潤導致的間質性肺炎有時很難與自身免疫疾病合并重癥肺炎區(qū)分開來,并且在這類人群中,抗生素的使用相對較強,可能導致病原菌的檢出率較低,這項回顧性研究旨在研究與傳統(tǒng)檢測方法相比,支氣管肺泡灌洗液(BALF)的宏基因組二代測序技術(mNGS)是否可用于鑒定自身免疫疾病合并重癥肺炎患者中的致病病原體。方法:本研究為單中心回顧性研究,納入對象為2017年4月至2019年2月浙江大學醫(yī)學院附屬第二醫(yī)院濱江院區(qū)綜合重癥監(jiān)護室住院的自身免疫病合并重癥肺炎的成人患者。并接受纖維支氣管鏡檢查獲得BALF樣本以幫助發(fā)現(xiàn)致病病原體。將BALF標本分成兩個相等的部分,一份用于傳統(tǒng)檢測方法。另一份外送測序公司行mNGS測序。結果:共納入17名患者(7名男性;平均年齡55歲)的18份肺泡灌洗液樣本,共15份標本(83.3%)為mNGS陽性。6個標本(33.3%)是傳統(tǒng)檢測方法陽性。6個傳統(tǒng)檢測方法陽性樣本也是mNGS陽性,其中5個一致被mNGS鑒定為異常值,只有1例標本的mNGS和傳統(tǒng)檢測方法結果矛盾。幾乎所有的病毒和肺孢子蟲都只在mNGS中獲得。使用傳統(tǒng)檢測方法中檢測到6種細菌,1種病毒和1種真菌,mNGS檢測到11種細菌,1種衣原體,4種真菌和6種病毒。與傳統(tǒng)檢測方法相比,mNGS在檢測病原體方面顯示出顯著更高的陽性率(33.3%對83.3%,p=0.006),其中mNGS在病毒和真菌的檢出方面陽性率顯著升高,病毒(5.6%vs 38.9%,p=0.041),真菌(11.1%vs 50.0%,p=0.027)。但在細菌的檢出方面則無顯著差異(27.8%vs50.0%,p=0.305)。結論:對于自身免疫性疾病合并重癥肺炎的患者來說,mNGS鑒定肺泡灌洗液中特殊病原體如衣原體以及真菌和病毒方面具有獨特的優(yōu)勢。
【學位單位】：浙江大學
【學位級別】：碩士
【學位年份】：2019
【中圖分類】：R593.2;R563.1
【部分圖文】：

法與ｍＮＧＳ結果矛盾，其中傳統(tǒng)檢測方法檢出金黃色葡萄球菌以及患者咽拭子的??甲型流感核酸陽性，而ｍＮＧＳ僅鑒定出金黃色葡萄球菌，而未能鑒定出甲型流感??病毒，可能與病毒的衣殼較難裂解相關（圖１）。??表２所有患者的ｍＮＧＳ和傳統(tǒng)檢測方法結果??ｉＳ？?傳統(tǒng)檢測方法?ｍＮＧＳ?序列數(shù)??華大－１?白色念珠菌?耶氏肺孢子蟲￣￣４?Ｓ??華大－２?陰性?肺炎克雷伯菌?５?低??華大－３?白色念珠菌?ＥＢ病毒?８７９?高??大腸埃希菌?巨細胞病毒?９?低??耶氏肺孢子蟲?１６３５?高??白色念珠菌?３２３?中??光滑念珠菌?１８?低??華大－４?陰性?流感嗜血桿菌?２９?低??ＥＢ病毒?８０?低??耶氏肺孢子蟲?９５?低??華大－５?肺炎克雷伯菌?肺炎克雷伯菌?１３?低??鮑曼不動桿菌?５７?低??銅綠假單胞菌?１３?低??ＨＳＶ１?１２３０６?高??華大－６?陰性?ＶＺＶ?１１０９２?高??８??
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本文編號：2865437