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基于TCGA數(shù)據(jù)庫的前列腺癌組織免疫細胞浸潤模式預測

發(fā)布時間:2021-06-17 22:33
  目的研究前列腺癌組織中免疫細胞的浸潤模式及其與臨床預后之間的相關性。方法 TCGA數(shù)據(jù)庫下載前列腺癌mRNA表達數(shù)據(jù)及臨床資料,通過CIBERSORT軟件預測前列腺癌組織中22種免疫細胞的浸潤模式,應用R語言分析各種免疫細胞與生存的相關性。結(jié)果 TCGA數(shù)據(jù)庫共下載mRNA表達數(shù)據(jù)540例,包含前列腺癌組織490例,正常前列腺組織50例,共檢測mRNA 60 483個,對所得矩陣文件校正后,應用CIBERSORT軟件的反卷積法預測22種免疫細胞的構(gòu)成比。結(jié)果顯示,前列腺癌組織中未活化的CD4記憶性T細胞(24.52%)、CD8T淋巴細胞(11.21%)最為豐富。對免疫細胞的分布與臨床預后相關性進行分析,結(jié)果顯示隨著前列腺患者年齡的增加,幼稚B細胞比例增加,且與腫瘤體積的大小密切相關。較高水平的M1型巨噬細胞與前列腺癌的淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移相關。結(jié)論前列腺癌組織中存在免疫細胞不同程度的浸潤,與腫瘤的發(fā)生發(fā)展及預后治療密切相關。 

【文章來源】:現(xiàn)代泌尿外科雜志. 2020,25(10)

【文章頁數(shù)】:5 頁

【部分圖文】:

基于TCGA數(shù)據(jù)庫的前列腺癌組織免疫細胞浸潤模式預測


前列腺癌及正常組織免疫細胞分布差異的小提琴圖

分布情況,前列腺,B細胞,相關性


本研究進一步對前列腺癌組織中的22種免疫細胞分布情況進行分析,結(jié)果顯示:幼稚B淋巴細胞與前列腺癌的腫瘤組織大小密切相關(P=0.06,圖3A),差異有統(tǒng)計學意義,且隨著前列腺癌患者年齡的增長,幼稚B淋巴細胞比例增加(P=0.043,圖3B)。M1型巨噬細胞的增加與前列腺癌的淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移有一定的相關性(P=0.015,圖4)。圖4 M1型巨噬細胞與前列腺癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的相關性

前列腺,相關性,B細胞,巨噬細胞


M1型巨噬細胞與前列腺癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的相關性


本文編號:3236044

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