本文關(guān)鍵詞：整合分析脆性X染色體綜合征患者來源的誘導(dǎo)多能干細(xì)胞在神經(jīng)元分化中的轉(zhuǎn)錄組變化

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【摘要】：脆性X染色體綜合征(fragile X syndrome,FXS)患者在FMR1基因的啟動子區(qū)具有超過200個以上CGG三核苷酸重復(fù)片段,導(dǎo)致其編碼的脆性X智力低下蛋白(fragile X mental retardation protein,FMRP)的表達(dá)減少或缺失.然而目前尚未在單核苷酸分辨率(即RNA-seq)水平上鑒定FMRP缺失所引起的轉(zhuǎn)錄組變化.本文對FXS患者成纖維細(xì)胞來源的誘導(dǎo)多能干細(xì)胞(human induced pluripotent stem cell,iPS細(xì)胞)(FXS-iPSC)進(jìn)行了體外神經(jīng)元分化.然后懫用RNA-seq技術(shù)檢測了FXS-iPSC在體外神經(jīng)元分化各階段的轉(zhuǎn)錄調(diào)控變化情況.通過詳盡的分析這些轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)并整合其他研究平臺的成果,發(fā)現(xiàn)在FXS-iPSC分化得到的神經(jīng)元中許多與神經(jīng)元分化相關(guān)的轉(zhuǎn)錄因子(WNT1,BMP4,POU3F4,TFAP2C和PAX3)表達(dá)上調(diào),鉀離子通道基因(KCNA1,KCNC3,KCNG2,KCNIP4,KCNJ3,KCNK9和KCNT1)表達(dá)下調(diào),而SHANK1和NNAT轉(zhuǎn)錄調(diào)控的時序發(fā)生改變,這表明FXS患者神經(jīng)元的分化和功能受損.綜上所述,本研究證明FXS患者中FMRP的缺失顯著影響了神經(jīng)發(fā)育過程的基因表達(dá)模式,并將有助于發(fā)現(xiàn)臨床治療FXS的潛在靶點(diǎn).
【作者單位】： 同濟(jì)大學(xué)醫(yī)學(xué)院同濟(jì)干細(xì)胞研究中心;同濟(jì)大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院;Department
【關(guān)鍵詞】： 脆性X染色體綜合征 智力發(fā)育遲滯 人類誘導(dǎo)多能干細(xì)胞 神經(jīng)元分化
【基金】：科技部國家重大科學(xué)研究計劃(批準(zhǔn)號:2015CB964601,2015CB964702) 國家自然科學(xué)基金海外及港澳學(xué)者合作研究基金項目(批準(zhǔn)號:31428016);國家自然科學(xué)基金重點(diǎn)項目(批準(zhǔn)號:81430026) 教育部“留學(xué)回國人員科研啟動基金”(祝獻(xiàn)民) 上海市衛(wèi)計委(批準(zhǔn)號:XBR2013094) 江蘇省科技計劃(批準(zhǔn)號:BM2014052)資助
【分類號】：R596.1
【正文快照】： 脆性X染色體綜合征(fragile X syndrome,FXS)是一種常見的遺傳性疾病,與智力低下和情緒障礙有關(guān),也被認(rèn)為是最常見的單基因引起的自閉癥.FXS患者中,FMR1基因的5′端非翻譯區(qū)(5′-untranslated region,5′-UTR)CGG三核苷酸重復(fù)序列與健康人相比明顯增加(200).高度重復(fù)的CGG三

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