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中重型顱腦損傷患者腸道菌群的研究分析

發(fā)布時間:2020-05-06 18:28
【摘要】:目的顱腦損傷患者往往多伴有胃腸道功能障礙,而腸道菌群在維持胃腸道生態(tài)平衡中具有重要作用,可通過迷走神經(jīng)系統(tǒng)和腸神經(jīng)系統(tǒng)與中樞神經(jīng)系統(tǒng)產(chǎn)生相互作用。我們推測腸道菌群可能與顱腦損傷患者的病理改變以及胃腸道癥狀有密切聯(lián)系。本研究擬探討顱腦損傷患者與健康對照組人群腸道菌群微生態(tài)結(jié)構(gòu)差異和紊亂特征;經(jīng)益生菌干預(yù)治療后,觀察顱腦損傷患者腸道菌群恢復(fù)特點(diǎn),探索顱腦損傷與腸道菌群之間的關(guān)系,揭示腸道菌群在顱腦損傷病理改變中的作用,以求為顱腦損傷的診治提供新的輔助治療,進(jìn)而改善患者的預(yù)后。方法根據(jù)病例對照研究,本研究第一部分選取24例中重型顱腦損傷患者和10健康對照志愿者的糞便樣本為研究對象;贗onS5~(TM)XL測序平臺和多元統(tǒng)計學(xué)方法檢測腸道菌群16S rRNA的V4序列的多樣性,揭示顱腦創(chuàng)傷患者和健康對照組群落結(jié)構(gòu)的差異特征。本研究第二部分選取6例中重型顱腦損傷患者和8例經(jīng)益生菌干預(yù)治療后的顱腦損傷患者的入院首次糞便樣本為研究對象,分析益生菌對顱腦損傷患者腸道菌群的作用。此外,利用Tax4Fun工具預(yù)測腸道菌群的基因功能。結(jié)果本研究發(fā)現(xiàn)健康對照人群和顱腦損傷患者的腸道菌群優(yōu)勢菌門相同,都是Firmicutes(厚壁菌門)、Bacteroides(擬桿菌門)、Proteobacteria(變形菌門)。健康對照組的Observed species、Chao1指數(shù)均顯著低于顱腦損傷組(P0.05);但兩組的Shannon、Simpson指數(shù)未見顯著差異(P0.05)。顱腦損傷患者菌群失衡主要表現(xiàn)為Firmicutes(厚壁菌門)、Actinobacteria(放線菌門)、Blautia、Lachnospiraceae(毛螺菌科)、Ruminococcaceae(瘤胃菌科)、Faecalibacterium(柔嫩梭菌屬)、Bifidobacteriaceae(雙歧桿菌科)相對豐度較健康對照人群顯著降低,變形菌門、Akkermansia muciniphila、Enterococcus(腸球菌屬)相對豐度較健康對照人群顯著增高。經(jīng)益生菌干預(yù)治療后,顱腦損傷患者腸道菌群在Clostridiales(梭菌目)、Blautia、Faecalibacterium(柔嫩梭菌屬)、unidentified Lachnospiraceae(未分類毛螺菌科)、Bifidobacterium(雙歧桿菌屬)、Ruminococcus sp.5_1_39BFAA、Subdoligranulum、Eubacterium hallii(霍氏真桿菌)等益生菌增加;而Enterococcaceae(腸球菌科)、Enterococcus(腸球菌屬)等致病菌降低。此外,Tax4Fun功能預(yù)測顯示,顱腦損傷患者腸道菌群的遺傳信息加工、環(huán)境信息加工、細(xì)胞過程功能作用較健康對照人群顯著減弱,組織系統(tǒng)、新陳代謝、人類疾病和未分類功能作用較健康對照組增強(qiáng);而經(jīng)益生菌干預(yù)治療后,患者的遺傳信息加工、環(huán)境信息加工、細(xì)胞過程功能作用得到增強(qiáng)。結(jié)論本研究發(fā)現(xiàn)顱腦損傷患者腸道菌群與健康對照組人群具有顯著的差異,主要表現(xiàn)為降解纖維素、產(chǎn)生短鏈脂肪酸的等有益菌減少以及條件致病菌的增加。顱腦損傷患者經(jīng)益生菌干預(yù)治療后,主要表現(xiàn)為降解纖維素等有益菌增加以及條件致病菌的減少。根據(jù)Tax4Fun預(yù)測結(jié)果證明顱腦損傷患者腸道菌群與健康人群在生長代謝、信息傳遞等方面存在差異,顱腦損傷患者的腸道菌群功能受到明顯破壞;口服益生菌可促進(jìn)顱腦損傷患者腸道菌群的恢復(fù)。
【圖文】:

曲線,序列數(shù),測序,數(shù)目


基本信息 PT 組 HC 組 P 值例數(shù)性別男女年齡2419550.41±13.40109148.9±8.970.6440.912樣性分析曲線稀釋曲線,查看樣品測序深度,了解測序數(shù)據(jù)量的合理味著測序數(shù)據(jù)量漸進(jìn)合理,測試的深度已經(jīng)覆蓋到樣本曲線見圖 2,可以看出開始時曲線上升較快,提示測序,隨著測序數(shù)據(jù)增加,曲線趨向平坦,繼續(xù)添加樣本,明本研究樣品測序深度足夠,測序數(shù)據(jù)量合理。

曲線,相對豐度,等級,縱坐標(biāo)


等級聚類曲線(橫坐標(biāo)代表 OTU 等級,縱坐標(biāo)對應(yīng)的 OTU 的相對豐度)2.4α 多樣性分析α 多樣性是檢驗單個樣本內(nèi)多樣性的方法,最基本的測定是豐富度以及樣到的物種數(shù)量,其主要表示組內(nèi)差異。ACE、Chao1 用于估算物種總數(shù),表明物種多。Shannon、Simpson 代表菌群多樣性,前一個數(shù)值越大,后一小,,說明物種多樣性高,分布越均勻。HC 組和 PT 組測序指數(shù)見表 2。H群的 ACE、Chao1 指數(shù)均顯著低于 PT 組(P<0.05),說明 PT 組與 HC 組道內(nèi)菌群較多,豐度指數(shù)高;但各組的 Shannon、Simpson 指數(shù)未見顯著0.05),說明兩組腸道菌群多樣性差異不明顯。
【學(xué)位授予單位】:天津醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號】:R651.15

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5 樂t帕

本文編號:2651678


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