本文關(guān)鍵詞：膀胱尿路上皮癌組織lincRNA差異表達(dá)及機(jī)制探討

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【摘要】：目的篩選膀胱尿路上皮癌與癌旁組織中差異表達(dá)長鏈基因間非編碼RNA(long intergenic noncoding RNA,lincRNA),并探討其可能作用機(jī)制。方法收集2011-01-04-2011-02-18中山大學(xué)孫逸仙紀(jì)念醫(yī)院泌尿外科4例膀胱尿路上皮癌與癌旁組織標(biāo)本并應(yīng)用Trizol提取總RNA,應(yīng)用基因芯片篩選差異表達(dá)的lincRNAs及mRNAs,應(yīng)用生物信息學(xué)分析差異表達(dá)lincRNAs和mRNAs特征,應(yīng)用EZH2抗體和SUZ12抗體進(jìn)行RNA免疫沉淀篩選與多梳抑制復(fù)合物2(PRC2)相互作用的lincRNAs。結(jié)果基因芯片篩選發(fā)現(xiàn),共376個lincRNAs及1 284個mRNAs在膀胱尿路上皮癌組織與癌旁組織中存在表達(dá)差異(差異倍數(shù)≥2.0倍,P0.05)。lincRNAs表達(dá)異常在第1、2、7號染色體最常見,mRNAs差異表達(dá)基因的信號通路分析顯示,參與細(xì)胞間黏附、鈣離子信號通路、MAPK信號通路和細(xì)胞因子間受體相互作用的基因改變最為明顯。與非免疫血清IgG組相比,應(yīng)用EZH2抗體和SUZ12抗體進(jìn)行的RNA免疫沉淀提示,HOTAIR分別富集(11.2±1.7)和(9.6±1.1)倍,BX640973分別富集(36.3±2.1)和(14.7±0.8)倍,NR_024344分別富集(30.2±3.5)和(7.7±1.2)倍,LINC312分別富集(5.1±0.4)和(5.7±0.5)倍,NR_036444分別富集(29.5±1.8)和(11.2±0.6)倍,MALAT1分別富集(12.9±1.6)和(25.1±1.5)倍,MEG3分別富集(13.2±0.6)和(4.0±1.3)倍,差異均有統(tǒng)計學(xué)意義,P值均0.05。結(jié)論膀胱癌中大量lincRNAs和mRNAs表達(dá)發(fā)生改變,部分lincRNAs通過與PRC2復(fù)合物相互作用發(fā)揮功能。
【作者單位】： 中山大學(xué)孫逸仙紀(jì)念醫(yī)院泌尿外科;
【關(guān)鍵詞】： 膀胱腫瘤 長鏈基因間非編碼RNA PRC復(fù)合物 RNA-蛋白質(zhì)相互作用
【基金】：國家自然科學(xué)基金(81172431;81272808;U1301221;81472381;81472384)
【分類號】：R737.14
【正文快照】： 中華腫瘤防治雜志,2015,22(6):421-426Chin J Cancer Prev Treat,2015,22(6):421-426表觀遺傳修飾在膀胱癌的進(jìn)展和轉(zhuǎn)移中發(fā)揮重要作用[1]。長鏈基因間非編碼RNA(long intergenicnoncoding RNA,lincRNA)是轉(zhuǎn)錄區(qū)域不與蛋白編碼基因區(qū)域重疊的非編碼RNA亞類,最近研究表明,lincR

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本文編號：964128