2型糖尿病microRNA表達譜及其信號通路研究
本文關(guān)鍵詞: 2型糖尿病 動物模型 microRNA 出處:《華南理工大學》2015年碩士論文 論文類型:學位論文
【摘要】:2型糖尿病(Type 2 diabetes,T2D)是一種世界性廣泛流行的代謝性紊亂疾病,常伴隨有胰島素分泌不足,胰島素抵抗,高血糖癥以及脂代謝紊亂等癥狀。T2D患者的數(shù)目每年呈現(xiàn)上升的趨勢。microRNA(miRNA)是一種短片段的RNA,能夠特異性結(jié)合到目標基因的3’UTR區(qū)域,使目標基因表達受到抑制。目前的研究逐漸表明,miRNA與多種疾病的產(chǎn)生具有相關(guān)性。通過對miRNA在T2D病理過程中的具體調(diào)控機制的探究,有助于為日后的對T2D的醫(yī)療診斷和治療打下基礎(chǔ)。本研究主要使用高通量測序、比較基因組學、生物信息學的方法,嘗試闡述miRNA在T2D中的作用及調(diào)控機制。首先,采用食蟹猴作為動物模型,利用高通量測序?qū)ζ胀ㄎ故车腡2D猴和高脂高糖喂食誘導的T2D猴進行全血miRNA的表達譜分析。通過統(tǒng)計分析,篩選出24個差異表達的miRNA。再經(jīng)過進一步的篩選,發(fā)現(xiàn)miR-182在人、大鼠、小鼠和食蟹猴外周血、肌肉、脂肪、肝臟和胰腺中均具有穩(wěn)定下調(diào)的表達趨勢。通過對miR-182及已驗證靶基因的信號通路分析,推測miR-182的下調(diào)表達是導致胰島素釋放不足和胰島素抵抗的原因之一。另外論文下載了目前為止已發(fā)表的T2D的27組miRNA表達譜和95組基因表達譜數(shù)據(jù),利用miRNA靶基因數(shù)據(jù)庫,對兩種類型的表達譜數(shù)據(jù)進行整合分析,建立miRNA-靶基因配對譜,最后進行功能聚類分析。結(jié)果顯示miRNA的差異表達具有物種以及組織差異性的。通過功能聚類分析結(jié)果表明miR-150,miR-15b以及miR-34a,這些miRNA與胰島素的釋放不足,胰島素抵抗以及細胞損傷有關(guān),推測這3個miRNA可能對T2D致病進程具有重要作用。本論文的研究對T2D的診斷治療有重要的意義,也為疾病機制研究提供了新思路。
[Abstract]:Type 2 diabetes mellitus type 2 diabetes mellitus (T2D) is a worldwide and prevalent metabolic disorder with insulin deficiency and insulin resistance. The number of patients with hyperglycemia and dyslipidemia. T2D patients show an increasing trend each year. MicroRNAs miRNAs are short fragments of RNAs that specifically bind to the 3 UTR region of the target gene. The expression of target gene was inhibited. Recent studies have shown that miRNAs are associated with many diseases. By exploring the specific regulatory mechanism of miRNA in T2D pathology, This study mainly uses high-throughput sequencing, comparative genomics, bioinformatics methods to explain the role and regulatory mechanism of miRNA in T2D. The full-blood miRNA expression profiles of normal and high-fat high-sugar fed T2D monkeys were analyzed by high throughput sequencing. 24 differentially expressed miRNAs were screened. Further screening showed that miR-182 was found in peripheral blood, muscle and fat of human, rat, mouse and crab monkey. There was a tendency of down-regulation in liver and pancreas. The signal pathway of miR-182 and verified target gene were analyzed. It is speculated that the down-regulation of miR-182 is one of the causes of insulin deficiency and insulin resistance. In addition, 27 miRNA expression profiles and 95 gene expression profiles of T2D and 95 gene expression profiles have been downloaded, and the miRNA target gene database has been used. The miRNA-target gene pairing spectrum was established by integrating the data of two types of expression profiles. Finally, functional cluster analysis was carried out. The results showed that the differential expression of miRNA was different in species and tissue. The results of functional cluster analysis showed that miR-150 miR-15b and miR-34a, these miRNA were associated with insufficient insulin release, insulin resistance and cell damage. It is speculated that these three miRNA may play an important role in the pathogenesis of T2D. The study in this paper is of great significance to the diagnosis and treatment of T2D and provides a new idea for the study of the pathogenesis of T2D.
【學位授予單位】:華南理工大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2015
【分類號】:R587.1
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,本文編號:1542824
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