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基于重組酶介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)的細(xì)粒棘球絳蟲(chóng)核酸檢測(cè)方法的建立

發(fā)布時(shí)間:2021-06-11 15:21
  目的建立一種基于重組酶介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)(RAA)的細(xì)粒棘球絳蟲(chóng)核酸檢測(cè)方法。方法針對(duì)細(xì)粒棘球絳蟲(chóng)12S rRNA基因序列片段,設(shè)計(jì)、篩選并合成RAA特異性擴(kuò)增引物和熒光檢測(cè)探針,構(gòu)建細(xì)粒棘球絳蟲(chóng)熒光RAA檢測(cè)方法。分別以含靶序列的不同拷貝數(shù)重組質(zhì)粒和不同濃度細(xì)粒棘球絳蟲(chóng)基因組DNA為模板進(jìn)行熒光RAA擴(kuò)增,評(píng)價(jià)其檢測(cè)靈敏度;分別以細(xì)粒棘球絳蟲(chóng)、多房棘球絳蟲(chóng)、日本血吸蟲(chóng)、曼氏血吸蟲(chóng)、十二指腸鉤蟲(chóng)、華支睪吸蟲(chóng)、牛帶絳蟲(chóng)、曼氏迭宮絳蟲(chóng)、豬帶絳蟲(chóng)基因組DNA為模板進(jìn)行熒光RAA擴(kuò)增,評(píng)價(jià)其檢測(cè)特異性。結(jié)果成功建立了細(xì)粒棘球絳蟲(chóng)熒光RAA檢測(cè)法,在39℃條件下20 min內(nèi)可以實(shí)現(xiàn)對(duì)細(xì)粒棘球絳蟲(chóng)基因組DNA特異性擴(kuò)增,最低可以檢測(cè)出10拷貝/μL含靶序列的重組質(zhì)粒DN A和0.1 ng/μL細(xì)粒棘球絳蟲(chóng)基因組DN A樣本,具備較高敏感性;對(duì)多房棘球絳蟲(chóng)、日本血吸蟲(chóng)、曼氏血吸蟲(chóng)、十二指腸鉤蟲(chóng)、華支睪吸蟲(chóng)、牛帶絳蟲(chóng)、曼氏迭宮絳蟲(chóng)、豬帶絳蟲(chóng)基因組DNA均無(wú)陽(yáng)性擴(kuò)增,具備較高特異性;且該熒光RAA法可成功檢出細(xì)粒棘球絳蟲(chóng)包囊中DNA。結(jié)論成功建立了一種快速、靈敏、特異的可用于細(xì)粒棘球絳蟲(chóng)核酸檢測(cè)的熒光R... 

【文章來(lái)源】:中國(guó)血吸蟲(chóng)病防治雜志. 2020,32(04)北大核心CSCD

【文章頁(yè)數(shù)】:5 頁(yè)

【部分圖文】:

基于重組酶介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)的細(xì)粒棘球絳蟲(chóng)核酸檢測(cè)方法的建立


熒光RAA法檢測(cè)細(xì)粒棘球絳蟲(chóng)包囊DNA樣本FigFig.2FluorescentRAAassayfordetectionofDNAsamplesfromEE.granulosuscysts

熒光,敏感性,質(zhì)粒,模板


中國(guó)血吸蟲(chóng)病防治雜志2020年第32卷第4期ChinJSchistoControl2020,Vol.32,No.4間逐漸延長(zhǎng)(K值依次為6732、3837、1075、116)。本次實(shí)驗(yàn)最低可檢測(cè)到含有10拷貝/μL重組質(zhì)粒的熒光信號(hào)(圖3)。采用熒光RAA法檢測(cè)不同濃度細(xì)粒棘球絳蟲(chóng)基因組DNA樣本。結(jié)果顯示,除陰性對(duì)照外,濃度分別為10、1、0.1ng/μL的細(xì)粒棘球絳蟲(chóng)基因組DNA樣本均出現(xiàn)陽(yáng)性擴(kuò)增(K值分別為7186、1675、296),檢測(cè)敏感性可達(dá)0.1ng/μL基因組DNA(圖4)。圖3以不同拷貝數(shù)重組質(zhì)粒為模板的熒光RAA法檢測(cè)敏感性FigFig.3SensitivityoffluorescentRAAassayusingvariouscopynumbersofrecombinantplasmidsastemplates圖4以不同濃度細(xì)粒棘球絳蟲(chóng)基因組DNA為模板的熒光RAA法檢測(cè)敏感性FigFig.4SensitivityoffluorescentRAAassayusingdifferentconcentrationsofEE.granulosusgenomicDNAsamplesastemplates4熒光RAA法檢測(cè)特異性分別以細(xì)粒棘球絳蟲(chóng)包囊、多房棘球絳蟲(chóng)幼蟲(chóng)、日本血吸蟲(chóng)蟲(chóng)卵、曼氏血吸蟲(chóng)蟲(chóng)卵、十二指腸鉤蚴培養(yǎng)物、華支睪吸蟲(chóng)囊蚴、牛帶絳蟲(chóng)孕節(jié)、曼氏迭宮絳蟲(chóng)孕節(jié)、豬帶絳蟲(chóng)孕節(jié)基因組DNA為模板進(jìn)行熒光RAA擴(kuò)增,結(jié)果顯示,細(xì)粒棘球絳蟲(chóng)包囊DNA存在陽(yáng)性擴(kuò)增(K值為657),其他樣本擴(kuò)增結(jié)果均為陰性(圖5)。圖5熒光RAA法檢測(cè)特異性Figig.5SpecificityoffluorescentRAAassay討論棘球蚴病在我國(guó)中西北部地區(qū)仍存在較大范圍流行,嚴(yán)重威脅著流行區(qū)人民群眾身體健康和生活水平[13];同時(shí),隨著西部牛羊等大量流入東部地區(qū),也給當(dāng)?shù)貛?lái)了一定的棘球蚴病傳播風(fēng)險(xiǎn)[1

絳蟲(chóng),熒光,基因組DNA,敏感性


吸蟲(chóng)病防治雜志2020年第32卷第4期ChinJSchistoControl2020,Vol.32,No.4間逐漸延長(zhǎng)(K值依次為6732、3837、1075、116)。本次實(shí)驗(yàn)最低可檢測(cè)到含有10拷貝/μL重組質(zhì)粒的熒光信號(hào)(圖3)。采用熒光RAA法檢測(cè)不同濃度細(xì)粒棘球絳蟲(chóng)基因組DNA樣本。結(jié)果顯示,除陰性對(duì)照外,濃度分別為10、1、0.1ng/μL的細(xì)粒棘球絳蟲(chóng)基因組DNA樣本均出現(xiàn)陽(yáng)性擴(kuò)增(K值分別為7186、1675、296),檢測(cè)敏感性可達(dá)0.1ng/μL基因組DNA(圖4)。圖3以不同拷貝數(shù)重組質(zhì)粒為模板的熒光RAA法檢測(cè)敏感性FigFig.3SensitivityoffluorescentRAAassayusingvariouscopynumbersofrecombinantplasmidsastemplates圖4以不同濃度細(xì)粒棘球絳蟲(chóng)基因組DNA為模板的熒光RAA法檢測(cè)敏感性FigFig.4SensitivityoffluorescentRAAassayusingdifferentconcentrationsofEE.granulosusgenomicDNAsamplesastemplates4熒光RAA法檢測(cè)特異性分別以細(xì)粒棘球絳蟲(chóng)包囊、多房棘球絳蟲(chóng)幼蟲(chóng)、日本血吸蟲(chóng)蟲(chóng)卵、曼氏血吸蟲(chóng)蟲(chóng)卵、十二指腸鉤蚴培養(yǎng)物、華支睪吸蟲(chóng)囊蚴、牛帶絳蟲(chóng)孕節(jié)、曼氏迭宮絳蟲(chóng)孕節(jié)、豬帶絳蟲(chóng)孕節(jié)基因組DNA為模板進(jìn)行熒光RAA擴(kuò)增,結(jié)果顯示,細(xì)粒棘球絳蟲(chóng)包囊DNA存在陽(yáng)性擴(kuò)增(K值為657),其他樣本擴(kuò)增結(jié)果均為陰性(圖5)。圖5熒光RAA法檢測(cè)特異性Figig.5SpecificityoffluorescentRAAassay討論棘球蚴病在我國(guó)中西北部地區(qū)仍存在較大范圍流行,嚴(yán)重威脅著流行區(qū)人民群眾身體健康和生活水平[13];同時(shí),隨著西部牛羊等大量流入東部地區(qū),也給當(dāng)?shù)貛?lái)了一定的棘球蚴病傳播風(fēng)險(xiǎn)[14]

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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本文編號(hào):3224784

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