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長(zhǎng)鏈非編碼RNA在舌鱗癌中的表達(dá)譜特征

發(fā)布時(shí)間:2018-03-07 19:00

  本文選題:長(zhǎng)鏈非編碼RNA 切入點(diǎn):舌鱗癌 出處:《中山大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)科學(xué)版)》2014年03期  論文類型:期刊論文


【摘要】:【目的】觀察長(zhǎng)鏈非編碼RNA(lncRNA)在正常舌組織和舌鱗癌組織中表達(dá)譜的變化!痉椒ā坷胠ncRNA表達(dá)譜芯片檢測(cè)技術(shù),篩查3例舌鱗癌組織及3例正常舌組織中l(wèi)ncRNA表達(dá)譜的變異,通過對(duì)原始數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理達(dá)到均一化后,確定舌鱗癌組織中2倍以上變化并有顯著差異(P0.05)的lncRNA為差異表達(dá)lncRNA,篩選出差異表達(dá)的lncRNA;分別在scc-9、cal-27、um-1和um-2共4種人舌鱗癌細(xì)胞和1種人正常舌細(xì)胞以及在35例舌鱗癌組織和12例正常舌組織中,利用實(shí)時(shí)熒光定量逆轉(zhuǎn)錄-多聚酶鏈反應(yīng)(qRT-PCR)對(duì)芯片結(jié)果進(jìn)行驗(yàn)證;對(duì)篩選所得的部分差異表達(dá)的lncRNA,利用lncRNA與mRNA特異性表達(dá)的標(biāo)準(zhǔn)化信號(hào)強(qiáng)度,構(gòu)建基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò),并進(jìn)行分析!窘Y(jié)果】芯片共篩選差異表達(dá)lncRNA 3590條,其中上調(diào)的共1785條,降低的共1805條;選取其中部分lncRNA,qRT-PCR進(jìn)一步證實(shí)了芯片結(jié)果的準(zhǔn)確性;共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建提示某些lncRNA可能在參與舌鱗癌發(fā)生發(fā)展過程中發(fā)揮重要調(diào)控作用!窘Y(jié)論】與正常舌組織比較,舌鱗癌組織lncRNA表達(dá)譜發(fā)生顯著變化,提示差異表達(dá)的lncRNA可能與舌鱗癌的多種惡性表型有著密切聯(lián)系。
[Abstract]:[objective] to observe the changes of lncRNA expression profile in normal tongue tissues and tongue squamous cell carcinoma tissues. [methods] the variation of lncRNA expression profile in 3 cases of tongue squamous cell carcinoma and 3 cases of normal tongue tissues was screened by lncRNA microarray. After preprocessing the raw data to achieve homogenization, LncRNA was identified as differentially expressed lncRNAs in tongue squamous cell carcinoma tissues with significant difference (P0.05), four human tongue squamous cell carcinoma cells and one human normal tongue cell line and 35 cases of tongue squamous cell carcinoma cell line scc-9 cal-27um-1 and um-2, respectively, were screened out for differential expression of LncRNAs. Tissue and 12 normal tongue tissues, Real-time fluorescence quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction (qRT-PCR) was used to verify the results of the microarray, and a gene coexpression network was constructed by using the standardized signal intensity of specific expression of lncRNA and mRNA to screen some differentially expressed LNC RNAs. [results] A total of 3590 differentially expressed lncRNA were screened on the chip, of which 1 785 were up-regulated and 1805 were decreased, and some of them were selected to confirm the accuracy of the results. The construction of coexpression network suggests that some lncRNA may play an important role in the development of tongue squamous cell carcinoma. [conclusion] compared with the normal tongue tissue, the expression profile of lncRNA in tongue squamous cell carcinoma is significantly changed. These results suggest that the differential expression of lncRNA may be closely related to the malignant phenotypes of tongue squamous cell carcinoma.
【作者單位】: 南方醫(yī)科大學(xué)附屬口腔醫(yī)院;廣東省口腔醫(yī)院口腔頜面外科;
【基金】:廣東省級(jí)財(cái)政技術(shù)研究開發(fā)與推廣應(yīng)用專項(xiàng)資金(2013年) 廣州市科技計(jì)劃項(xiàng)目科技惠民專項(xiàng)
【分類號(hào)】:R739.8

【參考文獻(xiàn)】

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【共引文獻(xiàn)】

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【二級(jí)參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):1580542

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