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白假絲酵母菌生物膜中滯留菌形成的動態(tài)監(jiān)測及其相關(guān)基因的初步篩選

發(fā)布時間:2020-08-11 20:45
【摘要】:目的 白假絲酵母菌(白色念珠菌)是人類常見的條件致病真菌,生物膜是包括其在內(nèi)的幾乎所有微生物在自然界中的生存方式,生物膜微生物具有超強(qiáng)耐藥性。其可能機(jī)制包括:生物膜中胞外基質(zhì)抗藥物滲透的物理屏障作用、生物膜中菌株生長遲緩導(dǎo)致對藥物的敏感性降低、基因突變耐藥株的產(chǎn)生等,但這些不能完全解釋生物膜耐藥性。 2001年, Lewis等發(fā)現(xiàn),銅綠假單胞菌生物膜中其實(shí)只有極少數(shù)菌株能夠耐受較高濃度的藥物作用且具有多藥耐受性,因其耐藥特征不具有遺傳性,被稱為“滯留菌或持留菌(Persisters)”。Lewis認(rèn)為,這些菌株可能是生物膜耐藥性的真正原因,并且與臨床上常見的慢性反復(fù)性感染密切關(guān)聯(lián),但其形成機(jī)制尚不清楚。2006年,Lafleur等發(fā)現(xiàn)白假絲酵母菌中也存在“滯留菌”,但與細(xì)菌滯留菌不同的是,白假絲酵母菌滯留菌只存在于生物膜狀態(tài)。本實(shí)驗首先進(jìn)行白假絲酵母菌生物膜中滯留菌形成的動態(tài)監(jiān)測,分析白假絲酵母菌生物膜中滯留菌產(chǎn)生的形成特點(diǎn),確定滯留菌產(chǎn)生比例變化較大的兩狀態(tài);進(jìn)一步運(yùn)用SSH(抑制性消減雜交)方法篩選兩狀態(tài)之間差異表達(dá)基因,即可能與滯留菌產(chǎn)生有關(guān)的基因,為下一步尋找滯留菌產(chǎn)生相關(guān)基因、揭開其產(chǎn)生機(jī)制及相關(guān)途徑奠定基礎(chǔ)。 材料和方法 (1)白假絲酵母菌生物膜中滯留菌形成的動態(tài)監(jiān)測及分析 分別以兩相型白似絲酵母菌標(biāo)準(zhǔn)菌液構(gòu)建體外生物膜模型,CFU計數(shù)法統(tǒng)計不同時間段生物膜加藥前真菌細(xì)胞繁列數(shù)目及加藥后滯留國產(chǎn)生數(shù)目,確定滯留菌產(chǎn)生數(shù)目變化較大的兩狀態(tài);結(jié)合激光共聚焦顯微鏡(CLSM),觀察生物膜形態(tài)變化,分析滯留菌產(chǎn)生的影響因素。 (2)SSH方法構(gòu)建白假絲酵母菌兩狀態(tài)之間cDNA(?)肖減文庫,初步篩選滯留菌產(chǎn)生相關(guān)基因 運(yùn)用SSH(抑制性消減雜交)技術(shù),針對上一步得出的白假絲酵母菌兩狀態(tài)之間進(jìn)行雙向雜交,分別篩選出兩狀態(tài)之間差異表達(dá)的基因,經(jīng)克隆擴(kuò)增、PCR方法鑒定重組質(zhì)粒,隨機(jī)挑選陽性克隆進(jìn)行測序,并在GenBank數(shù)據(jù)庫中進(jìn)行同源性比較。 結(jié)果 (1)兩相型菌液形成的不同時間段生物膜,真菌細(xì)胞繁殖數(shù)目及滯留菌數(shù)目均無顯著差異。其中,真菌細(xì)胞繁殖數(shù)目呈“S”形生長,12h后漸穩(wěn)定;滯留菌0.5h即大量產(chǎn)生,2h后數(shù)目已基本穩(wěn)定,此時鏡下生物膜處于微菌落始形成期。 (2)消減文庫構(gòu)建成功。經(jīng)鑒定,文庫獲得EST片段平均插入片段在300bp-600bp左右,重組率大于95%,正反向消減文庫的容量分別為2800和2600個;其中,正反向文庫分別挑選200個陽性克隆子測序,共獲得388條有效EST,聚類拼接后得到238條單基因簇(unigenes),包括53個重疊群(contigs)和185個單拷貝(singlets)。 結(jié)論 (1)白假絲酵母菌滯留菌的形成與其生物膜形成初期(2h內(nèi))附著表面的誘導(dǎo)密切相關(guān),而與其生物膜成熟程度及兩相型狀態(tài)無顯著關(guān)聯(lián)。 (2)SSH方法是快速篩選差異表達(dá)基因的有效方法,我們獲得的cDNA(?)肖減文庫為后續(xù)研究滯留菌產(chǎn)生機(jī)制及相關(guān)基因功能奠定了基礎(chǔ)。
【學(xué)位授予單位】:山東大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2013
【分類號】:R780.2

【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前3條

1 周艷宏;李桂源;;抑制消減雜交與基因芯片技術(shù)及其聯(lián)合應(yīng)用[J];國際腫瘤學(xué)雜志;2006年07期

2 李s

本文編號:2789548


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