發(fā)布時間：2017-12-11 09:42

  本文關(guān)鍵詞：阿爾茨海默病相關(guān)的生物信息學(xué)分析

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【摘要】：目的探討阿爾茨海默病(AD)發(fā)生發(fā)展相關(guān)的基因。方法 1利用生物信息學(xué)方法挖掘現(xiàn)有文獻(xiàn),NLP分析方法進(jìn)行關(guān)于AD文獻(xiàn)挖掘。2Gene Ontology(GO)分析方法進(jìn)行相關(guān)基因功能分類。3Pathway分析方法統(tǒng)計基因在每個Pathway中的富集程度。4基因網(wǎng)絡(luò)分析方法將上述三種結(jié)果整合為基因間的相互關(guān)系網(wǎng)絡(luò),并篩選出AD相關(guān)信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路中的樞紐基因(Hub基因)。結(jié)果與AD發(fā)生發(fā)展相關(guān)的文獻(xiàn)和基因分別為8 900篇和898個,繪制與AD發(fā)生發(fā)展有關(guān)的相關(guān)基因的生物信號網(wǎng)絡(luò),發(fā)現(xiàn)AD相關(guān)基因的表達(dá)參與到14種生物學(xué)過程、12種細(xì)胞的組成和25個不同的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路(P0.01),執(zhí)行9種生物分子功能,并與24種疾病(P0.01)的發(fā)生發(fā)展有關(guān)。研究基因/蛋白質(zhì)相互作用發(fā)現(xiàn),PIK3CG等21個為AD相關(guān)基因網(wǎng)絡(luò)中連接程度最高的21個基因(P0.05),即Hub基因。結(jié)論文獻(xiàn)挖掘得到的相關(guān)信號通路(Cytokine-cytokine receptor interaction信號通路)及Hub基因(PIK3CG、CBL)與AD的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)。
【作者單位】： 鄭州大學(xué)第一附屬醫(yī)院神經(jīng)內(nèi)科;
【基金】：國家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(81071114)
【分類號】：R749.16
【正文快照】： 2013年美國阿爾茨海默病(AD)患者約有520萬,其中大于65歲的患者約有500萬〔1〕。隨著人類壽命的延長,每年約有100萬新發(fā)病例,到2050年,預(yù)計AD患者將達(dá)到1 380萬,是目前患病人數(shù)的3倍〔1〕。雖然在過去的30年有大量針對AD的癥狀、發(fā)病原因、危險因素和治療的研究,但是AD的發(fā)病

【參考文獻(xiàn)】

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【二級參考文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前2條

1 吳志英;孫一_，

本文編號：1278003