本文關鍵詞：剛地弓形蟲蘋果酸脫氫酶基因編碼蛋白主要特性與抗原表位的生物信息學分析

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【摘要】：目的用生物信息學方法分析剛地弓形蟲蘋果酸脫氫酶(TgMDH)基因編碼蛋白的結構與抗原表位,預測該蛋白的免疫原性。方法利用蛋白分析專家系統(tǒng)(ExPASy)提供的ProtParam、SOSUI、TMPRED、HNN、MotifScan和NCBI上的ORF finder、SignalP、Bcepred等生物信息學在線分析程序,結合Gene Runner和DNAMAN等生物信息學軟件,分析并預測TgMDH蛋白的開放閱讀框、理化性質、可溶性、信號肽、跨膜區(qū)、表面可及性、可塑性、親(疏)水性、翻譯后修飾位點、二級結構及抗原表位,通過CPHmodels程序預測該蛋白的三維空間結構。結果 TgMDH蛋白由316個氨基酸組成,分子式為C1498H2454N402O440S20,分子質量單位為33 777.5,等電點為6.01,波長280nm時的吸光度(A)值為0.364,半衰期為30h,有9個表面可及性參數(shù)≥1.9的區(qū)域、4個親水性參數(shù)得分≥1.9的區(qū)域、7個柔韌性參數(shù)得分≥2的區(qū)域、14個翻譯后修飾位點和14個潛在抗原表位,為可溶性表達蛋白。結論 TgMDH基因編碼蛋白為可溶性蛋白,有多個抗原表位,具有免疫原性,可作為弓形蟲病疫苗候選抗原。
【作者單位】： 徐州醫(yī)學院;
【關鍵詞】： 剛地弓形蟲 蘋果酸脫氫酶 生物信息學 抗原表位 免疫原性
【基金】：江蘇省寄生蟲病預防與控制高技術平臺開放課題(No.WK009-003) 徐州醫(yī)學院科研課題(No.2012KJ08)聯(lián)合資助~~
【分類號】：R392
【正文快照】： 剛地弓形蟲(Toxoplasma gondii,Tg)是一種專性細胞內寄生原蟲,可引起人獸共患弓形蟲病,尚無防治本病的理想藥物,篩選有效的保護性抗原研制疫苗是關鍵所在[1]。蘋果酸脫氫酶(malate dehydrogenase,MDH)是細胞在有氧條件下進行三羧酸循環(huán)的重要酶之一[2-4]。MDH在細胞的多種生

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本文編號：741230