本文關(guān)鍵詞： 類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎 冠心病 單核苷酸多態(tài)性 高分辨率熔解曲線　出處：《蘭州大學(xué)》2015年碩士論文　論文類型：學(xué)位論文

【摘要】：目的自主建立RTKN2.LDLR.APOB.APOC1、ARL15、HLA-DMA、NFKB2、 CRP、ACE、NOS3、ENPP1和IQSEC1基因15個(gè)單核苷酸多態(tài)性(SNP)位點(diǎn)的臨床常規(guī)化分子診斷方法,并探討15個(gè)SNP位點(diǎn)與蘭州地區(qū)漢族人群類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎(RA)和冠心病(CHD)易感及血清學(xué)指標(biāo)的相關(guān)性。方法基于高分辨熔解技術(shù)(HRM)建立類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎7個(gè)關(guān)聯(lián)基因RTKN2. LDLR、APOB、APOC1、ARL15、HLA-DMA 和 NFKB2的8個(gè)單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism,SNP)位點(diǎn)(rs3125734 CT.rs688 CT.rs693 CT. rs4420638 AG.rs255758 AC.rs1063478 CT、rs397514331 -/A 和rs397514332CT)和冠心病5個(gè)關(guān)聯(lián)基因CRP、ACE、NOS3、ENPP1 和 IQSEC1 的7個(gè)SNP位點(diǎn)(rs1205 CT.rs4305 AG.rs4353 GA.rs7830 AC.rs12528076 CT. rs939899 GA 和 rs1108640 GC)的聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)-高分辨熔解曲線(PCR-HR M)檢測(cè)方法,應(yīng)用于588例RA患者與200例健康對(duì)照和260例CHD患者與238例健康對(duì)照的臨床標(biāo)本的檢測(cè)。以測(cè)序金標(biāo)準(zhǔn)驗(yàn)證其檢測(cè)正確性和臨床適用性。通過(guò)病例對(duì)照分析,篩選蘭州地區(qū)漢族人群RA和CHD的易感SNP位點(diǎn),并進(jìn)行其血清學(xué)指標(biāo)RF和抗CCP抗體的相關(guān)性分析。結(jié)果全部標(biāo)本PCR-HRM擴(kuò)增后均能基因分型,經(jīng)直接測(cè)序金標(biāo)準(zhǔn)驗(yàn)證,其基因分型正確率達(dá)100%。(1)RA病例對(duì)照分析顯示：① rs3125734 CT和rs688CT位點(diǎn)基因型和等位基因頻率在RA組與對(duì)照組間的差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(x2=6.144,P=0.046；x2=5.793,P=0.016；x2=8.582,P=0.014:x2=5.409,P=0.020)；rs255758 AC和rs1063478 CT基因型頻率在兩組間的差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(x2=6.877,P=o.032；x2=6.893,P=0.032).②性別分層后僅rs3125734 CT位點(diǎn)基因型和等位基因頻率在男性組間差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=6.527,P=0.011；x2=5.899,P=0.015)；rs688 CT和rs255758 AC基因型和等位基因頻率女性組間差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(x2=8.916,P=0.012；x2=7.180,P=0.007；x2=10.788,P=0:006； x2=4.235,P=0.039)。③按血清學(xué)分層后rs3125734 CT等位基因頻率在CCP陽(yáng)性RA組與健康對(duì)照組間差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=4.708,P=0.030),其基因型頻率和等位基因頻率在RF陽(yáng)性RA組與對(duì)照組間差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=7.246,P=0.027；x2=6.370,P=0.012)；rs4420638 AG位點(diǎn)基因型頻率在RF陰性RA組與對(duì)照組間差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=4.105,P=0.043)。④風(fēng)險(xiǎn)回歸對(duì)各位點(diǎn)突變基因型擬合二元logistic回歸分析發(fā)現(xiàn)在RA組與對(duì)照組rs3125734 CT突變雜合基因型CT可增加RA的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(χ2=4.011,P=0.045,OR=1.613),rs688CT突變純合基因型TT可降低RA的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(x2=6.853,P=0.009,OR=0.273), rs255758 AC突變雜合基因型AC可降低RA的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(χ2=6.641,P=0.010,OR=0.640):在男性RA組和男性對(duì)照組rs1063478 CT突變雜合基因型CT可增加RA的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(x2=6.029,P=0.014,OR=3.204)；在女性RA組和女性對(duì)照組rs688 CT和rs255758 AC突變純合基因型TT/AC可降低RA的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(x2=5.704,P=0.017,OR=0.244；x2=9.410,P=0.002,OR=0.531)；在RF陽(yáng)性RA組與對(duì)照組rs3125734 CT突變雜合基因型CT可增加RA的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(x2=4.110,P=0.043,OR=1.853)；在RF陰性RA組與對(duì)照組rs4420638 AG突變雜合基因型AG可增加RA的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(χ2=4.046,P=0.044,OR=1.799)。⑤RA病例組血脂水平分析顯示：rs693 CT和rs4420638 AG位點(diǎn)與HDL-C水平之間存在統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(x2=4.762,P=0.029,OR=3.385；x2-8.226,P=0.004,OR=5.416),通過(guò)對(duì)rs693 CT和rs4420638 AG位點(diǎn)的突變基因型和野生型的患者HDL-C水平進(jìn)行均值方差分析,結(jié)果顯示兩組間均存在統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(F=7.312,P=0.008:F=12.482,P=0.001).(2)CHD病例對(duì)照分析顯示：①rs4353 GA位點(diǎn)等位基因頻率在CHD組與對(duì)照組間差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(x2=3.998,P=0.045,OR=1.297)。②rs7830 AC位點(diǎn)基因型頻率在兩組間差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(x2=6.369,P=0.041,OR=0.790)。③rs12528076 CT位點(diǎn)等位基因頻率在兩組間差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(x2=3.918,P=0.047,OR=1.335)。④CHD病例組血脂水平分析顯示：rs1205 CT位點(diǎn)與HDL-C和LDL-C水平有相關(guān)性(x2=7.371,P=0.007,OR=7.920；x2=5.892,P=0.015,OR=0.320),通過(guò)對(duì)rs1205CT位點(diǎn)的突變基因型CT/TT和野生型CC的患者HDL-C和LDL-C水平進(jìn)行均值方差分析,結(jié)果顯示僅與HDL-C水平存在統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(F=14.067,P=0.001)。結(jié)論自主建立的PCR-HRM分子診斷方法能夠?qū)?5個(gè)SNP位點(diǎn)正確基因分型,達(dá)到臨床常規(guī)化分子診斷目標(biāo)。RTKN2、LDLR、APOC1、ARL15和HLA-DMA與蘭州地區(qū)漢族人群RA易感相關(guān),其中rs693 CT和rs4420638 AG聯(lián)合HDL-C血清水平可預(yù)警RA發(fā)生；ACE、NOS3和ENPP1與蘭州地區(qū)漢族人群CHD易感相關(guān),其中rs1205 CT聯(lián)合HDL-C血清水平可預(yù)警CHD發(fā)生。
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】：蘭州大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號(hào)】：R593.22;R541.4;R440

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：1498422