目的:生物信息學(xué)(Bioinformatics)是研究生物信息的采集、處理、存儲、傳播,分析和解釋等各方面的學(xué)科,研究重點主要體現(xiàn)在基因組學(xué)(Genomics)和蛋白質(zhì)組學(xué)(Proteomics)兩方面,就是從核酸和蛋白質(zhì)序列出發(fā),分析序列中表達的結(jié)構(gòu)功能的生物信息。我們通過TCGA數(shù)據(jù)庫篩查出TTK基因的mRNA水平隨著臨床Gleason評分的增高而增高,因此我們推測TTK在前列腺癌的進展中發(fā)揮重要作用。通過查詢相關(guān)文獻,發(fā)現(xiàn)TTK在很多癌癥中扮演重要的促進癌癥進展的作用,而對于前列腺癌進展的研究很少,因此我們通過一系列的實驗驗證TTK在前列腺癌細胞系中的表達,以及探究使用特異性siRNA和shRNA敲除TTK在前列腺癌細胞系中的基因表達水平后,其相關(guān)生物學(xué)行為的改變。方法:根據(jù)前列腺癌的病理分級,選取不同Gleason評分的前列腺癌病理切片進行免疫組化染色,驗證了TTK在前列腺增生,以及Gleason評分6分和9分的前列腺癌組織中的表達情況。通過體外培養(yǎng)LNCaP,C42,DU145,以及PC3前列腺癌細胞系,提取4種細胞系的mRNA和總蛋白并通過q-PCR和Western Blo...

【文章頁數(shù)】：61 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖1a.p±0.3的火山圖篩選

圖1a.p<0.05和斯皮爾曼系數(shù)>±0.3的火山圖篩選圖1b.TTK在前列腺癌與非前列腺癌患者中的表達情況圖1c.TTK的無進展期生存分析圖1d.TTK與Gleason評分的相關(guān)性Termgeneacountp-valuCellcycleO....

圖3a.qPCR結(jié)果顯示四種細胞的TTK的mRNA水平的表達情況

1.2.2驗證TTK在四種前列腺癌細胞系中mRNA以及蛋白的表達水平通過qPCR技術(shù)檢測TTK在四種前列腺癌細胞系（LNCaP，C42，DU145，以及PC3前列腺癌細胞系）mRNA表達情況，發(fā)現(xiàn)TTK在四種前列腺癌細胞系中mRNA表達情況存在差異....

圖6a.Transwell結(jié)果顯示敲除TTK后PC3細胞系的侵襲能力明顯減弱

圖5a.細胞劃痕實驗驗證0小時，24小時以及48小時實驗組和對照組細胞的遷移能力圖5b.實驗組和對照組EMT相關(guān)標(biāo)記物的mRNA水平的表達情況(P＜0.05*,P＜0.01**）圖5c.實驗組和對照組EMT相關(guān)標(biāo)記物的蛋白水平的表達情況1.2.5Transwel....

圖6b.a圖的量化結(jié)果，差異具有統(tǒng)計學(xué)差異

圖5a.細胞劃痕實驗驗證0小時，24小時以及48小時實驗組和對照組細胞的遷移能力圖5b.實驗組和對照組EMT相關(guān)標(biāo)記物的mRNA水平的表達情況(P＜0.05*,P＜0.01**）圖5c.實驗組和對照組EMT相關(guān)標(biāo)記物的蛋白水平的表達情況1.2.5Transwel....

本文編號：3891239