本文關(guān)鍵詞：基于模糊聚類(lèi)的頂點(diǎn)著色算法識(shí)別阿爾茨海默病的候選基因

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【摘要】：阿爾茨海默病一種最常見(jiàn)的癡呆病，估計(jì)目前國(guó)內(nèi)患有該病的人數(shù)達(dá)到900萬(wàn)。但是目前治療該病并沒(méi)有有效的藥物，僅僅是緩解病情的發(fā)展，因此識(shí)別與阿爾茨海默病相關(guān)的候選基因是一項(xiàng)重要任務(wù)。通過(guò)設(shè)計(jì)算法，分析基因表達(dá)數(shù)據(jù)，識(shí)別出與疾病相關(guān)的候選基因，研究阿爾茨海默病的發(fā)病機(jī)制，從而達(dá)到治療阿爾茨海默病。 聚類(lèi)是計(jì)算分析的一種常用方法。本文的總體思想是通過(guò)模糊聚類(lèi)方法把基因數(shù)據(jù)分成一些大類(lèi)，，然后利用頂點(diǎn)著色原理把每個(gè)大類(lèi)進(jìn)行再次分類(lèi)，最后分析分類(lèi)結(jié)果，識(shí)別出與阿爾茨海默病相關(guān)的候選基因。在本文中，首先判斷了基因表達(dá)數(shù)據(jù)是具有聚類(lèi)趨勢(shì)，再者根據(jù)模糊聚類(lèi)中目標(biāo)函數(shù)和有效性指標(biāo)函數(shù)，從而確定了模糊指數(shù)和聚類(lèi)數(shù)目的取值，最后利用頂點(diǎn)著色算法細(xì)分每個(gè)大類(lèi)，得到分類(lèi)結(jié)果和孤立基因。 利用以上方法，本文識(shí)別出了45個(gè)孤立基因可能與阿爾茨海默病有關(guān)，其中3個(gè)基因（SST、MOBP和NTRK2）已經(jīng)報(bào)道了與阿爾茨海默病有關(guān)，另外3個(gè)基因（KIF18A、PLEC和VIM）與細(xì)胞骨架有關(guān)，3個(gè)基因（HLA-DQB1、HLA-DRA和SPN）與免疫應(yīng)答有關(guān)以及IL17RB與炎癥有關(guān)。最后給出了一些基因與阿爾茨海默病的關(guān)系圖。
【學(xué)位授予單位】：四川師范大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2014
【分類(lèi)號(hào)】：R749.16

【參考文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前7條

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本文編號(hào)：1218387