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應(yīng)用全基因組測序技術(shù)研究多發(fā)性自閉癥譜系疾病家系

發(fā)布時間:2017-12-22 03:13

  本文關(guān)鍵詞:應(yīng)用全基因組測序技術(shù)研究多發(fā)性自閉癥譜系疾病家系 出處:《華南理工大學(xué)》2016年碩士論文 論文類型:學(xué)位論文


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【摘要】:自閉癥譜系疾病(Autism Spectrum Disorders,ASDs)表現(xiàn)為在幼年時期神經(jīng)發(fā)育失常的癥狀,影響著1/88的美國兒童。早先應(yīng)用全外顯子組測序技術(shù)對自閉癥家庭trios開展的回顧性研究表明自閉癥發(fā)病原因中一些罕見的、de novo的基因突變扮演著重要的角色。為了檢驗全基因組測序在鑒定遺傳性疾病的候選突變和候選基因的效果,我們測序了一個大家系(包括父母雙方及8個孩子)中的2個先證者,然后應(yīng)用多種數(shù)據(jù)分析策略篩選出了一系列跟自閉癥譜系疾病最為相關(guān)的候選基因。假設(shè)自閉癥是一種隱性遺傳模式,我們在2個先證者中均鑒定出7個候選基因。同時還評估出另一種不需要疾病模式假設(shè)的數(shù)據(jù)分析策略,并篩選出一個可能會增強自閉癥易感性的59個候選基因突變列表。通過人為的對這些突變進行分析后發(fā)現(xiàn)ANK3是最有可能跟自閉癥發(fā)病原因相關(guān)的候選基因。最后,基于進化約束和ENCODE(Encyclopedia of DNA Elements)的實驗證據(jù),我們鑒定出與SMG6和COQ5相似的33種非編碼突變。雖然我們沒能嚴格的確認這些基因里是否真的在自閉癥形成過程中起作用,但我們的分析結(jié)果為進一步的驗證研究提供了一個優(yōu)化了的短名單。這是最早利用全基因組測序技術(shù)對大的自閉癥家系進行相關(guān)研究的課題之一。這些結(jié)果為在神經(jīng)精神系統(tǒng)的和神經(jīng)發(fā)育類疾病前提下,到底是在散發(fā)病例中尋找de novo突變好還是在大的家系樣本中尋找遺傳性突變好提供了一個討論。
【學(xué)位授予單位】:華南理工大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號】:R749.94

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5 薛t,

本文編號:1318203


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