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尿液代謝組個體差異的影響因素研究及其在膀胱癌代謝標志物篩選中的應用

發(fā)布時間:2020-05-12 22:53
【摘要】:膀胱癌(bladder cancer,BC)的早期發(fā)現(xiàn)對于改善BC患者的預后有著非常重要的意義。目前臨床上的無創(chuàng)診斷方法主要有尿細胞學檢測,影像學檢查和一些尿液標志物檢查,但其診斷效能較低,尤其是對于非肌層浸潤性(non-muscle invasive,NMI)BC。目的:本文采用高通量液相色譜-質譜聯(lián)用技術(liquid chromatography-high resolution mass spectrometry,LC-HRMS)探究代謝組的個體差異及其影響因素,并通過控制影響因素探尋BC的診斷標志物。方法:我們收集清晨第一次中段液,應用LC-HRMS探索尿液代謝組學的個體差異,并探索不同性別和年齡對尿液代謝組的影響。隨后采用性別和年齡相匹配的對照組與癌癥組相比較以篩選BC,NMIBC和低級別NMIBC的標志物,此外,應用代謝物模型區(qū)分高級別和低級別NMIBC。結果:第一部分包含203例健康成人,6例膀胱良性病變病人和53例無血尿BC病人的尿液樣本。個體差異分析提示尿液代謝組相對穩(wěn)定,而其影響因素包括性別和年齡。探索BC標志物的實驗組包括性別和年齡相匹配的44例健康成人和33例BC病人樣本,由反式-2-碳烯肉毒堿,絲氨酸-纈氨酸,阿魏;-2-羥基腐胺和3-羥基壬酰肉毒堿構成診斷模型,曲線下面積(area under the curve,AUC)為0.924,外部驗證組(26例對照和20例BC樣本)證實了其診斷的準確性。第二部分研究包含117例健康人,80例無血尿NMIBC病人和87例血尿NMIBC病人的尿液樣本,依然采用性別和年齡相匹配的方式篩選標志物,由4-硫酸化多巴胺,MG00/1846Z,9Z,12Z,15Z/00,門冬氨酰-組氨酸,酪氨酰-甲硫氨酸構成模型診斷NMIBC,在外部驗證組中AUC為0.838,由3-羥基-順-十四烯肉堿,3,16,17-三羥基-1,3,5(10)-雌甾三烯-6-酮,β-皮酮四醇,四氫皮質酮和庚基丙二酸構成模型診斷低級別NMIBC,其AUC為0.899。在NMIBC高低級別的比較中,血尿組和無血尿組的AUC分別為0.827和0.755。結論:性別和年齡能夠影響代謝組,需在實驗設計時進行控制,代謝物模型能夠診斷BC,NMIBC和低級別NMIBC,并且能夠對NMIBC進行分級。
【圖文】:

樣本,實驗樣本,紅色,共注入


前需要對QC樣本重復進樣3-4次,以穩(wěn)定系統(tǒng)。隨后在實驗過程中固定頻次進逡逑樣QC樣本,共注入32次QC樣本。PCA得分圖顯示前6次QC樣本的差異較大,逡逑隨后系統(tǒng)趨于穩(wěn)定(<t2SD),如圖2a,聚類分析結果(圖2b)進一步證明了QC逡逑數(shù)據(jù)的穩(wěn)定性。以上結果說明質譜分析平臺在樣品分析過程中具有良好的穩(wěn)定逡逑性和重復性。逡逑10逡逑

模型圖,性別差異,監(jiān)督聚類,非監(jiān)督


異趨勢與上訴所有變量的差異趨勢相似。逡逑2、性別差異逡逑首先應用非監(jiān)督聚類的PCA模型初步探索了代謝組的性別差異,見圖3a,,逡逑結果提示代謝譜可以根據(jù)性別的不同而相對聚集,即便有部分重合,但是性別逡逑差異依然較為明顯。隨后應用監(jiān)督聚類的OPLS-DA模型將性別差異進一步區(qū)分逡逑(圖3b)并根據(jù)分類貢獻度篩選出若干性別相關的差異代謝物(詳見附表1),逡逑其中大約1/3的代謝產(chǎn)物在女性樣本中高表達,包括3-羥基氨基苯甲酸,N-乙酰逡逑氨酸和尿酸,通路分析提示色氨酸代謝,檸檬酸循環(huán),泛酸和輔酶A的生物合逡逑成都與性別相關(圖3c),而在男性中,類固醇激素的合成通路被激活,但是逡逑差異并不顯著。逡逑為檢測這些代謝物對性別的區(qū)分效能,我們采用多參數(shù)ROC曲線進行分析逡逑(http://www.metaboanalyst.ca/faces/Secure/upload/RocUploadView.xhtml)。分析發(fā)逡逑現(xiàn)由泛酸,5-羥基吲哚乙酸,3-羥基氨基苯甲酸,酮戊二酸和3-磺基脫氧膽酸組成逡逑的預測模型具有較好的預測能力
【學位授予單位】:北京協(xié)和醫(yī)學院
【學位級別】:博士
【學位授予年份】:2019
【分類號】:R737.14

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本文編號:2660956


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