尿液代謝組個體差異的影響因素研究及其在膀胱癌代謝標志物篩選中的應用
【圖文】:
前需要對QC樣本重復進樣3-4次,以穩(wěn)定系統(tǒng)。隨后在實驗過程中固定頻次進逡逑樣QC樣本,共注入32次QC樣本。PCA得分圖顯示前6次QC樣本的差異較大,逡逑隨后系統(tǒng)趨于穩(wěn)定(<t2SD),如圖2a,聚類分析結果(圖2b)進一步證明了QC逡逑數(shù)據(jù)的穩(wěn)定性。以上結果說明質譜分析平臺在樣品分析過程中具有良好的穩(wěn)定逡逑性和重復性。逡逑10逡逑
異趨勢與上訴所有變量的差異趨勢相似。逡逑2、性別差異逡逑首先應用非監(jiān)督聚類的PCA模型初步探索了代謝組的性別差異,見圖3a,,逡逑結果提示代謝譜可以根據(jù)性別的不同而相對聚集,即便有部分重合,但是性別逡逑差異依然較為明顯。隨后應用監(jiān)督聚類的OPLS-DA模型將性別差異進一步區(qū)分逡逑(圖3b)并根據(jù)分類貢獻度篩選出若干性別相關的差異代謝物(詳見附表1),逡逑其中大約1/3的代謝產(chǎn)物在女性樣本中高表達,包括3-羥基氨基苯甲酸,N-乙酰逡逑氨酸和尿酸,通路分析提示色氨酸代謝,檸檬酸循環(huán),泛酸和輔酶A的生物合逡逑成都與性別相關(圖3c),而在男性中,類固醇激素的合成通路被激活,但是逡逑差異并不顯著。逡逑為檢測這些代謝物對性別的區(qū)分效能,我們采用多參數(shù)ROC曲線進行分析逡逑(http://www.metaboanalyst.ca/faces/Secure/upload/RocUploadView.xhtml)。分析發(fā)逡逑現(xiàn)由泛酸,5-羥基吲哚乙酸,3-羥基氨基苯甲酸,酮戊二酸和3-磺基脫氧膽酸組成逡逑的預測模型具有較好的預測能力
【學位授予單位】:北京協(xié)和醫(yī)學院
【學位級別】:博士
【學位授予年份】:2019
【分類號】:R737.14
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本文編號:2660956
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