本文關鍵詞：2011-2013年柳州市部分HIV-1毒株gag基因測定及亞型分析

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【摘要】：目的了解2011-2013年柳州市人類免疫缺陷病毒1(human immunodeficiency virus 1,HIV-1)亞型分布、流行毒株情況。方法從2011-2013年柳州市HIV-1毒株樣本中采用單純隨機抽樣方法抽取120株作為研究對象,將120份樣本從血漿中抽提核酸RNA,擴增HIV-1 gag基因片段,送至北京六合華大基因科技股份有限公司測序。合格序列利用數(shù)據(jù)庫分析亞型以及利用MEGA5構建系統(tǒng)進化樹。結果得到合格的gag基因片段98條序列。來自gag基因片段的序列分析重組流行毒株(circulate recombinant forms,CRFs)的重組亞型CRF01_AE占95.9%(94/98),異性傳播比例為79.8%(75/94);重組亞型CRF07_BC占4.1%(4/98)。樣本1LZ022和1LZ032,1LZ025和3LZ029的bootstrap值分別為99.0%,100.0%,兩兩之間傳播途徑不同。結論 2011-2013年,柳州市HIV-1以重組亞型CRF01_AE為主。柳州市重組亞型CRF01_AE從吸毒人群向異性接觸感染人群蔓延。利用系統(tǒng)進化關系結合傳播途徑,便于分析傳染源,為艾滋病干預措施提供有力佐證。
【作者單位】： 柳州市疾病預防控制中心主任辦公室;柳州市疾病預防控制中心微生物檢驗科;柳州市疾病預防控制中心性病與艾滋病防控科;
【關鍵詞】： HIV- 基因 gag 獲得性免疫缺陷綜合征
【基金】：廣西科學技術廳立項課題(1140003A-44)
【分類號】：R512.91
【正文快照】： (Chin J Dis Control Prev 2016,20(8):781-784)黎明強和黃萍為共同第一作者人類免疫缺陷病毒(human immunodeficiency vi-rus,HIV)是RNA逆轉錄病毒,它的一個重要特征為高度變異,原因是HIV在復制過程中逆轉錄酶的忠實性較差,缺乏3’-5’外切核酸的校讀功能,從而導致RNA轉錄為D

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1 韓照中，楊佩英，秦鄂德，，于曼，徐品芳，司炳銀;登革2型病毒43株膜蛋白前體基因片段的克隆與表達[J];中華微生物學和免疫學雜志;1994年05期

本文編號：1112970