本文選題：Human + pegivirus-1(HPgV-1)��； 參考：《昆明理工大學》2017年碩士論文

【摘要】：Humanpegiviruses(HPgVs)屬于黃病毒科pegivirus屬,單股正鏈RNA病毒。目前,pegivirus屬中可以感染人類的病毒有兩種,分別為HPgV-1和HPgV-2。其中,HPgV-1曾被稱為庚型肝炎病毒(Hepatitis G Virus,HGV)或 GB Virus C(GBV-C)。HPgV-1 的感染不會引起人類的肝損傷,但與HIV-1合并感染會延緩艾滋病患者的疾病進程,并且不同基因型的HPgV-1對艾滋病的疾病影響存在明顯差異。最近,通過高通量測序技術(shù)發(fā)現(xiàn)了HPgV-2,該病毒主要在艾滋病合并丙肝(HCV)的患者中流行。云南省是我國艾滋病流行的高發(fā)區(qū)之一,云南地區(qū)HIV-1感染者中HPgVs的流行及其對艾滋病病程的影響如何,相關(guān)研究較少。基于此,本論文就云南地區(qū)HIV-1感染者中HPgV-1和HPgV-2的分子流行病學進行了研究。首先,我們針對云南省16個地州的1062例艾滋病患者,包括靜脈吸毒人群(injecting drug users,IDUs)460例,異性性傳播人群602例,進行了 HPgV-1 RNA的檢測。結(jié)果發(fā)現(xiàn)HPgV-1 RNA 感染率為 23.4%(248/1062),其中 HPgV-1 在 IDUs 中的感染率(28.5%,131/460)顯著高于異性傳播人群(19.4%,117/602)(P0.05)。我們進一步通過E2區(qū)同源關(guān)系進化樹分析發(fā)現(xiàn),云南地區(qū)HIV-1感染者中HPgV-1 7型為主要基因型占55.7%(118/212),其次為 3 型 34.9%(74/212),4 型 4.7%(10/212),2 型 3.3%(7/212)和未知基因型 1.4%(3/212)。從傳播方式來看,7型主要流行于IDUs中(73.3%,85/116),而3型則主要流行于異性性接觸人群中(54.2%,52/96)。此外,我們對主要流行的3型和7型HPgV-1患者的臨床指標進行了統(tǒng)計分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)合并感染7型HPgV-1的艾滋病患者具有較低的HIV-1病毒載量(log = 3.87 ± 0.59 vs.4.01 ± 0.64,p = 0.038)和較高的CD4+細胞數(shù)量(cells/uL = 338±176 vs.285 ± 180,p = 0.025),表明7型HPgV-1具有較好地延緩HIV-1疾病進程的作用。其次,基于HPgV-1 4型、6型和7型具有相同的地域分布特征,為了進一步研究這三種基因型的進化和起源關(guān)系,我們成功獲得了 13條4型和7型HPgV-1全長序列。經(jīng)Split network、同源進化樹、遺傳距離、核苷酸同源性以及PCOORD分析,結(jié)果表明4、6和7型具有相同的進化和起源,屬于同一種基因型,因此,我們暫時將這三種基因型統(tǒng)一命名為HPgV-1基因4型。此外,通過PHI和Bootscanning重組分析,我們發(fā)現(xiàn)并確認了兩例HPgV-1全長重組株。最后,我們對547例HIV感染者,包括HIV-1單感染260例,HIV-1/HCV雙重感染192例和HIV-1/HCV/HPgV-1三重感染95例,進行了 HPgV-2 RNA的檢測。結(jié)果發(fā)現(xiàn),HPgV-2的感染率為0.91%(5/547),其中在以上三種人群中的感染率分別為0.00%(0/260)、0.52%(1/192)和4.21%(4/95)。另外,我們成功擴增并獲得4條HPgV-2全長基因組序列,并經(jīng)全長序列比對分析發(fā)現(xiàn),HPgV-2核苷酸序列保守性(92.0%,0.058)分別高于 HPgV-1(87.5%,0.140)和 HCV(66.54%,0.423)。臨床數(shù)據(jù)統(tǒng)計發(fā)現(xiàn),HPgV-2 的感染對艾滋病患者的肝功指標ALT和AST無影響。綜上所述,本論文闡明了云南地區(qū)艾滋病人群中HPgV-1的感染率和基因型分布特征,發(fā)現(xiàn)7型HPgV-1可能具有較好地延緩HIV-1疾病進程的作用,提出了新的HPgV-1分型的標準。此外,我們還闡明了 HPgV-2主要在HIV-1/HCV感染人群中流行,描述了 HPgV-2全長基因序列特征。該結(jié)果將為進一步深入開展HPgVs的多樣性對艾滋病病程的影響機制研究提供了重要科學依據(jù)。
[Abstract]:Human pegiviruses ( HPgVs ) belong to the genus pegivirus of the family Flaviviridae , single strand positive strand RNA virus . At present , the infection rate of HPgV - 1 in IDUs is 55.7 % ( 118 / 212 ) , the infection rate of HPgV - 1 in IDUs is 55.7 % ( 118 / 212 ) , and the infection rate of HPgV - 1 in IDUs is 34.9 % ( 74 / 212 ) , type 4 4.7 % ( 10 / 212 ) , type 2 3.3 % ( 7 / 212 ) and unknown genotype 1.4 % ( 3 / 212 ) . Type 3 was mainly prevalent in heterosexual contact population ( 54.2 % , 52 / 96 ) . The results showed that the infection rate of HPgV - 1 was 0.91 % ( 0 / 260 ) , 0.52 % ( 1 / 192 ) and 4.21 % ( 4 / 95 ) respectively . In conclusion , the infection rate and genotype distribution of HPgV - 1 in HIV - 1 / HCV infected population were discussed . The results showed that HPgV - 1 might have a better effect on HIV - 1 disease progression , and the characteristics of HPgV - 2 gene sequence were described .
【學位授予單位】：昆明理工大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2017
【分類號】：R512.91

【參考文獻】

相關(guān)期刊論文 前1條

1 ;High risk populations and HIV-1 infection in China[J];Cell Research;2005年Z1期

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本文編號：2117648