【摘要】：目的利用來自美國國立生物信息技術中心(NCBI)基因表達數(shù)據(jù)庫(GEO)的基因芯片數(shù)據(jù),分析基因在口腔鱗狀細胞癌(OSCC)中癌和癌旁組織的差異表達情況,為尋找癌和癌旁組織雙邊的抑癌靶標提供依據(jù)。方法選取來自NCBI-GEO數(shù)據(jù)庫中OSCC患者的癌和癌旁組織,以及正常人口腔組織的基因芯片數(shù)據(jù),分別計算得到前兩者相對后者的差異表達基因,并進行功能聚類與特定基因的通路分析。結果大部分差異基因為癌與癌旁所共有,其中多數(shù)基因的差異表達方向在兩者中一致,少部分方向不一致。如WIF1基因在癌組織中表達下調(diào),但在癌旁組織中表達上調(diào)。這種差異表達行為的不同與基因的功能相關,因此,差異表達行為可能為抑癌靶標的發(fā)現(xiàn)提供線索。結論基因在癌和癌旁組織中的差異表達行為與基因的功能相關,具有特定差異表達行為的基因可能成為潛在的抑癌靶標。
[Abstract]:Objective to analyze the differential expression of (NCBI) gene in oral squamous cell carcinoma (OSCC) (OSCC) by using gene chip data from the (NCBI) gene expression database (GEO) of the National Center for Bioinformatics, USA. To provide a basis for finding bilateral tumor suppressor targets for cancer and adjacent tissues. Methods GeneChip data from cancer and adjacent tissues of OSCC patients and normal oral tissues from NCBI-GEO database were selected to calculate the difference between the former and the latter. Functional clustering and pathway analysis of specific genes were carried out. Results most of the differentially expressed genes were shared by cancer and paracarcinoma. For example, the expression of WIF1 gene was down-regulated in cancerous tissues, but up-regulated in paracancerous tissues. The differential expression behavior is related to the function of the gene, so the differential expression behavior may provide clues for the discovery of tumor suppressor target. Conclusion the differential expression behavior of genes in cancer and paracancerous tissues is related to the function of genes, and genes with specific differential expression behaviors may be potential targets for tumor suppression.
【作者單位】： 成都市成飛醫(yī)院口腔科;中國科學技術大學生命科學學院系統(tǒng)生物學系;
【分類號】：R739.8

【相似文獻】

相關期刊論文 前10條

1 李秀,柳海;Ⅳ型膠原與層粘蛋白在口腔鱗狀細胞癌中的表達及其意義[J];皖南醫(yī)學院學報;2003年02期

2 王雷,陳英新,高文信;血管內(nèi)皮細胞生長因子、堿性成纖維細胞生長因子在口腔鱗狀細胞癌中的表達研究[J];現(xiàn)代口腔醫(yī)學雜志;2004年04期

3 金曉明,李雅馨,劉桂芳,李金榮,李寧毅,賈暮云;血管內(nèi)皮生長因子對口腔鱗狀細胞癌細胞侵襲能力的影響[J];現(xiàn)代口腔醫(yī)學雜志;2005年01期

4 宋宇峰,馮紅超,溫玉明;口腔鱗狀細胞癌中巨噬細胞浸潤和腫瘤生長、轉移的關系[J];中華口腔醫(yī)學雜志;2005年05期

5 谷建琦;張英懷;楊威;;脆性組氨酸三聚體蛋白在口腔鱗狀細胞癌中的表達及意義[J];北京口腔醫(yī)學;2006年04期

6 王軍利;;180例口腔鱗狀細胞癌病理臨床分析[J];醫(yī)學理論與實踐;2007年06期

7 李春艷;高文信;張茹慧;王林;趙靜輝;李艷秋;;半定量PCR檢測口腔鱗狀細胞癌凋亡蛋白酶活化因子的表達[J];實用口腔醫(yī)學雜志;2008年06期

8 孫樂剛;王芳;劉玲;宋宇峰;楊佑成;王麗芳;;血管細胞黏附分子-1在口腔鱗狀細胞癌中的表達及其意義[J];華西口腔醫(yī)學雜志;2008年06期

9 高巍;郭傳tx;;口腔鱗狀細胞癌患源性診斷延遲相關因素分析[J];臨床誤診誤治;2008年07期

10 高巍;郭傳tx;;口腔鱗狀細胞癌患者診斷延遲現(xiàn)象的研究現(xiàn)狀[J];現(xiàn)代口腔醫(yī)學雜志;2008年04期

相關會議論文 前10條

1 高巍;郭傳tx;;口腔鱗狀細胞癌延誤診斷相關因素的前瞻性研究[A];第四屆中國腫瘤學術大會暨第五屆海峽兩岸腫瘤學術會議論文集[C];2006年

2 吳衍昌;李芳;;熱休克蛋白60在口腔鱗狀細胞癌中的表達及臨床意義[A];第八次全國口腔頜面—頭頸腫瘤會議論文匯編[C];2009年

3 張強;張永福;卓夏陽;賈云香;;口腔鱗狀細胞癌不同區(qū)域病理分級及增殖活性的差異[A];第一屆全國口腔頜面部腫瘤學術會議論文匯編[C];2001年

4 僗承翰;林美灄;戴鑓;_5正琪;;發(fā)展奈米金結合傳統(tǒng)化療藥物以抑制口腔鱗狀細胞癌之協(xié)同療法(英文)[A];2013第七屆海峽兩岸毒理學研討會大會手冊[C];2013年

5 吳洪儒;劉曉勇;王鳳光;汪育苗;;口腔鱗狀細胞癌淋巴結轉移危險因素的Logistic回歸分析[A];中華口腔醫(yī)學會第七屆全國口腔病理學術會議論文摘要匯編[C];2006年

6 劉曉勇;吳洪儒;汪育苗;王鳳光;;口腔鱗狀細胞癌淋巴結轉移相關因素的單因素分析[A];中華口腔醫(yī)學會第七屆全國口腔病理學術會議論文摘要匯編[C];2006年

7 李明賀;張茹慧;吳國民;;CD44 podoplanin在口腔鱗狀細胞癌中的表達及其意義[A];第八次全國口腔頜面—頭頸腫瘤會議論文匯編[C];2009年

8 張曄;郭傳tx;俞光巖;;口腔鱗狀細胞癌脂肪酸代謝的初步研究[A];第一屆全國口腔頜面部腫瘤學術會議論文匯編[C];2001年

9 郭傳tx;李羽安;高巖;;口腔鱗狀細胞癌頸淋巴轉移特征再探討[A];海峽兩岸2008口腔癌診治與修復重建新進展研討會論文集[C];2008年

10 張偉偉;熊學鵬;何三綱;張文峰;;≤40歲年輕女性口腔鱗狀細胞癌的臨床特點分析[A];第八次全國口腔頜面—頭頸腫瘤會議論文匯編[C];2009年

相關重要報紙文章 前1條

1 衣曉峰　喬蕤琳;哈醫(yī)大二院揭示口腔鱗狀細胞癌發(fā)生機理[N];中國醫(yī)藥報;2007年

相關博士學位論文 前9條

1 崔婧;口腔鱗狀細胞癌的生物信息學分析[D];山東大學;2014年

2 孫曉菊;環(huán)氧合酶-2與口腔鱗狀細胞癌關系的初步研究[D];中國醫(yī)科大學;2005年

3 吳國民;口腔鱗狀細胞癌腫瘤干細胞的分選和鑒定[D];吉林大學;2011年

4 董作青;Id-1基因沉默抑制口腔鱗狀細胞癌生長轉移的研究[D];山東大學;2010年

5 張曉英;Gadd45a在口腔鱗狀細胞癌預后及治療中的作用研究[D];山東大學;2011年

6 李男男;口腔鱗狀細胞癌中CADM1基因表達及啟動子區(qū)甲基化研究[D];吉林大學;2011年

7 王秋旭;口腔鱗狀細胞癌細胞外信號調(diào)節(jié)激酶及PTEN蛋白表達的研究[D];中國醫(yī)科大學;2005年

8 景捷;TIMPs對口腔鱗狀細胞癌β-DG表達特征影響的研究[D];四川大學;2007年

9 李春艷;口腔鱗狀細胞癌中Apaf-1基因、DAPK基因表達及啟動子區(qū)甲基化研究[D];吉林大學;2009年

相關碩士學位論文 前10條

1 張強;口腔鱗狀細胞癌不同區(qū)域病理學分級及增殖活性的差異[D];江西醫(yī)學院;2000年

2 張建運;β-連環(huán)蛋白及其相關因子在口腔鱗狀細胞癌中的表達[D];天津醫(yī)科大學;2007年

3 殷樹勛;血管內(nèi)皮生長因子在口腔鱗狀細胞癌表達的意義[D];青島大學;2001年

4 李秀;明膠酶及其抑制因子在口腔鱗狀細胞癌中表達的臨床病理研究[D];安徽醫(yī)科大學;2003年

5 周茜;上皮型鈣粘素及相關蛋白在口腔鱗狀細胞癌中的表達[D];武漢大學;2005年

6 杜格非;孟加拉紅染色用于早期口腔鱗狀細胞癌及癌前病變篩檢的臨床研究[D];武漢大學;2004年

7 葉平;口腔鱗狀細胞癌不同區(qū)域的p～53、p～21基因蛋白表達差異及臨床意義[D];江西醫(yī)學院;2000年

8 孫艷芳;樁蛋白（paxillin）在口腔磷狀細胞癌的表達及其生物學意義[D];吉林大學;2012年

9 蔣寧寧;口腔鱗癌轉移與MKK4基因表達的關系及其意義[D];廣西醫(yī)科大學;2011年

10 吳曉燕;hBD-1和hBD-2在口腔鱗癌患者腫瘤組織中的表達和意義[D];山西醫(yī)科大學;2008年

，

本文編號：2192836