分析DNA損傷特異結(jié)合蛋白2（DDB2）基因的啟動子、CpG島、轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點、基因表達情況;分析DDB2蛋白的理化性質(zhì)、同源性、亞細胞定位、信號肽和跨膜區(qū)域、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)及相互作用網(wǎng)絡(luò)。DDB2基因至少含有2個啟動子。啟動子區(qū)存在2個CpG島,長度分別109 bp和267 bp,而且至少包含NF-1和Sp1兩個轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點。DDB2基因在人體正常組織中均有表達,在白血病早幼粒細胞HL-60、721B淋巴母細胞中表達最高。DDB2蛋白是由427個氨基酸組成的無信號肽、無跨膜區(qū)域的親水蛋白。主要定位于細胞核,二級結(jié)構(gòu)以隨機卷曲為主。還發(fā)現(xiàn)蛋白DDB1、CUL4A、CUL4B、XPA、COPS2、COPS4、COPS8、COPS5、COPS7B、TP53可能與DDB2存在相互作用。生物信息學(xué)對于基因及蛋白質(zhì)研究具有重要作用。本文通過生物信息學(xué)的方法對DDB2基因及蛋白質(zhì)進行分析,為DDB2的實驗研究提供理論基礎(chǔ)和新的線索。 

【文章來源】：楚雄師范學(xué)院學(xué)報. 2020,35(03)

【文章頁數(shù)】：7 頁

【部分圖文】：

DDB2基因在人體各種組織的表達

EMBOSS CPGplot預(yù)測DDB2基因啟動子區(qū)的CpG島（A、B區(qū)域為預(yù)測的CpG島位置）

MethPrime預(yù)測DDB2基因啟動子區(qū)的CpG島（A、B區(qū)域為預(yù)測的CpG島位置）

【參考文獻】：
期刊論文
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碩士論文
[1]探討DDB2基因?qū)︷畀徳錾择：坌纬杉癟GF-β/Smads信號通路的影響[D]. 熊夢媛.西南醫(yī)科大學(xué) 2019



本文編號：3494019