基于生物通路和蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)對(duì)重度抑郁癥相關(guān)易感基因的分析
發(fā)布時(shí)間:2023-10-07 19:25
研究目的:重度抑郁癥(Major depressive disorder;MDD)是由遺傳、環(huán)境和心理等多種因素共同作用而引起的復(fù)雜性精神系統(tǒng)障礙疾病。隨著全球抑郁癥患者的不斷增加,重度抑郁癥已經(jīng)成為僅次于人類心臟病的第二大疾患,它不僅嚴(yán)重影響患者的健康和生活,也給家庭和全社會(huì)都帶來了沉重的負(fù)擔(dān)。探索抑郁癥發(fā)病的分子機(jī)理,是開發(fā)預(yù)防和治療此類疾病的藥物及治療方法的基礎(chǔ)。近年來,已經(jīng)通過候選基因的遺傳關(guān)聯(lián)研究或在全基因組關(guān)聯(lián)研究鑒定了許多可能與MDD具有遺傳相關(guān)性的基因。然而,在許多情況下,這些基因及基因間的相互作用在MDD發(fā)病過程中的作用仍不清楚。本研究將試圖對(duì)與MDD具有遺傳相關(guān)性的基因進(jìn)行系統(tǒng)全面的分析。我們通過篩選人類遺傳關(guān)聯(lián)研究收集MDD顯著相關(guān)的易感基因,然后基于功能分析和通路串話分析揭示與這些基因相關(guān)的生物過程,探索疾病涉及的通路模塊及其通路之間的關(guān)系。此外,在人類蛋白質(zhì)相互作用組的背景下構(gòu)建了MDD特異性子網(wǎng)絡(luò),該網(wǎng)絡(luò)進(jìn)一步提供了與MDD相關(guān)的基因之間關(guān)系的更多信息,并引入了可能與該疾病相關(guān)的新基因?傊,基于通路和網(wǎng)絡(luò)的方法探索了系統(tǒng)生物學(xué)水平上MDD發(fā)病的分子機(jī)制。另...
【文章頁數(shù)】:114 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
abstract
縮略語/符號(hào)說明
一、前言
1.1 研究背景
1.1.1 重度抑郁癥
1.1.2 阿爾茨海默氏癥
1.1.3 MDD與 AD的共患病現(xiàn)狀研究
1.2 功能富集分析
1.3 蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)分析
1.4 研究目的及意義
1.5 研究?jī)?nèi)容及方法
1.6 論文創(chuàng)新點(diǎn)
1.7 論文結(jié)構(gòu)安排
二、原理和方法
2.1 數(shù)據(jù)收集
2.1.1 疾病易感基因
2.1.2 AD易感基因和其他基因
2.1.3 蛋白質(zhì)相互作用數(shù)據(jù)集
2.2 富集分析方法
2.3 通路串話分析
2.4 蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浞治?br> 2.5 疾病特異性子網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建
2.6 基于通路和網(wǎng)絡(luò)的方法比較MDD和 AD
2.6.1 顯著通路的富集分析
2.6.2 MDD和 AD蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò)的比較分析
2.6.3 預(yù)測(cè)潛在共病易感基因
三、結(jié)果與分析
3.1 疾病易感基因
3.1.1 MDD易感基因
3.1.2 AD易感基因
3.2 GO富集分析
3.3 通路富集分析
3.4 通路串話分析
3.5 PPIN拓?fù)涮匦苑治?br> 3.6 構(gòu)建特異性子網(wǎng)絡(luò)
3.7 基于通路和網(wǎng)絡(luò)的方法比較MDD和 AD
3.7.1 MDD與 AD基因的比較
3.7.2 通路富集分析比較
3.7.3 網(wǎng)絡(luò)拓?fù)涮匦缘谋容^
3.7.4 MDD和 AD風(fēng)險(xiǎn)基因的預(yù)測(cè)
四、結(jié)論與討論
4.1 結(jié)論
4.1.1 功能富集分析
4.1.2 MDD特異性子網(wǎng)絡(luò)的分析
4.1.3 基于通路和網(wǎng)絡(luò)對(duì)MDD和 AD的比較
4.2 討論
4.3 本研究的不足之處
參考文獻(xiàn)
附錄
附錄1 MDD易感基因集
附錄2 AD易感基因集
附錄3 MDD基因集富集的316 條顯著性BP
附錄4 MDD基因富集的73 條顯著性通路
附錄5 AD基因富集80 條顯著性通路
綜述
綜述參考文獻(xiàn)
致謝
個(gè)人簡(jiǎn)歷
本文編號(hào):3852356
【文章頁數(shù)】:114 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
abstract
縮略語/符號(hào)說明
一、前言
1.1 研究背景
1.1.1 重度抑郁癥
1.1.2 阿爾茨海默氏癥
1.1.3 MDD與 AD的共患病現(xiàn)狀研究
1.2 功能富集分析
1.3 蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)分析
1.4 研究目的及意義
1.5 研究?jī)?nèi)容及方法
1.6 論文創(chuàng)新點(diǎn)
1.7 論文結(jié)構(gòu)安排
二、原理和方法
2.1 數(shù)據(jù)收集
2.1.1 疾病易感基因
2.1.2 AD易感基因和其他基因
2.1.3 蛋白質(zhì)相互作用數(shù)據(jù)集
2.2 富集分析方法
2.3 通路串話分析
2.4 蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浞治?br> 2.5 疾病特異性子網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建
2.6 基于通路和網(wǎng)絡(luò)的方法比較MDD和 AD
2.6.1 顯著通路的富集分析
2.6.2 MDD和 AD蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò)的比較分析
2.6.3 預(yù)測(cè)潛在共病易感基因
三、結(jié)果與分析
3.1 疾病易感基因
3.1.1 MDD易感基因
3.1.2 AD易感基因
3.2 GO富集分析
3.3 通路富集分析
3.4 通路串話分析
3.5 PPIN拓?fù)涮匦苑治?br> 3.6 構(gòu)建特異性子網(wǎng)絡(luò)
3.7 基于通路和網(wǎng)絡(luò)的方法比較MDD和 AD
3.7.1 MDD與 AD基因的比較
3.7.2 通路富集分析比較
3.7.3 網(wǎng)絡(luò)拓?fù)涮匦缘谋容^
3.7.4 MDD和 AD風(fēng)險(xiǎn)基因的預(yù)測(cè)
四、結(jié)論與討論
4.1 結(jié)論
4.1.1 功能富集分析
4.1.2 MDD特異性子網(wǎng)絡(luò)的分析
4.1.3 基于通路和網(wǎng)絡(luò)對(duì)MDD和 AD的比較
4.2 討論
4.3 本研究的不足之處
參考文獻(xiàn)
附錄
附錄1 MDD易感基因集
附錄2 AD易感基因集
附錄3 MDD基因集富集的316 條顯著性BP
附錄4 MDD基因富集的73 條顯著性通路
附錄5 AD基因富集80 條顯著性通路
綜述
綜述參考文獻(xiàn)
致謝
個(gè)人簡(jiǎn)歷
本文編號(hào):3852356
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