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LARS2調控ABCA1誘導腎透明細胞癌脂代謝重編程的機制研究

發(fā)布時間:2020-07-31 16:36
【摘要】:目的:腎透明細胞癌其胞質富含脂質,具有脂代謝重編程的特征。本課題組前期全基因組測序發(fā)現(xiàn)腫瘤中組織中亮氨酰-tRNA合成酶(mitochondrial leucyl-tRNA synthetase 2,LARS2)基因突變,但其對腎透明細胞癌脂代謝作用尚未闡明。因此,本研究旨在驗證通過脂代謝組學分析發(fā)現(xiàn)的關鍵基因三磷酸腺苷結合盒轉運體A1(ATP-binding cassette,sub-family A,ABCA1),在腎透明細胞癌脂代謝重編程的的表達,探索LARS2調控ABCA1誘導腎透明細胞癌脂代謝再變編程的可能機制,進一步闡明LARS2在腎透明細胞癌脂代謝重編程過程中的功能和作用機制,為研究腎透明細胞癌的發(fā)生機制提供資料。方法:(1)對腎透明細胞癌組織切片和配對癌旁組織切片進行進行油紅染色(2)選擇本課題組前期構建的LARS2過表達的穩(wěn)轉細胞和對照細胞,以及LARS2低表達的穩(wěn)轉細胞及其對照細胞,進行脂代謝組學檢測,尋找到顯著差異脂質-膽固醇酯。隨后送檢60對腫瘤組織和配對癌旁組織再次進行脂代謝組學分析,進一步確認。根據(jù)結果,利用生物信息學預測分析軟件,尋找到編碼調控膽固醇酯代謝的關鍵基因ABCA1;(3)在上述細胞系中采用qT-PCR的方法同時檢測LARS2和ABCA1表達,并在90對腫瘤和配對癌旁組織中驗證;利用試劑盒檢測細胞株、腫瘤組織及配對癌旁組織的膽固醇酯濃度。依腫瘤組織表達LARS2水平高低分組,比較二組之間ABCA1表達水平差異及膽固醇酯水平。結果:腎透明細胞癌富含脂質,染色明顯。脂代謝組學共鑒定超過1000個脂類物質變化,涉及30亞類,提示腎透明細胞癌脂代謝重編程。結果分析顯示腫瘤組織和細胞內膽固醇酯(ChE)顯著增高,經生物信息學預測,三磷酸腺苷結合盒轉運體A1(ABCA1)為調控ChE表達關鍵酶基因。LARS作為抑癌基因在腫瘤中失活,過表達LARS2的腫瘤細胞株的ABCA1表達水平下調,膽固醇酯含量降低(P0.01)。腫瘤組織ABCA表達水平顯著高于配對瘤旁正常腎臟組織,高表達ABCA1的腫瘤組織膽固醇酯含量高于低表達者(P0.001);而LARS2表達水平高的腫瘤組織其ABCA1表達顯著下調,膽固醇酯含量也顯著低于LARS2表達低的組織(P0.01)。結論:腎透明細胞癌脂代謝重編程,以膽固醇酯富集為主要特點。ABCA1為負責調控膽固醇酯代謝關鍵酶的基因,其高表達與膽固醇酯富集相關。LARS2作為抑癌基因在ccRCC中失活,過表達LARS2的細胞株其ABCA1表達降低,膽固醇酯含量低于對照細胞株及敲低LARS2的穩(wěn)轉細胞株。腫瘤組織內低表達LARS2者ABCA 1表達水平上調,膽固醇酯含量隨之增高,提示因LARS2失活后誘導ABCA1上調,進而促進腎透明細胞癌脂代謝重編程。
【學位授予單位】:中國人民解放軍醫(yī)學院
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2019
【分類號】:R737.11
【圖文】:

模型圖,模型,脂質,亞類


邐解放軍醫(yī)學院碩士學位論文評分,R2Y接近1,Q2均大于0.6,模型穩(wěn)固可靠。在OPLS-DA模型中,以VIP同時滿足P〈0.邋05為顯著指標,共選出如圖所示顯著性差異脂質(表4),隨后差異脂質進行了聚類分析(圖4)、相關分析(圖5)以及脂質亞類變化分析(6)通過比較和分析A-B、A-C、B-C以及B-D四組數(shù)據(jù)及圖表,我們最終發(fā)現(xiàn)固醇酯這一差異脂質在不僅差異變化明顯,而且差異可靠性高。同樣,在組織本中,共鑒定1064個脂類化合物,涉及32個亞類。結合四個組組間、組內對數(shù)據(jù)分析,以B-A對比分析為例,結果如圖7、8所示,我們在腫瘤-健康組織本的分析中發(fā)現(xiàn)ChE表達具有差異性,且符合細胞樣本分析結果。逡逑

碩士學位論文,解放軍,醫(yī)學院,脂質


顯著性差異脂質分子聚類分析

分子,顯著性差異,相關性分析,脂質


顯著性差異脂質分子相關性分析

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本文編號:2776726

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