第一部分遺傳性高鈣尿結(jié)石形成大鼠腎臟miRNA-mRNA表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析目的全面了解遺傳性高鈣尿結(jié)石形成大鼠腎臟miRNA及mRNA的表達(dá)變化及其相互作用關(guān)系。方法采用高通量miRNA及mRNA生物芯片技術(shù),尋找出在遺傳性高鈣尿結(jié)石形成大鼠(GHS大鼠)與Sprague-Dawley大鼠(SD大鼠)腎臟差異表達(dá)的miRNA及mRNA。通過miRanda數(shù)據(jù)庫,預(yù)測miRNA的靶基因,選取預(yù)測的靶基因與實(shí)際表達(dá)差異的交集基因進(jìn)行生物信息學(xué)的分析。通過GO分析和KEGG pathways分析尋找差異基因可能富集的功能和信號通路,并最終根據(jù)差異miRNA和mRNA構(gòu)建出miRNA-mRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)和細(xì)胞信號通路調(diào)控網(wǎng)絡(luò)(signal-net)。結(jié)果通過生物芯片檢測,共發(fā)現(xiàn)2418個在GHS大鼠和SD大鼠腎臟內(nèi)差異表達(dá)的mRNA和19個差異表達(dá)的miRNA。選取miRNA的預(yù)測靶基因和2418個差異表達(dá)基因的交集做GO和KEGG pathways分析,共得到703個明顯富集的GO terms(包括417個上調(diào)和286個下調(diào))以及83個明顯富集的pathways(包括75個上調(diào)和18個下調(diào))。成功構(gòu)...

【文章頁數(shù)】：126 頁

【學(xué)位級別】：博士

【文章目錄】：
縮略詞中英文對照表
引言
    參考文獻(xiàn)
中文摘要
Abstract
第一部分 遺傳性高鈣尿結(jié)石形成大鼠腎臟miRNA-mRNA表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析
    引言
    材料與方法
    結(jié)果
    討論
    小結(jié)
    參考文獻(xiàn)
第二部分 Ca²⁺激活腎小管上皮細(xì)胞ROS/NFκB信號通路促進(jìn)細(xì)胞黏附分子表達(dá)
    引言
    材料與方法
    結(jié)果
    討論
    小結(jié)
    參考文獻(xiàn)
全文小結(jié)
附錄 攻讀學(xué)位期間發(fā)表論文及參與課題情況
致謝



本文編號：3974179