口腔鱗狀細胞癌外泌體差異表達mRNA生物信息學分析
發(fā)布時間:2021-06-22 05:44
目的利用轉錄組分析口腔鱗狀細胞癌細胞(Oral squamous cell cancer cells,OSCC)外泌體與正?谇簧掀ぜ毎℉uman immortalized oral epithelial cell,HOEC)外泌體mRNA之間的表達差異,為解析口腔鱗狀細胞癌的發(fā)生和發(fā)展機制奠定基礎。方法利用高通量測序技術檢測CAL-27和HOEC外泌體mRNA表達譜,篩選出差異mRNA,對差異mRNA進行GO(Gene Ontoloty)注釋和KEGG富集。結果在CAL-27細胞外泌體中鑒定到44699個mRNA,在HOEC細胞外泌體中鑒定到44761個mRNA,其中,差異表達的mRNA共471條(234個上調(diào),237個下調(diào))。生物信息學分析表明上述差異表達的mRNA參與了口腔癌的生物學調(diào)節(jié)功能和通路。結論口腔鱗癌細胞及口腔上皮細胞均能產(chǎn)生豐富的外泌體;口腔鱗狀細胞癌細胞外泌體與正常口腔上皮細胞外泌體間mRNA表達譜存在較大差異,差異表達的mRNA在腫瘤的發(fā)生、發(fā)展及轉移過程中可能有重要作用。
【文章來源】:蘭州大學甘肅省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:44 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
外泌體電鏡圖(30000)
圖 2-2 外泌體電鏡圖( 30000)Fig 2-2 The graph of electron microscopyern blot 測定外泌體表面特異性分子標志實驗結果顯示,CAL-27 細胞和 HOEC 細胞外泌體表達如圖 2-3 所示),進一步證明提取的物質(zhì)為外泌體。
蘭州大學碩士研究生論文 口腔鱗狀細胞癌外泌體差異表達 mRNA 生物信息學分析mRNA(|Log2FoldChange|>2.0),但其中 SERPINS、RHOD 和 RHOB 在文獻中提及與腫瘤的發(fā)生、發(fā)展有關,所以特別列出。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]Rho亞家族蛋白在口腔白斑和口腔鱗癌中的表達及意義[J]. 王瑩,魯旭飛,王奇民,韓金宏,童磊,郭慶圓,陳正崗. 臨床口腔醫(yī)學雜志. 2017(05)
[2]根管治療期間急癥相關因素及防治[J]. 徐小榮,茍培芳,王凱. 現(xiàn)代養(yǎng)生. 2017(08)
[3]根管治療約診間疼痛的發(fā)生機制及預防控制策略[J]. 郭世博,薛明. 中國實用口腔科雜志. 2017(04)
[4]根管治療期間診間痛的原因分析[J]. 趙艷鳳. 全科口腔醫(yī)學電子雜志. 2015(01)
[5]非小細胞肺癌mRNA的表達譜分析[J]. 王麗,施雪霏,袁冬梅,楊雯,陳子,劉春花,宋勇. 臨床腫瘤學雜志. 2014(09)
[6]鼻中隔組織瓣修補上頜骨手術后的硬腭缺損[J]. 張慶泉,張華,張?zhí)煺?陳秀梅. 中華耳鼻咽喉頭頸外科雜志. 2012 (01)
[7]根管治療診間疼痛的原因分析[J]. 許海軍,潘冬梅. 口腔醫(yī)學. 2011(12)
[8]從微生物學角度思考感染根管的治療[J]. 劉正. 上?谇会t(yī)學. 2007(05)
[9]口腔頜面部惡性腫瘤根治術后腭護板修復——附60例分析[J]. 羅玉俠,史惠華. 北京口腔醫(yī)學. 1997(03)
本文編號:3242245
【文章來源】:蘭州大學甘肅省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:44 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
外泌體電鏡圖(30000)
圖 2-2 外泌體電鏡圖( 30000)Fig 2-2 The graph of electron microscopyern blot 測定外泌體表面特異性分子標志實驗結果顯示,CAL-27 細胞和 HOEC 細胞外泌體表達如圖 2-3 所示),進一步證明提取的物質(zhì)為外泌體。
蘭州大學碩士研究生論文 口腔鱗狀細胞癌外泌體差異表達 mRNA 生物信息學分析mRNA(|Log2FoldChange|>2.0),但其中 SERPINS、RHOD 和 RHOB 在文獻中提及與腫瘤的發(fā)生、發(fā)展有關,所以特別列出。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]Rho亞家族蛋白在口腔白斑和口腔鱗癌中的表達及意義[J]. 王瑩,魯旭飛,王奇民,韓金宏,童磊,郭慶圓,陳正崗. 臨床口腔醫(yī)學雜志. 2017(05)
[2]根管治療期間急癥相關因素及防治[J]. 徐小榮,茍培芳,王凱. 現(xiàn)代養(yǎng)生. 2017(08)
[3]根管治療約診間疼痛的發(fā)生機制及預防控制策略[J]. 郭世博,薛明. 中國實用口腔科雜志. 2017(04)
[4]根管治療期間診間痛的原因分析[J]. 趙艷鳳. 全科口腔醫(yī)學電子雜志. 2015(01)
[5]非小細胞肺癌mRNA的表達譜分析[J]. 王麗,施雪霏,袁冬梅,楊雯,陳子,劉春花,宋勇. 臨床腫瘤學雜志. 2014(09)
[6]鼻中隔組織瓣修補上頜骨手術后的硬腭缺損[J]. 張慶泉,張華,張?zhí)煺?陳秀梅. 中華耳鼻咽喉頭頸外科雜志. 2012 (01)
[7]根管治療診間疼痛的原因分析[J]. 許海軍,潘冬梅. 口腔醫(yī)學. 2011(12)
[8]從微生物學角度思考感染根管的治療[J]. 劉正. 上?谇会t(yī)學. 2007(05)
[9]口腔頜面部惡性腫瘤根治術后腭護板修復——附60例分析[J]. 羅玉俠,史惠華. 北京口腔醫(yī)學. 1997(03)
本文編號:3242245
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