本文關(guān)鍵詞：基于氨基酸性質(zhì)的EB病毒抗原MHC-Ⅰ類分子限制性表位的定量構(gòu)效關(guān)系建模

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【摘要】：目的建立EB病毒(EBV)抗原表位的理論計(jì)算模型并用于其定量預(yù)測(cè),為腫瘤免疫的多肽疫苗設(shè)計(jì)提供理論基礎(chǔ)。方法從表位數(shù)據(jù)庫中收集33條EBV抗原表位,使用逐步回歸(STR)方法篩選2個(gè)對(duì)平衡解離常數(shù)(KD)貢獻(xiàn)較大的結(jié)構(gòu)參數(shù)用于表位的結(jié)構(gòu)表征,最后用多元線性回歸(MLR)方法建立結(jié)構(gòu)參數(shù)與KD的定量構(gòu)效關(guān)系(QSAR)模型。結(jié)果該模型具有較好的穩(wěn)定性(R2=0.637,Q2=0.581)與預(yù)測(cè)能力(R2test=0.501)。結(jié)論此方法可確定表位中各個(gè)氨基酸的物理性質(zhì)對(duì)于平衡解離常數(shù)的貢獻(xiàn),為表位設(shè)計(jì)與改造提供直接線索;STR和MLR相結(jié)合建模方法具有物化意義明確、易于解釋及操作簡(jiǎn)便易行等優(yōu)點(diǎn)。
【作者單位】： 重慶理工大學(xué)藥學(xué)與生物工程學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】： EB病毒 表位 平衡解離常數(shù) 構(gòu)效關(guān)系 腫瘤
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(60873103);國(guó)家自然科學(xué)基金重點(diǎn)項(xiàng)目(30830090) 重慶市自然科學(xué)基金(CSTC,2010BB5306)
【分類號(hào)】：R392.9
【正文快照】： EB病毒(Epstein-Barr virus,EBV)是一種γ皰疹病毒,感染全球超過90%的人群[1]。體外研究顯示,EBV在感染前通過補(bǔ)體2(CD2)潛伏在B淋巴細(xì)胞中;在體內(nèi)通過正常B細(xì)胞實(shí)現(xiàn)持續(xù)感染[2]。EBV感染初期可引起宿主短期的B淋巴細(xì)胞增殖,通常可通過自身限制以及激活T細(xì)胞免疫響應(yīng)得以控制

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本文編號(hào)：552208