【摘要】：目的通過ChinaPca全基因組關聯(lián)研究(GWAS)數(shù)據(jù)中驗證、免疫組化實驗及公共數(shù)據(jù)庫分析,探討低密度蛋白受體相關蛋白1基因(LRP1)基因對前列腺癌(PCa)的影響。方法基于前期26例廣西壯族人群PCa組織全外顯子測序結果,選擇可能和PCa相關的LRP1基因,在ChinaPCa的GWAS數(shù)據(jù)中對9個LRP1的單核苷酸多態(tài)性(SNP)進行驗證;分別取PCa、癌旁和前列腺炎組織各12、18和4例進行免疫組化實驗;分析癌癥和腫瘤基因圖譜(TCGA)數(shù)據(jù)庫的LRP1基因表達數(shù)據(jù),對TCGA和(基因型組織表達)GTEx數(shù)據(jù)庫的LRP1基因表達數(shù)據(jù)進行作圖,在STRING網站構建蛋白與蛋白交互網絡(PPI)圖,并驗證相關基因聯(lián)系。統(tǒng)計分析采用SPSS及STATA軟件。結果ChinaPCa GWAS數(shù)據(jù)驗證結果顯示LRP1的rs11172113和PCa可能存在關聯(lián)(P=0.083),其中TC基因型和PCa風險關聯(lián)顯著(OR=1.27,95%CL,1.066-1.505,P=0.007)。免疫組化實驗及TCGA數(shù)據(jù)庫統(tǒng)計分析顯示LRP1在PCa和癌旁組織的表達無統(tǒng)計學差異(分別為P=0.167,P=0.729),TCGA和GTEx數(shù)據(jù)庫聯(lián)合作圖顯示LRP1在癌組織表達量降低(P0.05),PPI網絡研究結果顯示LRP1與前列腺癌通路相關基因PLAT、PDGFB、PDGFRB有關聯(lián)(P0.05)。結論LRP1基因的rs11172113和前列腺癌有關,LRP1基因在前列腺癌組織的低表達可能和前列腺癌有關。LRP1可能通過調節(jié)相關基因來調控前列腺癌相關通路。
【學位授予單位】：廣西醫(yī)科大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2019
【分類號】：R737.25
【圖文】：

免疫組化結果顯示其中在 4 例前列腺炎組織中有 2 例 LRP1 染色呈陰性（-）（圖 2-1.b），1 例 LRP1 染色呈弱陽性（1+），1 例 LRP1 染色呈中等強度陽性（2+） ；在 18 例前列腺正常組織中有 8 例 LRP1 染色呈陰性（-）（圖 2-1.c），5 例 LRP1 染色呈弱陽性（1+），5 例 LRP1 染色呈中等強度陽性（2+）（圖 2-1.d）；在 12 例前列腺癌組織中有 7 例 LRP1 染色呈陰性（-）（圖 2-1.e），5 例 LRP1 染色呈弱陽性（1+）（圖 2-1.f）。癌組織與癌旁正常組織的 LRP1 表達量無統(tǒng)計學差異（P=0.133）；前列腺炎與癌旁正常組織的LRP1 表達量無統(tǒng)計學差異（P=1.000）。組織病理類型與 LRP1 染色分級統(tǒng)計如表 2-2 所示。

基于 ChinaPca 全基因組數(shù)據(jù)和基因表達量探討 LRP1 與前列腺癌的關系 Black 7 12.151±0.521Asian 2 12.587±1.040*P ＜0.05 為差異有統(tǒng)計學意義；a.前列腺組織分組、年齡組、前列腺癌 TNM 分期組的統(tǒng)計學方法采用兩獨立樣本 t 檢b.格里森評分分組、人種分組的統(tǒng)計學方法采用單因素 ANOVA 分析。

.在 GEPIA 網站中繪制在 TCGA 前列腺癌 vs TCGA 正常組織的箱形圖。e 2-3.Box plot of LRP1 Gene Expression in TCGA Prostate Cancal Tissue Drawn on GEPIA Website.The red box plot represen prostate cancer.The gray box plot represents the expression levGEX normal tissue.The expression level of LRP1 in cancer tisss（P＜0.05）.LRP1 基因的網絡互作分析結果本研究通過STRING網站構建的LRP1基因的

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本文編號：2772995