目的研究幼年期、成年期和老年期小鼠側(cè)腦室下區(qū)(subventricular zone,SVZ)中基因表達(dá)的增齡性變化。方法分別提取3周齡、6月齡和20月齡C57小鼠SVZ的mRNA,基于轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù),檢測(cè)SVZ中在不同年齡階段的基因表達(dá)差異。結(jié)果以幼年期小鼠為對(duì)照,成年期檢測(cè)到253個(gè)差異表達(dá)的基因,老年期檢測(cè)到519個(gè),以成年期作對(duì)照,老年期檢測(cè)到147個(gè)差異表達(dá)的基因。GO分析發(fā)現(xiàn)成年期小鼠與幼年期相比差異表達(dá)基因主要涉及營(yíng)養(yǎng)和代謝,老年期小鼠與成年期相比主要涉及中樞神經(jīng)系統(tǒng)神經(jīng)元分化等。KEGG分析發(fā)現(xiàn)差異表達(dá)基因主要涉及通路為蛋白質(zhì)消化吸收、神經(jīng)活性配體-受體相互作用等。結(jié)論該研究提供了不同年齡段SVZ轉(zhuǎn)錄水平基因變化的數(shù)據(jù),為探討SVZ的功能發(fā)育和退化,進(jìn)一步治療和抵抗神經(jīng)衰老提供新的理論依據(jù)和方法。

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圖2差異基因表達(dá)Venn圖

另外為了驗(yàn)證轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果的可信度，通過(guò)實(shí)時(shí)熒光定量PCR(qPCR)檢測(cè)差異表達(dá)基因的表達(dá)情況。如圖4所示，qPCR檢測(cè)的幾個(gè)基因表達(dá)情況與轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果一致。圖3幼年、成年與老年期小鼠神經(jīng)干細(xì)胞差異表達(dá)基因統(tǒng)計(jì)

圖3幼年、成年與老年期小鼠神經(jīng)干細(xì)胞差異表達(dá)基因統(tǒng)計(jì)

圖2差異基因表達(dá)Venn圖2.2GO分析

圖4差異基因表達(dá)qPCR驗(yàn)證

利用clusterProfilerR軟件對(duì)差異基因進(jìn)行KEGG通路分析(圖6)。成年期與幼年期小鼠的SVZ比較，差異表達(dá)基因涉及蛋白質(zhì)消化吸收的信號(hào)通路。老年期與幼年期小鼠的SVZ比較，涉及信號(hào)通路較多，包括神經(jīng)活性配體-受體相互作用、cAMP信號(hào)通路、嗎啡成癮、多巴胺能突....

圖5GO功能分類

本研究對(duì)小鼠幼年、成年和老年期SVZ的cDNA文庫(kù)進(jìn)行分析，幼年與成年期或老年期小鼠對(duì)比，共檢測(cè)到253個(gè)及519個(gè)差異表達(dá)的基因;成年與老年期小鼠對(duì)比，共檢測(cè)到147個(gè)差異表達(dá)的基因。意料之中的是，由于小鼠從幼年到老年發(fā)育時(shí)間跨度較長(zhǎng)，差異表達(dá)的基因數(shù)目最多。小鼠作為經(jīng)典的模式....

本文編號(hào)：3912052