一非綜合征型先天缺牙患者PAX9新發(fā)突變及功能驗證
發(fā)布時間:2021-07-01 19:27
目的:對非綜合征型牙齒先天缺失患者行全外顯子測序分析,尋找可能的遺傳病因,并通過后期實驗研究其分子通路機制,探討突變基因的致病機理,為非綜合征型牙齒先天缺失疾病的深入研究打下理論基礎(chǔ)。方法:1、病例收集及數(shù)據(jù)分析對天津某高校4002名在校學(xué)生進行口腔檢查,詳細記錄數(shù)據(jù)并利用卡方檢驗進行統(tǒng)計學(xué)分析,統(tǒng)計先天缺牙和牙齒畸形的患病率,分析疾病的患病特點。對于確診為非綜合征型牙齒先天缺失的患者,在取得天津醫(yī)科大學(xué)口腔醫(yī)學(xué)院倫理委員會同意及患者簽署知情同意書情況下進行采血,取患者外周血4ml于-80攝氏度條件下臨時保存。2、牙齒先天缺失患者樣本的全外顯子測序及驗證采用Agilent的液相芯片捕獲系統(tǒng)并建庫,對于入選的患者進行全外顯子測序,突變的基因利用Phenolyzer軟件進行分析,根據(jù)基因和疾病相關(guān)性排序,排名前10位的行進一步分析。對比1000人基因組計劃所有數(shù)據(jù),突變堿基小于0.01頻率的記錄為有意義突變。有意義突變基因?qū)⑦M行一代測序進一步驗證。3、基因突變位點的多種生物信息軟件預(yù)測利用MutationTaster、CADD、dbNSFP、SIFT等多種生物信息軟件對致病基因突變位點進行...
【文章來源】:天津醫(yī)科大學(xué)天津市 211工程院校
【文章頁數(shù)】:94 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
不同地區(qū)學(xué)生牙齒先天缺失的患病率
不同地區(qū)學(xué)生牙齒畸形的患病率
天津醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文天缺牙及牙齒畸形好發(fā)牙位齒先天缺失及牙齒畸形的牙位分布見圖 1-3,1-4。先天缺牙共計 243 顆括 72 顆下側(cè)切牙(29.63%),36 顆下中切牙(14.81%),27 顆上側(cè)1.11%),21 顆上第二前磨牙(8.64%),19 顆下第二前磨牙(7.82%)側(cè)切牙及下頜第二前磨牙的先天缺失多對稱發(fā)生,而下頜中切牙及上磨牙缺失多單邊發(fā)生,幾種好發(fā)牙位單雙側(cè)分布差異有統(tǒng)計學(xué)意3.65 P=0.46);在 310 個畸形牙齒中,占較大比例的為上側(cè)切牙(79.03%形多雙側(cè)對稱發(fā)生,雙側(cè)患病率在上頜側(cè)切牙及其他牙位分別為 77.5562%,差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=4.57 P=0.03)。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]全外顯子測序?qū)ο忍烊毖腊槟[瘤家系致病基因初探[J]. 侯菲菲,趙曉雪,武京,馬騰飛,王慧娟,張向宇. 口腔醫(yī)學(xué)研究. 2018(12)
[2]不同測序技術(shù)在結(jié)節(jié)性硬化相關(guān)腎血管平滑肌脂肪瘤基因診斷中的應(yīng)用[J]. 郭剛,王威,朱捷,祖強,張旭. 微創(chuàng)泌尿外科雜志. 2018(04)
[3]副溶血性弧菌外膜蛋白K的B細胞線性表位預(yù)測[J]. 張崢嶸,張玉晴,許如蘇,許曉升. 中國微生態(tài)學(xué)雜志. 2018(07)
[4]一個X連鎖智力障礙家系的全外顯子測序分析[J]. 唐少華,賈曼莉,陳沖,李煥錚,胡林,欒兆棠,徐雪琴,呂建新. 中華醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)雜志. 2018 (03)
[5]miR-31調(diào)控PAX9對肺癌細胞增殖和侵襲能力的影響[J]. 安改麗,喻鳳,劉瑩,劉屹. 解放軍醫(yī)藥雜志. 2017(09)
[6]利用DNAStar軟件預(yù)測熱帶無爪螨主要致敏原Blo t 5的抗原表位[J]. 王曉哲,肖正泮,韋雙雙,王大勇,裴業(yè)春. 熱帶生物學(xué)報. 2017(01)
[7]PAX9在非小細胞肺癌中的表達及其臨床意義[J]. 龔蕊,莫曉能,邵娟,周勝亮. 江西醫(yī)藥. 2017(03)
[8]全外顯子測序技術(shù)檢測在原發(fā)性免疫缺陷病診斷中的應(yīng)用[J]. 陳鄉(xiāng),王慧君,周文浩. 國際藥學(xué)研究雜志. 2017(02)
[9]五種生物信息學(xué)軟件對于錯義突變預(yù)測性能的評估[J]. 陳倩婷,戴聰伶,張前軍,杜娟,李汶. 中華醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)雜志. 2016 (05)
[10]染色體芯片分析對神經(jīng)發(fā)育性疾病的分子診斷率研究[J]. 劉欣,劉宏景,王麗,李珂,李夢盈,耿娟,李斐. 中華檢驗醫(yī)學(xué)雜志. 2016 (04)
本文編號:3259732
【文章來源】:天津醫(yī)科大學(xué)天津市 211工程院校
【文章頁數(shù)】:94 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
不同地區(qū)學(xué)生牙齒先天缺失的患病率
不同地區(qū)學(xué)生牙齒畸形的患病率
天津醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文天缺牙及牙齒畸形好發(fā)牙位齒先天缺失及牙齒畸形的牙位分布見圖 1-3,1-4。先天缺牙共計 243 顆括 72 顆下側(cè)切牙(29.63%),36 顆下中切牙(14.81%),27 顆上側(cè)1.11%),21 顆上第二前磨牙(8.64%),19 顆下第二前磨牙(7.82%)側(cè)切牙及下頜第二前磨牙的先天缺失多對稱發(fā)生,而下頜中切牙及上磨牙缺失多單邊發(fā)生,幾種好發(fā)牙位單雙側(cè)分布差異有統(tǒng)計學(xué)意3.65 P=0.46);在 310 個畸形牙齒中,占較大比例的為上側(cè)切牙(79.03%形多雙側(cè)對稱發(fā)生,雙側(cè)患病率在上頜側(cè)切牙及其他牙位分別為 77.5562%,差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=4.57 P=0.03)。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]全外顯子測序?qū)ο忍烊毖腊槟[瘤家系致病基因初探[J]. 侯菲菲,趙曉雪,武京,馬騰飛,王慧娟,張向宇. 口腔醫(yī)學(xué)研究. 2018(12)
[2]不同測序技術(shù)在結(jié)節(jié)性硬化相關(guān)腎血管平滑肌脂肪瘤基因診斷中的應(yīng)用[J]. 郭剛,王威,朱捷,祖強,張旭. 微創(chuàng)泌尿外科雜志. 2018(04)
[3]副溶血性弧菌外膜蛋白K的B細胞線性表位預(yù)測[J]. 張崢嶸,張玉晴,許如蘇,許曉升. 中國微生態(tài)學(xué)雜志. 2018(07)
[4]一個X連鎖智力障礙家系的全外顯子測序分析[J]. 唐少華,賈曼莉,陳沖,李煥錚,胡林,欒兆棠,徐雪琴,呂建新. 中華醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)雜志. 2018 (03)
[5]miR-31調(diào)控PAX9對肺癌細胞增殖和侵襲能力的影響[J]. 安改麗,喻鳳,劉瑩,劉屹. 解放軍醫(yī)藥雜志. 2017(09)
[6]利用DNAStar軟件預(yù)測熱帶無爪螨主要致敏原Blo t 5的抗原表位[J]. 王曉哲,肖正泮,韋雙雙,王大勇,裴業(yè)春. 熱帶生物學(xué)報. 2017(01)
[7]PAX9在非小細胞肺癌中的表達及其臨床意義[J]. 龔蕊,莫曉能,邵娟,周勝亮. 江西醫(yī)藥. 2017(03)
[8]全外顯子測序技術(shù)檢測在原發(fā)性免疫缺陷病診斷中的應(yīng)用[J]. 陳鄉(xiāng),王慧君,周文浩. 國際藥學(xué)研究雜志. 2017(02)
[9]五種生物信息學(xué)軟件對于錯義突變預(yù)測性能的評估[J]. 陳倩婷,戴聰伶,張前軍,杜娟,李汶. 中華醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)雜志. 2016 (05)
[10]染色體芯片分析對神經(jīng)發(fā)育性疾病的分子診斷率研究[J]. 劉欣,劉宏景,王麗,李珂,李夢盈,耿娟,李斐. 中華檢驗醫(yī)學(xué)雜志. 2016 (04)
本文編號:3259732
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